RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233331.11

INO80B-201, Transcript of INO80 complex subunit B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene INO80B, Length 1,261 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80B-201ENST00000233331 SCAPERQ9BY12 1400 aa48.89■■■■■ 5.42
INO80B-201ENST00000233331 MTUS2Q5JR59 1369 aa48.87■■■■■ 5.41
INO80B-201ENST00000233331 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa48.86■■■■■ 5.41
INO80B-201ENST00000233331 VPS8Q8N3P4 1428 aa48.86■■■■■ 5.41
INO80B-201ENST00000233331 POGZQ7Z3K3 1410 aa48.82■■■■■ 5.41
INO80B-201ENST00000233331 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa48.8■■■■■ 5.4
INO80B-201ENST00000233331 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa48.79■■■■■ 5.4
INO80B-201ENST00000233331 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa48.78■■■■■ 5.4
INO80B-201ENST00000233331 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa48.77■■■■■ 5.4
INO80B-201ENST00000233331 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa48.68■■■■■ 5.38
INO80B-201ENST00000233331 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP48.68■■■■■ 5.38
INO80B-201ENST00000233331 TIAM1Q13009 1591 aa48.67■■■■■ 5.38
INO80B-201ENST00000233331 ABCC1P33527 1531 aa48.65■■■■■ 5.38
INO80B-201ENST00000233331 MAGI2Q86UL8 1455 aa48.65■■■■■ 5.38
INO80B-201ENST00000233331 CCNB3Q8WWL7 1395 aa48.64■■■■■ 5.38
INO80B-201ENST00000233331 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa48.64■■■■■ 5.38
INO80B-201ENST00000233331 YEATS2Q9ULM3 1422 aa48.62■■■■■ 5.37
INO80B-201ENST00000233331 ITSN2Q9NZM3 1697 aa48.57■■■■■ 5.37
INO80B-201ENST00000233331 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP48.57■■■■■ 5.37
INO80B-201ENST00000233331 KDM5CP41229 1560 aa48.56■■■■■ 5.36
INO80B-201ENST00000233331 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa48.55■■■■■ 5.36
INO80B-201ENST00000233331 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa48.55■■■■■ 5.36
INO80B-201ENST00000233331 AFAP1Q8N556 730 aa48.54■■■■■ 5.36
INO80B-201ENST00000233331 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP48.54■■■■■ 5.36
INO80B-201ENST00000233331 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP48.52■■■■■ 5.36
INO80B-201ENST00000233331 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP48.51■■■■■ 5.36
INO80B-201ENST00000233331 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa48.49■■■■■ 5.35
INO80B-201ENST00000233331 HECW2Q9P2P5 1572 aa48.47■■■■■ 5.35
INO80B-201ENST00000233331 NCOA2Q15596 1464 aa48.46■■■■■ 5.35
INO80B-201ENST00000233331 MAP3K1Q13233 1512 aa48.45■■■■■ 5.35
INO80B-201ENST00000233331 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa48.45■■■■■ 5.35
INO80B-201ENST00000233331 SYCP2Q9BX26 1530 aa48.45■■■■■ 5.35
INO80B-201ENST00000233331 BCORL1Q5H9F3 1711 aa48.44■■■■■ 5.34
INO80B-201ENST00000233331 MYT1LQ9UL68 1186 aa48.43■■■■■ 5.34
INO80B-201ENST00000233331 ADAMTSL3P82987 1691 aa48.4■■■■■ 5.34
INO80B-201ENST00000233331 ATP10AO60312 1499 aa48.4■■■■■ 5.34
INO80B-201ENST00000233331 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa48.39■■■■■ 5.34
INO80B-201ENST00000233331 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa48.38■■■■■ 5.34
INO80B-201ENST00000233331 C9orf84Q5VXU9 1444 aa48.37■■■■■ 5.33
INO80B-201ENST00000233331 MLH3Q9UHC1 1453 aa48.36■■■■■ 5.33
INO80B-201ENST00000233331 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa48.34■■■■■ 5.33
INO80B-201ENST00000233331 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP48.33■■■■■ 5.33
INO80B-201ENST00000233331 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa48.32■■■■■ 5.33
INO80B-201ENST00000233331 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP48.3■■■■■ 5.32
INO80B-201ENST00000233331 ABCA6Q8N139 1617 aa48.29■■■■■ 5.32
INO80B-201ENST00000233331 MADDQ8WXG6 1647 aa48.28■■■■■ 5.32
INO80B-201ENST00000233331 APLP2Q06481 763 aa48.27■■■■■ 5.32
