RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000287543.4

MALSU1-201, Transcript of mitochondrial assembly of ribosomal large subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene MALSU1, Length 572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1-201ENST00000287543 MTUS2Q5JR59 1369 aa30.14■■■□□ 2.41
MALSU1-201ENST00000287543 MYO5CQ9NQX4 1742 aa30.11■■■□□ 2.41
MALSU1-201ENST00000287543 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
MALSU1-201ENST00000287543 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa30.1■■■□□ 2.41
MALSU1-201ENST00000287543 RICTORQ6R327 1708 aa30.06■■■□□ 2.4
MALSU1-201ENST00000287543 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa30.06■■■□□ 2.4
MALSU1-201ENST00000287543 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa30.04■■■□□ 2.4
MALSU1-201ENST00000287543 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa30.03■■■□□ 2.4
MALSU1-201ENST00000287543 AFAP1Q8N556 730 aa30.03■■■□□ 2.4
MALSU1-201ENST00000287543 CCNB3Q8WWL7 1395 aa30.03■■■□□ 2.4
MALSU1-201ENST00000287543 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP30.01■■■□□ 2.39
MALSU1-201ENST00000287543 VPS8Q8N3P4 1428 aa30.01■■■□□ 2.39
MALSU1-201ENST00000287543 YEATS2Q9ULM3 1422 aa30■■■□□ 2.39
MALSU1-201ENST00000287543 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
MALSU1-201ENST00000287543 MYT1LQ9UL68 1186 aa29.99■■■□□ 2.39
MALSU1-201ENST00000287543 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
MALSU1-201ENST00000287543 PREX2Q70Z35 1606 aa29.97■■■□□ 2.39
MALSU1-201ENST00000287543 ATP10AO60312 1499 aa29.95■■■□□ 2.39
MALSU1-201ENST00000287543 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.95■■■□□ 2.38
MALSU1-201ENST00000287543 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa29.92■■■□□ 2.38
MALSU1-201ENST00000287543 ABCC1P33527 1531 aa29.91■■■□□ 2.38
MALSU1-201ENST00000287543 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.91■■■□□ 2.38
MALSU1-201ENST00000287543 MLH3Q9UHC1 1453 aa29.91■■■□□ 2.38
MALSU1-201ENST00000287543 KDM5CP41229 1560 aa29.9■■■□□ 2.38
MALSU1-201ENST00000287543 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.9■■■□□ 2.38
MALSU1-201ENST00000287543 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.9■■■□□ 2.38
MALSU1-201ENST00000287543 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa29.9■■■□□ 2.38
MALSU1-201ENST00000287543 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29.89■■■□□ 2.38
MALSU1-201ENST00000287543 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP29.86■■■□□ 2.374e-7■■□□□ 14
MALSU1-201ENST00000287543 ADAMTSL3P82987 1691 aa29.85■■■□□ 2.37
MALSU1-201ENST00000287543 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.85■■■□□ 2.37
MALSU1-201ENST00000287543 PTPRMP28827 1452 aa29.84■■■□□ 2.37
MALSU1-201ENST00000287543 BCORL1Q5H9F3 1711 aa29.83■■■□□ 2.37
MALSU1-201ENST00000287543 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
MALSU1-201ENST00000287543 APLP2Q06481 763 aa29.82■■■□□ 2.36
MALSU1-201ENST00000287543 TIAM1Q13009 1591 aa29.81■■■□□ 2.36
MALSU1-201ENST00000287543 MAP3K1Q13233 1512 aa29.81■■■□□ 2.36
MALSU1-201ENST00000287543 MLECQ14165 292 aa29.81■■■□□ 2.36
MALSU1-201ENST00000287543 HECW2Q9P2P5 1572 aa29.81■■■□□ 2.36
MALSU1-201ENST00000287543 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa29.79■■■□□ 2.36
MALSU1-201ENST00000287543 NCOA2Q15596 1464 aa29.79■■■□□ 2.36
MALSU1-201ENST00000287543 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.78■■■□□ 2.36
MALSU1-201ENST00000287543 RSPH4AQ5TD94 716 aa29.76■■■□□ 2.35
MALSU1-201ENST00000287543 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.76■■■□□ 2.35
MALSU1-201ENST00000287543 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.76■■■□□ 2.35
MALSU1-201ENST00000287543 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
MALSU1-201ENST00000287543 REREQ9P2R6 1566 aa29.73■■■□□ 2.35
