RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa31.28■■■□□ 2.6
PACSIN3-201ENST00000298838 ARHGAP5Q13017 1502 aa31.25■■■□□ 2.59
PACSIN3-201ENST00000298838 PLCH2O75038 1416 aa31.23■■■□□ 2.59
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP31.22■■■□□ 2.59
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP31.22■■■□□ 2.59
PACSIN3-201ENST00000298838 ARAP3Q8WWN8 1544 aa31.21■■■□□ 2.59
PACSIN3-201ENST00000298838 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP31.2■■■□□ 2.58
PACSIN3-201ENST00000298838 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa31.18■■■□□ 2.58
PACSIN3-201ENST00000298838 DAPK1P53355 1430 aa31.14■■■□□ 2.57
PACSIN3-201ENST00000298838 PTPRKQ15262 1439 aa31.13■■■□□ 2.57
PACSIN3-201ENST00000298838 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa31.11■■■□□ 2.57
PACSIN3-201ENST00000298838 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.11■■■□□ 2.57
PACSIN3-201ENST00000298838 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa31.11■■■□□ 2.57
PACSIN3-201ENST00000298838 ABCC5O15440 1437 aa31.1■■■□□ 2.57
PACSIN3-201ENST00000298838 GLI2P10070 1586 aa31.09■■■□□ 2.57
PACSIN3-201ENST00000298838 CROCC2H7BZ55 1655 aa31.09■■■□□ 2.57
PACSIN3-201ENST00000298838 ARHGEF5Q12774 1597 aa31.08■■■□□ 2.57
PACSIN3-201ENST00000298838 CD109Q6YHK3 1445 aa31.07■■■□□ 2.56
PACSIN3-201ENST00000298838 DIP2BQ9P265 1576 aa31.07■■■□□ 2.56
PACSIN3-201ENST00000298838 FANCAO15360 1455 aa31.06■■■□□ 2.56
PACSIN3-201ENST00000298838 SYCP2Q9BX26 1530 aa31.06■■■□□ 2.56
PACSIN3-201ENST00000298838 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa31.05■■■□□ 2.56
PACSIN3-201ENST00000298838 MBD5Q9P267 1494 aa31.04■■■□□ 2.56
PACSIN3-201ENST00000298838 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa31.04■■■□□ 2.56
PACSIN3-201ENST00000298838 ABCC1P33527 1531 aa31.03■■■□□ 2.56
PACSIN3-201ENST00000298838 CFAP74Q9C0B2 1584 aa31.02■■■□□ 2.56
PACSIN3-201ENST00000298838 AKNAQ7Z591 1439 aa31■■■□□ 2.55
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC141Q6ZP82 1450 aa31■■■□□ 2.55
PACSIN3-201ENST00000298838 SHANK2Q9UPX8 1470 aa31■■■□□ 2.55
PACSIN3-201ENST00000298838 HFM1A2PYH4 1435 aa31■■■□□ 2.55
PACSIN3-201ENST00000298838 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP31■■■□□ 2.55
PACSIN3-201ENST00000298838 SETD5Q9C0A6 1442 aa31■■■□□ 2.55
PACSIN3-201ENST00000298838 ADGBQ8N7X0 1667 aa30.99■■■□□ 2.55
PACSIN3-201ENST00000298838 RSPH4AQ5TD94 716 aa30.99■■■□□ 2.55
PACSIN3-201ENST00000298838 CHIC2Q9UKJ5 165 aa30.98■■■□□ 2.55
PACSIN3-201ENST00000298838 ROCK1Q13464 1354 aa30.97■■■□□ 2.55
PACSIN3-201ENST00000298838 GCC2Q8IWJ2 1684 aa30.96■■■□□ 2.55
PACSIN3-201ENST00000298838 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa30.95■■■□□ 2.55
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM69CQ0P6D2 419 aa30.95■■■□□ 2.55
PACSIN3-201ENST00000298838 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa30.93■■■□□ 2.54
PACSIN3-201ENST00000298838 NAIPQ13075 1403 aa30.93■■■□□ 2.54
PACSIN3-201ENST00000298838 C9orf84Q5VXU9 1444 aa30.93■■■□□ 2.54
PACSIN3-201ENST00000298838 ADGRL1O94910 1474 aa30.93■■■□□ 2.54
PACSIN3-201ENST00000298838 ADGRL2O95490 1459 aa30.93■■■□□ 2.54
PACSIN3-201ENST00000298838 TSPY4P0CV99 314 aa30.92■■■□□ 2.54
PACSIN3-201ENST00000298838 TSPY10P0CW01 314 aa30.92■■■□□ 2.54
PACSIN3-201ENST00000298838 KIF13AQ9H1H9 1805 aa30.91■■■□□ 2.54
PACSIN3-201ENST00000298838 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa30.89■■■□□ 2.54
PACSIN3-201ENST00000298838 NEO1Q92859 1461 aa30.89■■■□□ 2.54
PACSIN3-201ENST00000298838 MAST1Q9Y2H9 1570 aa30.88■■■□□ 2.53
PACSIN3-201ENST00000298838 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa30.88■■■□□ 2.53
