RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258083.2

PRADC1-201, Transcript of protease associated domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRADC1, Length 1,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRADC1-201ENST00000258083 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa35.81■■■■□ 3.32
PRADC1-201ENST00000258083 MAGI2Q86UL8 1455 aa35.78■■■■□ 3.32
PRADC1-201ENST00000258083 ARHGAP5Q13017 1502 aa35.77■■■■□ 3.32
PRADC1-201ENST00000258083 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa35.75■■■■□ 3.31
PRADC1-201ENST00000258083 PREX2Q70Z35 1606 aa35.72■■■■□ 3.31
PRADC1-201ENST00000258083 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa35.72■■■■□ 3.31
PRADC1-201ENST00000258083 YEATS2Q9ULM3 1422 aa35.7■■■■□ 3.31
PRADC1-201ENST00000258083 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa35.69■■■■□ 3.3
PRADC1-201ENST00000258083 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa35.66■■■■□ 3.3
PRADC1-201ENST00000258083 ADAMTSL3P82987 1691 aa35.65■■■■□ 3.3
PRADC1-201ENST00000258083 KDM5CP41229 1560 aa35.63■■■■□ 3.29
PRADC1-201ENST00000258083 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa35.63■■■■□ 3.29
PRADC1-201ENST00000258083 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP35.62■■■■□ 3.29
PRADC1-201ENST00000258083 BCORL1Q5H9F3 1711 aa35.61■■■■□ 3.29
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PRADC1-201ENST00000258083 ABCC1P33527 1531 aa35.6■■■■□ 3.29
PRADC1-201ENST00000258083 AFAP1Q8N556 730 aa35.59■■■■□ 3.29
PRADC1-201ENST00000258083 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP35.58■■■■□ 3.29
PRADC1-201ENST00000258083 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa35.58■■■■□ 3.29
PRADC1-201ENST00000258083 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa35.54■■■■□ 3.28
PRADC1-201ENST00000258083 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa35.54■■■■□ 3.28
PRADC1-201ENST00000258083 ATP10AO60312 1499 aa35.54■■■■□ 3.28
PRADC1-201ENST00000258083 VPS8Q8N3P4 1428 aa35.53■■■■□ 3.28
PRADC1-201ENST00000258083 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa35.53■■■■□ 3.28
PRADC1-201ENST00000258083 PTPRMP28827 1452 aa35.51■■■■□ 3.28
PRADC1-201ENST00000258083 MLH3Q9UHC1 1453 aa35.51■■■■□ 3.28
PRADC1-201ENST00000258083 C9orf84Q5VXU9 1444 aa35.49■■■■□ 3.27
PRADC1-201ENST00000258083 ITSN2Q9NZM3 1697 aa35.49■■■■□ 3.27
PRADC1-201ENST00000258083 CCNB3Q8WWL7 1395 aa35.49■■■■□ 3.27
PRADC1-201ENST00000258083 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa35.48■■■■□ 3.27
PRADC1-201ENST00000258083 HECW2Q9P2P5 1572 aa35.48■■■■□ 3.27
PRADC1-201ENST00000258083 MADDQ8WXG6 1647 aa35.48■■■■□ 3.27
PRADC1-201ENST00000258083 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa35.44■■■■□ 3.26
PRADC1-201ENST00000258083 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP35.44■■■■□ 3.26
PRADC1-201ENST00000258083 TIAM1Q13009 1591 aa35.42■■■■□ 3.26
PRADC1-201ENST00000258083 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa35.42■■■■□ 3.26
PRADC1-201ENST00000258083 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP35.41■■■■□ 3.26
PRADC1-201ENST00000258083 REREQ9P2R6 1566 aa35.4■■■■□ 3.26
PRADC1-201ENST00000258083 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa35.4■■■■□ 3.26
PRADC1-201ENST00000258083 SYCP2Q9BX26 1530 aa35.39■■■■□ 3.26
PRADC1-201ENST00000258083 ABCA6Q8N139 1617 aa35.36■■■■□ 3.25
PRADC1-201ENST00000258083 NCOA2Q15596 1464 aa35.34■■■■□ 3.25
PRADC1-201ENST00000258083 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa35.33■■■■□ 3.25
