RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000101395.2

Hoxa4-201, Transcript of Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxa4, Length 1,594 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Caskin1Q6P9K8 1431 aa43.19■■■■■ 4.5
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Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pprc1Q6NZN1 1644 aa42.73■■■■■ 4.43
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Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Kdm3bQ6ZPY7 1562 aa42.64■■■■■ 4.42
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Trappc8E9PWG2 1437 aa42.64■■■■■ 4.42
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Neurl4Q5NCX5 1563 aa42.61■■■■■ 4.41
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Hecw1Q8K4P8 1604 aa42.57■■■■■ 4.41
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Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Sart1Q9Z315 806 aaKnown RBP42.52■■■■■ 4.4
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Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Kidins220E9Q9B7 1793 aa42.47■■■■■ 4.39
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Hoxa4-201ENSMUST00000101395 AlkP97793 1621 aa42.21■■■■■ 4.35
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Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ssh2Q5SW75 1423 aa42.11■■■■■ 4.33
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Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Atp10aO54827 1508 aa42.09■■■■■ 4.33
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Clstn2Q9ER65 966 aa42.09■■■■■ 4.33
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mphosph9A6H5Y1 991 aa42.08■■■■■ 4.33
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 AdgbG3UZ78 1657 aa42.06■■■■■ 4.32
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Nos1Q9Z0J4 1429 aa42.06■■■■■ 4.32
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Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Abca17E9PX95 1733 aa41.93■■■■■ 4.3
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Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Usp54Q8BL06 1588 aaKnown RBP41.8■■■■■ 4.28
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Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pkd2O35245 966 aa41.75■■■■■ 4.27
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