RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291592.5

LRRC3-201, Transcript of leucine rich repeat containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRC3, Length 5,869 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3-201ENST00000291592 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa21.34■■□□□ 1.01
LRRC3-201ENST00000291592 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
LRRC3-201ENST00000291592 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
LRRC3-201ENST00000291592 HSCBQ8IWL3 235 aa21.33■■□□□ 1
LRRC3-201ENST00000291592 DEKP35659 375 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
LRRC3-201ENST00000291592 KCNJ4P48050 445 aa21.32■■□□□ 1
LRRC3-201ENST00000291592 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.32■■□□□ 1
LRRC3-201ENST00000291592 PKD2Q13563 968 aa21.31■■□□□ 1
LRRC3-201ENST00000291592 FOXD1Q16676 465 aa21.31■■□□□ 1
LRRC3-201ENST00000291592 NUDCQ9Y266 331 aa21.31■■□□□ 1
LRRC3-201ENST00000291592 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa21.31■■□□□ 1
LRRC3-201ENST00000291592 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
LRRC3-201ENST00000291592 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.31■■□□□ 1
LRRC3-201ENST00000291592 TMF1P82094 1093 aa21.31■■□□□ 1
LRRC3-201ENST00000291592 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
LRRC3-201ENST00000291592 MS4A1P11836 297 aa21.3■■□□□ 1
LRRC3-201ENST00000291592 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
LRRC3-201ENST00000291592 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
LRRC3-201ENST00000291592 DRC7Q8IY82 874 aa21.26■□□□□ 0.99
LRRC3-201ENST00000291592 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.24■□□□□ 0.99
LRRC3-201ENST00000291592 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.23■□□□□ 0.99
LRRC3-201ENST00000291592 MLECQ14165 292 aa21.23■□□□□ 0.99
LRRC3-201ENST00000291592 GGT6Q6P531 493 aa21.21■□□□□ 0.99
LRRC3-201ENST00000291592 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa21.21■□□□□ 0.99
LRRC3-201ENST00000291592 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa21.2■□□□□ 0.99
LRRC3-201ENST00000291592 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.2■□□□□ 0.98
LRRC3-201ENST00000291592 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
LRRC3-201ENST00000291592 NUP155O75694 1391 aa21.19■□□□□ 0.98
LRRC3-201ENST00000291592 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.19■□□□□ 0.98
LRRC3-201ENST00000291592 MCCP23508 829 aa21.18■□□□□ 0.98
LRRC3-201ENST00000291592 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
LRRC3-201ENST00000291592 CCER2I3L3R5 266 aa21.16■□□□□ 0.98
LRRC3-201ENST00000291592 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
LRRC3-201ENST00000291592 NPHP1O15259 732 aa21.14■□□□□ 0.98
LRRC3-201ENST00000291592 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
LRRC3-201ENST00000291592 GOLGA2Q08379 1002 aa21.13■□□□□ 0.97
LRRC3-201ENST00000291592 LMOD2Q6P5Q4 547 aa21.13■□□□□ 0.97
LRRC3-201ENST00000291592 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
LRRC3-201ENST00000291592 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.13■□□□□ 0.97
LRRC3-201ENST00000291592 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP21.12■□□□□ 0.97
LRRC3-201ENST00000291592 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.12■□□□□ 0.97
LRRC3-201ENST00000291592 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
LRRC3-201ENST00000291592 HDGFP51858 240 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
LRRC3-201ENST00000291592 JPH4Q96JJ6 628 aa21.11■□□□□ 0.97
LRRC3-201ENST00000291592 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
LRRC3-201ENST00000291592 KIAA2012Q0VF49 1180 aa21.1■□□□□ 0.97
LRRC3-201ENST00000291592 CLSTN1O94985 981 aa21.09■□□□□ 0.97
LRRC3-201ENST00000291592 CFAP44Q96MT7 982 aa21.09■□□□□ 0.97
LRRC3-201ENST00000291592 MORC1Q86VD1 984 aa21.08■□□□□ 0.97
LRRC3-201ENST00000291592 ARID3AQ99856 593 aa21.08■□□□□ 0.97
LRRC3-201ENST00000291592 GBP4Q96PP9 640 aa21.07■□□□□ 0.96
LRRC3-201ENST00000291592 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
LRRC3-201ENST00000291592 STK26Q9P289 416 aa21.06■□□□□ 0.96
LRRC3-201ENST00000291592 PTMSP20962 102 aa21.06■□□□□ 0.96
LRRC3-201ENST00000291592 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
LRRC3-201ENST00000291592 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.04■□□□□ 0.96
LRRC3-201ENST00000291592 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
LRRC3-201ENST00000291592 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
LRRC3-201ENST00000291592 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
LRRC3-201ENST00000291592 KIF3BO15066 747 aa21.03■□□□□ 0.96
LRRC3-201ENST00000291592 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.02■□□□□ 0.96
LRRC3-201ENST00000291592 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.01■□□□□ 0.95
LRRC3-201ENST00000291592 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.01■□□□□ 0.95
LRRC3-201ENST00000291592 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
LRRC3-201ENST00000291592 SOX12O15370 315 aa20.99■□□□□ 0.95
LRRC3-201ENST00000291592 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
LRRC3-201ENST00000291592 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa20.98■□□□□ 0.95
LRRC3-201ENST00000291592 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
LRRC3-201ENST00000291592 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
LRRC3-201ENST00000291592 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
LRRC3-201ENST00000291592 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
LRRC3-201ENST00000291592 APBB1O00213 710 aa20.95■□□□□ 0.94
LRRC3-201ENST00000291592 IGF1RP08069 1367 aa20.95■□□□□ 0.94
LRRC3-201ENST00000291592 RALBP1Q15311 655 aa20.94■□□□□ 0.94
LRRC3-201ENST00000291592 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
LRRC3-201ENST00000291592 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.93■□□□□ 0.94
LRRC3-201ENST00000291592 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.93■□□□□ 0.94
LRRC3-201ENST00000291592 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
LRRC3-201ENST00000291592 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa20.92■□□□□ 0.94
LRRC3-201ENST00000291592 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
LRRC3-201ENST00000291592 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
LRRC3-201ENST00000291592 PTPRGP23470 1445 aa20.9■□□□□ 0.94
LRRC3-201ENST00000291592 NCAPD3P42695 1498 aa20.89■□□□□ 0.93
LRRC3-201ENST00000291592 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
LRRC3-201ENST00000291592 TPM4P67936 248 aa20.89■□□□□ 0.93
LRRC3-201ENST00000291592 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa20.88■□□□□ 0.93
LRRC3-201ENST00000291592 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
LRRC3-201ENST00000291592 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa20.87■□□□□ 0.93
LRRC3-201ENST00000291592 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
LRRC3-201ENST00000291592 RCAN3Q9UKA8 241 aa20.84■□□□□ 0.93
LRRC3-201ENST00000291592 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
LRRC3-201ENST00000291592 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
LRRC3-201ENST00000291592 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP20.84■□□□□ 0.93
LRRC3-201ENST00000291592 ITPRIPQ8IWB1 547 aa20.83■□□□□ 0.93
LRRC3-201ENST00000291592 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.92
LRRC3-201ENST00000291592 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
LRRC3-201ENST00000291592 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
LRRC3-201ENST00000291592 CCDC144AA2RUR9 1427 aa20.81■□□□□ 0.92
LRRC3-201ENST00000291592 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
LRRC3-201ENST00000291592 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
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