INO80B-201ENST00000233331 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP48.26■■■■■ 5.32
INO80B-201ENST00000233331 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa48.23■■■■■ 5.31
INO80B-201ENST00000233331 PTPRMP28827 1452 aa48.18■■■■■ 5.3
INO80B-201ENST00000233331 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP48.18■■■■■ 5.3
INO80B-201ENST00000233331 MLECQ14165 292 aa48.18■■■■■ 5.3
INO80B-201ENST00000233331 REREQ9P2R6 1566 aa48.17■■■■■ 5.3
INO80B-201ENST00000233331 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa48.15■■■■■ 5.3
INO80B-201ENST00000233331 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP48.14■■■■■ 5.3
INO80B-201ENST00000233331 MBD5Q9P267 1494 aa48.12■■■■■ 5.29
INO80B-201ENST00000233331 ATP7AQ04656 1500 aa48.12■■■■■ 5.29
INO80B-201ENST00000233331 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP48.11■■■■■ 5.29
INO80B-201ENST00000233331 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa48.05■■■■■ 5.28
INO80B-201ENST00000233331 MYOM3Q5VTT5 1437 aa48.02■■■■■ 5.28
INO80B-201ENST00000233331 AGLP35573 1532 aa48.02■■■■■ 5.28
INO80B-201ENST00000233331 CCDC141Q6ZP82 1450 aa48■■■■■ 5.27
INO80B-201ENST00000233331 MIA2Q96PC5 1412 aa47.94■■■■■ 5.26
INO80B-201ENST00000233331 ARHGEF5Q12774 1597 aa47.92■■■■■ 5.26
INO80B-201ENST00000233331 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa47.9■■■■■ 5.26
INO80B-201ENST00000233331 RSPH4AQ5TD94 716 aa47.89■■■■■ 5.26
INO80B-201ENST00000233331 A2MP01023 1474 aa47.89■■■■■ 5.26
INO80B-201ENST00000233331 PLPPR3Q6T4P5 718 aa47.88■■■■■ 5.26
INO80B-201ENST00000233331 PLXNC1O60486 1568 aa47.86■■■■■ 5.25
INO80B-201ENST00000233331 ADGBQ8N7X0 1667 aa47.86■■■■■ 5.25
INO80B-201ENST00000233331 TSPY4P0CV99 314 aa47.75■■■■■ 5.23
INO80B-201ENST00000233331 TSPY10P0CW01 314 aa47.75■■■■■ 5.23
INO80B-201ENST00000233331 PTPN23Q9H3S7 1636 aa47.74■■■■■ 5.23
INO80B-201ENST00000233331 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP47.72■■■■■ 5.23
INO80B-201ENST00000233331 FGD6Q6ZV73 1430 aa47.71■■■■■ 5.23
INO80B-201ENST00000233331 MAST1Q9Y2H9 1570 aa47.66■■■■■ 5.22
INO80B-201ENST00000233331 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP47.66■■■■■ 5.22
INO80B-201ENST00000233331 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP47.65■■■■■ 5.22
INO80B-201ENST00000233331 CNTLNQ9NXG0 1405 aa47.63■■■■■ 5.21
INO80B-201ENST00000233331 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP47.61■■■■■ 5.21
INO80B-201ENST00000233331 LMTK3Q96Q04 1460 aa47.59■■■■■ 5.21
INO80B-201ENST00000233331 GGT6Q6P531 493 aa47.58■■■■■ 5.21
INO80B-201ENST00000233331 C3P01024 1663 aa47.57■■■■■ 5.21
INO80B-201ENST00000233331 CROCC2H7BZ55 1655 aa47.54■■■■■ 5.2
INO80B-201ENST00000233331 ABCC5O15440 1437 aa47.52■■■■■ 5.2
INO80B-201ENST00000233331 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP47.51■■■■■ 5.2
INO80B-201ENST00000233331 MROH2AA6NES4 1674 aa47.51■■■■■ 5.2
INO80B-201ENST00000233331 SHANK2Q9UPX8 1470 aa47.5■■■■■ 5.19
INO80B-201ENST00000233331 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP47.5■■■■■ 5.19
INO80B-201ENST00000233331 DAPK1P53355 1430 aa47.48■■■■■ 5.19
INO80B-201ENST00000233331 KIF3BO15066 747 aa47.48■■■■■ 5.19
INO80B-201ENST00000233331 PREX1Q8TCU6 1659 aa47.45■■■■■ 5.19
INO80B-201ENST00000233331 PPP6R1Q9UPN7 881 aa47.42■■■■■ 5.18
INO80B-201ENST00000233331 ZMYM3Q14202 1370 aa47.4■■■■■ 5.18
INO80B-201ENST00000233331 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP47.38■■■■■ 5.18
INO80B-201ENST00000233331 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP47.37■■■■■ 5.17
INO80B-201ENST00000233331 HSPA2P54652 639 aa47.35■■■■■ 5.17
INO80B-201ENST00000233331 DUOX2Q9NRD8 1548 aa47.35■■■■■ 5.17
INO80B-201ENST00000233331 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP47.33■■■■■ 5.17
INO80B-201ENST00000233331 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa47.33■■■■■ 5.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.1 ms