PACSIN3-201ENST00000298838 NCOA1Q15788 1441 aa30.86■■■□□ 2.53
PACSIN3-201ENST00000298838 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa30.85■■■□□ 2.53
PACSIN3-201ENST00000298838 SCAPERQ9BY12 1400 aa30.85■■■□□ 2.53
PACSIN3-201ENST00000298838 HRCP23327 699 aa30.83■■■□□ 2.53
PACSIN3-201ENST00000298838 TSPOAP1O95153 1857 aa30.81■■■□□ 2.52
PACSIN3-201ENST00000298838 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP30.8■■■□□ 2.52
PACSIN3-201ENST00000298838 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP30.8■■■□□ 2.52
PACSIN3-201ENST00000298838 TEX14Q8IWB6 1497 aa30.79■■■□□ 2.52
PACSIN3-201ENST00000298838 PLXNC1O60486 1568 aa30.77■■■□□ 2.52
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa30.76■■■□□ 2.52
PACSIN3-201ENST00000298838 AFAP1Q8N556 730 aa30.75■■■□□ 2.51
PACSIN3-201ENST00000298838 KIF15Q9NS87 1388 aa30.74■■■□□ 2.51
PACSIN3-201ENST00000298838 POGZQ7Z3K3 1410 aa30.74■■■□□ 2.51
PACSIN3-201ENST00000298838 KDM6BO15054 1643 aa30.74■■■□□ 2.51
PACSIN3-201ENST00000298838 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa30.73■■■□□ 2.51
PACSIN3-201ENST00000298838 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa30.72■■■□□ 2.51
PACSIN3-201ENST00000298838 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP30.72■■■□□ 2.51
PACSIN3-201ENST00000298838 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP30.72■■■□□ 2.51
PACSIN3-201ENST00000298838 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP30.7■■■□□ 2.51
PACSIN3-201ENST00000298838 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP30.7■■■□□ 2.5
PACSIN3-201ENST00000298838 KDM5CP41229 1560 aa30.69■■■□□ 2.5
PACSIN3-201ENST00000298838 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa30.69■■■□□ 2.5
PACSIN3-201ENST00000298838 ATP7AQ04656 1500 aa30.69■■■□□ 2.5
PACSIN3-201ENST00000298838 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP30.67■■■□□ 2.5
PACSIN3-201ENST00000298838 RICTORQ6R327 1708 aa30.64■■■□□ 2.5
PACSIN3-201ENST00000298838 DUOX2Q9NRD8 1548 aa30.63■■■□□ 2.49
PACSIN3-201ENST00000298838 HECW2Q9P2P5 1572 aa30.62■■■□□ 2.49
PACSIN3-201ENST00000298838 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa30.61■■■□□ 2.49
PACSIN3-201ENST00000298838 MLH3Q9UHC1 1453 aa30.59■■■□□ 2.49
PACSIN3-201ENST00000298838 MYT1LQ9UL68 1186 aa30.59■■■□□ 2.49
PACSIN3-201ENST00000298838 ERBINQ96RT1 1412 aa30.57■■■□□ 2.48
PACSIN3-201ENST00000298838 RAPGEF3O95398 923 aa30.57■■■□□ 2.48
PACSIN3-201ENST00000298838 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa30.56■■■□□ 2.48
PACSIN3-201ENST00000298838 TRIM52Q96A61 297 aa30.56■■■□□ 2.48
PACSIN3-201ENST00000298838 CLSPNQ9HAW4 1339 aa30.55■■■□□ 2.48
PACSIN3-201ENST00000298838 TRHP20396 242 aaPredicted RBP30.53■■■□□ 2.48
PACSIN3-201ENST00000298838 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP30.52■■■□□ 2.48
PACSIN3-201ENST00000298838 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa30.51■■■□□ 2.48
PACSIN3-201ENST00000298838 ABCA6Q8N139 1617 aa30.47■■■□□ 2.47
PACSIN3-201ENST00000298838 UNC13BO14795 1591 aa30.46■■■□□ 2.47
PACSIN3-201ENST00000298838 KDM5DQ9BY66 1539 aa30.45■■■□□ 2.46
PACSIN3-201ENST00000298838 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
PACSIN3-201ENST00000298838 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
PACSIN3-201ENST00000298838 A2MP01023 1474 aa30.42■■■□□ 2.46
PACSIN3-201ENST00000298838 MAGI2Q86UL8 1455 aa30.42■■■□□ 2.46
PACSIN3-201ENST00000298838 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa30.42■■■□□ 2.46
PACSIN3-201ENST00000298838 MPHOSPH9Q99550 1183 aa30.41■■■□□ 2.46
PACSIN3-201ENST00000298838 PZPP20742 1482 aa30.41■■■□□ 2.46
PACSIN3-201ENST00000298838 NUP155O75694 1391 aa30.4■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93.1 ms