RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301021.7

TRAPPC2L-201, Transcript of trafficking protein particle complex 2 like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC2L, Length 2,215 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ARID3CA6NKF2 412 aa24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC2L-201ENST00000301021 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC2L-201ENST00000301021 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZBED9Q6R2W3 1325 aa24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NCOA2Q15596 1464 aa24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC2L-201ENST00000301021 WASHC2AQ641Q2 1341 aa24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.47
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SHROOM2Q13796 1616 aa24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC2L-201ENST00000301021 IL27Q8NEV9 243 aa24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ARHGEF11O15085 1522 aa24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC2L-201ENST00000301021 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ABCA8O94911 1581 aa24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PTPRGP23470 1445 aa24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC2L-201ENST00000301021 UACAQ9BZF9 1416 aa24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC2L-201ENST00000301021 USP35Q9P2H5 1018 aa24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC2L-201ENST00000301021 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CCDC136Q96JN2 1154 aa24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CCDC184Q52MB2 194 aa24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RNF123Q5XPI4 1314 aa24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ATP10BO94823 1461 aa24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC2L-201ENST00000301021 HFM1A2PYH4 1435 aa24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC2L-201ENST00000301021 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC2L-201ENST00000301021 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.08■■□□□ 1.44
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FAM9BQ8IZU0 186 aa24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MRS2Q9HD23 443 aa24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PTPRKQ15262 1439 aa24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MIA2Q96PC5 1412 aa24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC2L-201ENST00000301021 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NCOA1Q15788 1441 aa24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC2L-201ENST00000301021 AKNAQ7Z591 1439 aa24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KIF14Q15058 1648 aa24■■□□□ 1.43
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NUDCQ9Y266 331 aa23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CCDC7Q96M83 1385 aa23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NEFMP07197 916 aa23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC2L-201ENST00000301021 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ABCC2Q92887 1545 aa23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NAIPQ13075 1403 aa23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC2L-201ENST00000301021 OSCARQ8IYS5 282 aa23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.89■■□□□ 1.42
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC2L-201ENST00000301021 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC2L-201ENST00000301021 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DAPK1P53355 1430 aa23.83■■□□□ 1.4
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.83■■□□□ 1.4
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ABCC5O15440 1437 aa23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MS4A1P11836 297 aa23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GSE1Q14687 1217 aa23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PDE4AP27815 886 aa23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC2L-201ENST00000301021 BACH2Q9BYV9 841 aa23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC2L-201ENST00000301021 BRPF3Q9ULD4 1205 aa23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KIF7Q2M1P5 1343 aa23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DDRGK1Q96HY6 314 aa23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ROCK1Q13464 1354 aa23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RSPH6AQ9H0K4 717 aa23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TTC37Q6PGP7 1564 aa23.7■■□□□ 1.39
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC2L-201ENST00000301021 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KDM6BO15054 1643 aa23.69■■□□□ 1.38
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