PRADC1-201ENST00000258083 MAP3K1Q13233 1512 aa35.33■■■■□ 3.25
PRADC1-201ENST00000258083 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP35.33■■■■□ 3.25
PRADC1-201ENST00000258083 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP35.31■■■■□ 3.24
PRADC1-201ENST00000258083 MYT1LQ9UL68 1186 aa35.31■■■■□ 3.24
PRADC1-201ENST00000258083 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa35.3■■■■□ 3.24
PRADC1-201ENST00000258083 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP35.29■■■■□ 3.24
PRADC1-201ENST00000258083 MLECQ14165 292 aa35.29■■■■□ 3.24
PRADC1-201ENST00000258083 AGLP35573 1532 aa35.28■■■■□ 3.24
PRADC1-201ENST00000258083 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP35.27■■■■□ 3.24
PRADC1-201ENST00000258083 MBD5Q9P267 1494 aa35.26■■■■□ 3.23
PRADC1-201ENST00000258083 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP35.26■■■■□ 3.23
PRADC1-201ENST00000258083 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa35.22■■■■□ 3.23
PRADC1-201ENST00000258083 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP35.2■■■■□ 3.23
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PRADC1-201ENST00000258083 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP35.18■■■■□ 3.22
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PRADC1-201ENST00000258083 PLXNC1O60486 1568 aa35.1■■■■□ 3.21
PRADC1-201ENST00000258083 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa35.1■■■■□ 3.21
PRADC1-201ENST00000258083 RSPH4AQ5TD94 716 aa35.07■■■■□ 3.2
PRADC1-201ENST00000258083 A2MP01023 1474 aa35.07■■■■□ 3.2
PRADC1-201ENST00000258083 CCDC141Q6ZP82 1450 aa35.06■■■■□ 3.2
PRADC1-201ENST00000258083 ARHGEF5Q12774 1597 aa35.01■■■■□ 3.2
PRADC1-201ENST00000258083 MIA2Q96PC5 1412 aa35.01■■■■□ 3.2
PRADC1-201ENST00000258083 PLPPR3Q6T4P5 718 aa35.01■■■■□ 3.2
PRADC1-201ENST00000258083 MYOM3Q5VTT5 1437 aa35■■■■□ 3.19
PRADC1-201ENST00000258083 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP35■■■■□ 3.19
PRADC1-201ENST00000258083 CNTLNQ9NXG0 1405 aa34.98■■■■□ 3.19
PRADC1-201ENST00000258083 ADGBQ8N7X0 1667 aa34.98■■■■□ 3.19
PRADC1-201ENST00000258083 APLP2Q06481 763 aa34.97■■■■□ 3.19
PRADC1-201ENST00000258083 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP34.93■■■■□ 3.18
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PRADC1-201ENST00000258083 C3P01024 1663 aa34.9■■■■□ 3.18
PRADC1-201ENST00000258083 TSPY4P0CV99 314 aa34.87■■■■□ 3.17
PRADC1-201ENST00000258083 TSPY10P0CW01 314 aa34.87■■■■□ 3.17
PRADC1-201ENST00000258083 PREX1Q8TCU6 1659 aa34.86■■■■□ 3.17
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PRADC1-201ENST00000258083 HSPA2P54652 639 aa34.86■■■■□ 3.17
PRADC1-201ENST00000258083 PPP6R1Q9UPN7 881 aa34.86■■■■□ 3.17
PRADC1-201ENST00000258083 MROH2AA6NES4 1674 aa34.86■■■■□ 3.17
PRADC1-201ENST00000258083 MAST1Q9Y2H9 1570 aa34.84■■■■□ 3.17
PRADC1-201ENST00000258083 GGT6Q6P531 493 aa34.82■■■■□ 3.16
PRADC1-201ENST00000258083 ZMYM3Q14202 1370 aa34.82■■■■□ 3.16
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PRADC1-201ENST00000258083 KIF3BO15066 747 aa34.73■■■■□ 3.15
PRADC1-201ENST00000258083 FAM135AQ9P2D6 1515 aa34.71■■■■□ 3.15
PRADC1-201ENST00000258083 ABCC5O15440 1437 aa34.7■■■■□ 3.15
PRADC1-201ENST00000258083 SHANK2Q9UPX8 1470 aa34.69■■■■□ 3.14
PRADC1-201ENST00000258083 PTPRKQ15262 1439 aa34.68■■■■□ 3.14
PRADC1-201ENST00000258083 DAPK1P53355 1430 aa34.63■■■■□ 3.13
PRADC1-201ENST00000258083 KDM5DQ9BY66 1539 aa34.62■■■■□ 3.13
PRADC1-201ENST00000258083 CROCC2H7BZ55 1655 aa34.61■■■■□ 3.13
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