RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000310418.8

CLTB-201, Transcript of clathrin light chain B, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLTB, Length 1,215 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTB-201ENST00000310418 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa37.07■■■■□ 3.52
CLTB-201ENST00000310418 POGZQ7Z3K3 1410 aa37.06■■■■□ 3.52
CLTB-201ENST00000310418 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa37.06■■■■□ 3.52
CLTB-201ENST00000310418 MADDQ8WXG6 1647 aa37.06■■■■□ 3.52
CLTB-201ENST00000310418 MAGI2Q86UL8 1455 aa37.06■■■■□ 3.52
CLTB-201ENST00000310418 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP37.05■■■■□ 3.52
CLTB-201ENST00000310418 YEATS2Q9ULM3 1422 aa37.05■■■■□ 3.52
CLTB-201ENST00000310418 CCDC18Q5T9S5 1454 aa37.01■■■■□ 3.51
CLTB-201ENST00000310418 ARHGAP5Q13017 1502 aa36.98■■■■□ 3.51
CLTB-201ENST00000310418 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa36.94■■■■□ 3.5
CLTB-201ENST00000310418 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP36.93■■■■□ 3.5
CLTB-201ENST00000310418 FYCO1Q9BQS8 1478 aa36.91■■■■□ 3.5
CLTB-201ENST00000310418 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa36.88■■■■□ 3.49
CLTB-201ENST00000310418 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa36.87■■■■□ 3.49
CLTB-201ENST00000310418 ATP10AO60312 1499 aa36.86■■■■□ 3.49
CLTB-201ENST00000310418 PREX2Q70Z35 1606 aa36.84■■■■□ 3.49
CLTB-201ENST00000310418 MLECQ14165 292 aa36.82■■■■□ 3.48
CLTB-201ENST00000310418 AFAP1Q8N556 730 aa36.82■■■■□ 3.48
CLTB-201ENST00000310418 C9orf84Q5VXU9 1444 aa36.82■■■■□ 3.48
CLTB-201ENST00000310418 KDM5CP41229 1560 aa36.81■■■■□ 3.48
CLTB-201ENST00000310418 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP36.78■■■■□ 3.48
CLTB-201ENST00000310418 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa36.74■■■■□ 3.47
CLTB-201ENST00000310418 PLPPR3Q6T4P5 718 aa36.74■■■■□ 3.47
CLTB-201ENST00000310418 MYT1LQ9UL68 1186 aa36.74■■■■□ 3.47
CLTB-201ENST00000310418 LMTK3Q96Q04 1460 aa36.74■■■■□ 3.47
CLTB-201ENST00000310418 ABCC1P33527 1531 aa36.74■■■■□ 3.47
CLTB-201ENST00000310418 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa36.73■■■■□ 3.47
CLTB-201ENST00000310418 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa36.7■■■■□ 3.47
CLTB-201ENST00000310418 ITSN2Q9NZM3 1697 aa36.69■■■■□ 3.46
CLTB-201ENST00000310418 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa36.68■■■■□ 3.46
CLTB-201ENST00000310418 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa36.68■■■■□ 3.46
CLTB-201ENST00000310418 MLH3Q9UHC1 1453 aa36.68■■■■□ 3.46
CLTB-201ENST00000310418 ABCA6Q8N139 1617 aa36.63■■■■□ 3.45
CLTB-201ENST00000310418 REREQ9P2R6 1566 aa36.61■■■■□ 3.45
CLTB-201ENST00000310418 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP36.61■■■■□ 3.45
CLTB-201ENST00000310418 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP36.6■■■■□ 3.45
CLTB-201ENST00000310418 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa36.57■■■■□ 3.44
CLTB-201ENST00000310418 CEP162Q5TB80 1403 aa36.55■■■■□ 3.44
CLTB-201ENST00000310418 MTUS2Q5JR59 1369 aa36.54■■■■□ 3.44
CLTB-201ENST00000310418 HSPA2P54652 639 aa36.54■■■■□ 3.44
CLTB-201ENST00000310418 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa36.53■■■■□ 3.44
CLTB-201ENST00000310418 SYCP2Q9BX26 1530 aa36.51■■■■□ 3.44
CLTB-201ENST00000310418 CCNB3Q8WWL7 1395 aa36.51■■■■□ 3.43
CLTB-201ENST00000310418 AGLP35573 1532 aa36.49■■■■□ 3.43
CLTB-201ENST00000310418 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP36.49■■■■□ 3.43
CLTB-201ENST00000310418 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP36.49■■■■□ 3.43
CLTB-201ENST00000310418 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP36.47■■■■□ 3.43
CLTB-201ENST00000310418 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa36.44■■■■□ 3.42