MALSU1-201ENST00000287543 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa29.72■■■□□ 2.35
MALSU1-201ENST00000287543 MADDQ8WXG6 1647 aa29.71■■■□□ 2.35
MALSU1-201ENST00000287543 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP29.71■■■□□ 2.35
MALSU1-201ENST00000287543 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
MALSU1-201ENST00000287543 AGLP35573 1532 aa29.68■■■□□ 2.34
MALSU1-201ENST00000287543 MBD5Q9P267 1494 aa29.67■■■□□ 2.34
MALSU1-201ENST00000287543 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
MALSU1-201ENST00000287543 ABCA6Q8N139 1617 aa29.63■■■□□ 2.33
MALSU1-201ENST00000287543 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa29.63■■■□□ 2.33
MALSU1-201ENST00000287543 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa29.62■■■□□ 2.33
MALSU1-201ENST00000287543 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa29.62■■■□□ 2.33
MALSU1-201ENST00000287543 ATP7AQ04656 1500 aa29.61■■■□□ 2.33
MALSU1-201ENST00000287543 TSPY4P0CV99 314 aa29.59■■■□□ 2.33
MALSU1-201ENST00000287543 TSPY10P0CW01 314 aa29.59■■■□□ 2.33
MALSU1-201ENST00000287543 PLPPR3Q6T4P5 718 aa29.59■■■□□ 2.33
MALSU1-201ENST00000287543 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
MALSU1-201ENST00000287543 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.58■■■□□ 2.33
MALSU1-201ENST00000287543 MIA2Q96PC5 1412 aa29.58■■■□□ 2.33
MALSU1-201ENST00000287543 CCDC141Q6ZP82 1450 aa29.57■■■□□ 2.32
MALSU1-201ENST00000287543 A2MP01023 1474 aa29.56■■■□□ 2.32
MALSU1-201ENST00000287543 MYOM3Q5VTT5 1437 aa29.54■■■□□ 2.32
MALSU1-201ENST00000287543 CNTLNQ9NXG0 1405 aa29.54■■■□□ 2.32
MALSU1-201ENST00000287543 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
MALSU1-201ENST00000287543 PPP6R1Q9UPN7 881 aa29.53■■■□□ 2.32
MALSU1-201ENST00000287543 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
MALSU1-201ENST00000287543 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa29.49■■■□□ 2.31
MALSU1-201ENST00000287543 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
MALSU1-201ENST00000287543 ARHGEF5Q12774 1597 aa29.46■■■□□ 2.31
MALSU1-201ENST00000287543 LMTK3Q96Q04 1460 aa29.45■■■□□ 2.31
MALSU1-201ENST00000287543 GGT6Q6P531 493 aa29.45■■■□□ 2.31
MALSU1-201ENST00000287543 PLXNC1O60486 1568 aa29.44■■■□□ 2.3
MALSU1-201ENST00000287543 KIF3BO15066 747 aa29.38■■■□□ 2.29
MALSU1-201ENST00000287543 ZMYM3Q14202 1370 aa29.38■■■□□ 2.29
MALSU1-201ENST00000287543 ADGBQ8N7X0 1667 aa29.37■■■□□ 2.29
MALSU1-201ENST00000287543 HSPA2P54652 639 aa29.34■■■□□ 2.29
MALSU1-201ENST00000287543 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa29.34■■■□□ 2.29
MALSU1-201ENST00000287543 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.33■■■□□ 2.29
MALSU1-201ENST00000287543 NPATQ14207 1427 aa29.31■■■□□ 2.28
MALSU1-201ENST00000287543 MAST1Q9Y2H9 1570 aa29.3■■■□□ 2.28
MALSU1-201ENST00000287543 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
MALSU1-201ENST00000287543 ABCC5O15440 1437 aa29.26■■■□□ 2.27
MALSU1-201ENST00000287543 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa29.25■■■□□ 2.27
MALSU1-201ENST00000287543 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.24■■■□□ 2.27
MALSU1-201ENST00000287543 SHANK2Q9UPX8 1470 aa29.23■■■□□ 2.27
MALSU1-201ENST00000287543 MROH2AA6NES4 1674 aa29.23■■■□□ 2.27
MALSU1-201ENST00000287543 C3P01024 1663 aa29.23■■■□□ 2.27
MALSU1-201ENST00000287543 FAM135AQ9P2D6 1515 aa29.23■■■□□ 2.27
MALSU1-201ENST00000287543 PREX1Q8TCU6 1659 aa29.21■■■□□ 2.27
MALSU1-201ENST00000287543 DAPK1P53355 1430 aa29.21■■■□□ 2.27
MALSU1-201ENST00000287543 DMRT2Q9Y5R5 561 aa29.21■■■□□ 2.27
MALSU1-201ENST00000287543 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
MALSU1-201ENST00000287543 KIF15Q9NS87 1388 aa29.18■■■□□ 2.26
MALSU1-201ENST00000287543 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa29.18■■■□□ 2.26
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