CLTB-201ENST00000310418 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa36.43■■■■□ 3.42
CLTB-201ENST00000310418 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa36.43■■■■□ 3.42
CLTB-201ENST00000310418 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP36.42■■■■□ 3.42
CLTB-201ENST00000310418 PREX1Q8TCU6 1659 aa36.42■■■■□ 3.42
CLTB-201ENST00000310418 TIAM1Q13009 1591 aa36.38■■■■□ 3.41
CLTB-201ENST00000310418 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP36.38■■■■□ 3.41
CLTB-201ENST00000310418 ATP7AQ04656 1500 aa36.34■■■■□ 3.41
CLTB-201ENST00000310418 C3P01024 1663 aa36.33■■■■□ 3.41
CLTB-201ENST00000310418 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP36.32■■■■□ 3.4
CLTB-201ENST00000310418 FBXO41Q8TF61 875 aa36.31■■■■□ 3.4
CLTB-201ENST00000310418 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa36.29■■■■□ 3.4
CLTB-201ENST00000310418 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP36.29■■■■□ 3.4
CLTB-201ENST00000310418 CNTLNQ9NXG0 1405 aa36.28■■■■□ 3.4
CLTB-201ENST00000310418 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP36.27■■■■□ 3.4
CLTB-201ENST00000310418 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP36.27■■■■□ 3.4
CLTB-201ENST00000310418 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.26■■■■□ 3.4
CLTB-201ENST00000310418 A2MP01023 1474 aa36.24■■■■□ 3.39
CLTB-201ENST00000310418 PLXNC1O60486 1568 aa36.23■■■■□ 3.39
CLTB-201ENST00000310418 MBD5Q9P267 1494 aa36.22■■■■□ 3.39
CLTB-201ENST00000310418 NCOA2Q15596 1464 aa36.21■■■■□ 3.39
CLTB-201ENST00000310418 VPS8Q8N3P4 1428 aa36.17■■■■□ 3.38
CLTB-201ENST00000310418 MROH2AA6NES4 1674 aa36.16■■■■□ 3.38
CLTB-201ENST00000310418 ADGBQ8N7X0 1667 aa36.16■■■■□ 3.38
CLTB-201ENST00000310418 STRCQ7RTU9 1775 aa36.13■■■■□ 3.37
CLTB-201ENST00000310418 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa36.12■■■■□ 3.37
CLTB-201ENST00000310418 ZMYM3Q14202 1370 aa36.12■■■■□ 3.37
CLTB-201ENST00000310418 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa36.1■■■■□ 3.37
CLTB-201ENST00000310418 GGT6Q6P531 493 aa36.09■■■■□ 3.37
CLTB-201ENST00000310418 DMRT2Q9Y5R5 561 aa36.09■■■■□ 3.37
CLTB-201ENST00000310418 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP36.09■■■■□ 3.37
CLTB-201ENST00000310418 NPATQ14207 1427 aa36.08■■■■□ 3.37
CLTB-201ENST00000310418 CCDC141Q6ZP82 1450 aa36.06■■■■□ 3.36
CLTB-201ENST00000310418 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa36.06■■■■□ 3.36
CLTB-201ENST00000310418 CERKQ8TCT0 537 aa36.04■■■■□ 3.36
CLTB-201ENST00000310418 RSPH4AQ5TD94 716 aa36.02■■■■□ 3.36
CLTB-201ENST00000310418 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP36.02■■■■□ 3.36
CLTB-201ENST00000310418 PPP6R1Q9UPN7 881 aa36.01■■■■□ 3.36
CLTB-201ENST00000310418 MAP3K1Q13233 1512 aa35.96■■■■□ 3.35
CLTB-201ENST00000310418 ARHGEF5Q12774 1597 aa35.96■■■■□ 3.35
CLTB-201ENST00000310418 PTPRTO14522 1441 aa35.95■■■■□ 3.35
CLTB-201ENST00000310418 PTPRKQ15262 1439 aa35.94■■■■□ 3.34
CLTB-201ENST00000310418 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP35.94■■■■□ 3.34
CLTB-201ENST00000310418 NCOA1Q15788 1441 aa35.93■■■■□ 3.34
CLTB-201ENST00000310418 KIF3BO15066 747 aa35.9■■■■□ 3.34
CLTB-201ENST00000310418 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa35.9■■■■□ 3.34
CLTB-201ENST00000310418 TSPY4P0CV99 314 aa35.89■■■■□ 3.34
CLTB-201ENST00000310418 TSPY10P0CW01 314 aa35.89■■■■□ 3.34
CLTB-201ENST00000310418 MYO3AQ8NEV4 1616 aa35.89■■■■□ 3.34
CLTB-201ENST00000310418 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP35.85■■■■□ 3.33
CLTB-201ENST00000310418 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP35.82■■■■□ 3.32
CLTB-201ENST00000310418 MYOM3Q5VTT5 1437 aa35.82■■■■□ 3.32
CLTB-201ENST00000310418 MIA2Q96PC5 1412 aa35.8■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.1 ms