RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000093061.6

Trim11-201, Transcript of E3 ubiquitin-protein ligase TRIM11, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trim11, Length 2,251 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim11-201ENSMUST00000093061 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
Trim11-201ENSMUST00000093061 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
Trim11-201ENSMUST00000093061 Kdm6bQ5NCY0 1641 aa22.23■■□□□ 1.15
Trim11-201ENSMUST00000093061 Ncoa2Q61026 1462 aa22.23■■□□□ 1.15
Trim11-201ENSMUST00000093061 NclP09405 707 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
Trim11-201ENSMUST00000093061 Abcc5Q9R1X5 1436 aa22.21■■□□□ 1.15
Trim11-201ENSMUST00000093061 Mroh2aD3Z750 1679 aa22.21■■□□□ 1.15
Trim11-201ENSMUST00000093061 CenpbP27790 599 aa22.18■■□□□ 1.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Magi1Q6RHR9 1471 aa22.17■■□□□ 1.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Cabp1Q9JLK7 227 aa22.17■■□□□ 1.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Camsap2Q8C1B1 1461 aa22.17■■□□□ 1.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Prex2Q3LAC4 1598 aa22.15■■□□□ 1.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Mtus2Q3UHD3 1353 aa22.14■■□□□ 1.14
Trim11-201ENSMUST00000093061 Neo1P97798 1493 aa22.13■■□□□ 1.13
Trim11-201ENSMUST00000093061 SphkapQ6NSW3 1687 aa22.12■■□□□ 1.13
Trim11-201ENSMUST00000093061 Rrbp1Q99PL5 1605 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
Trim11-201ENSMUST00000093061 Setbp1Q9Z180 1582 aa22.11■■□□□ 1.13
Trim11-201ENSMUST00000093061 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa22.11■■□□□ 1.13
Trim11-201ENSMUST00000093061 Kdm3bQ6ZPY7 1562 aa22.09■■□□□ 1.13
Trim11-201ENSMUST00000093061 Naip5Q9R016 1403 aa22.09■■□□□ 1.13
Trim11-201ENSMUST00000093061 Mphosph9A6H5Y1 991 aa22.09■■□□□ 1.13
Trim11-201ENSMUST00000093061 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
Trim11-201ENSMUST00000093061 Gm13697A2AK42 830 aa22.08■■□□□ 1.12
Trim11-201ENSMUST00000093061 Fam163aQ8CAA5 168 aa22.08■■□□□ 1.12
Trim11-201ENSMUST00000093061 AknaQ80VW7 1404 aa22.06■■□□□ 1.12
Trim11-201ENSMUST00000093061 Il16O54824 1322 aa22.06■■□□□ 1.12
Trim11-201ENSMUST00000093061 Adgrb2Q8CGM1 1561 aa22.02■■□□□ 1.12
Trim11-201ENSMUST00000093061 Jph4Q80WT0 628 aa22.02■■□□□ 1.12
Trim11-201ENSMUST00000093061 Fgd6Q69ZL1 1399 aa22.02■■□□□ 1.12
Trim11-201ENSMUST00000093061 Kif21bQ9QXL1 1668 aa22.02■■□□□ 1.12
Trim11-201ENSMUST00000093061 Lamc1P02468 1607 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
Trim11-201ENSMUST00000093061 Zfp644E9QA22 1323 aa22.01■■□□□ 1.11
Trim11-201ENSMUST00000093061 Mlh3A0A1Y7VMP7 1443 aa21.99■■□□□ 1.11
Trim11-201ENSMUST00000093061 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
Trim11-201ENSMUST00000093061 AlkP97793 1621 aa21.97■■□□□ 1.11
Trim11-201ENSMUST00000093061 Caskin1Q6P9K8 1431 aa21.96■■□□□ 1.11
Trim11-201ENSMUST00000093061 Fancd2Q80V62 1450 aa21.96■■□□□ 1.11
Trim11-201ENSMUST00000093061 Tdrd9Q14BI7 1383 aa21.96■■□□□ 1.11
Trim11-201ENSMUST00000093061 Pkd2O35245 966 aa21.94■■□□□ 1.1
Trim11-201ENSMUST00000093061 Fam208aQ69ZR9 1610 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
Trim11-201ENSMUST00000093061 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa21.93■■□□□ 1.1
Trim11-201ENSMUST00000093061 Rprd2Q6NXI6 1469 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
Trim11-201ENSMUST00000093061 Usp47Q8BY87 1376 aa21.91■■□□□ 1.1
Trim11-201ENSMUST00000093061 Supt6hQ62383 1726 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
Trim11-201ENSMUST00000093061 Chd1P40201 1711 aa21.88■■□□□ 1.09
Trim11-201ENSMUST00000093061 Gm14025A2AP89 1413 aa21.88■■□□□ 1.09
Trim11-201ENSMUST00000093061 Fmn2Q9JL04 1578 aa21.87■■□□□ 1.09
Trim11-201ENSMUST00000093061 Tnnt3Q9QZ47 272 aa21.86■■□□□ 1.09
Trim11-201ENSMUST00000093061 Pprc1Q6NZN1 1644 aa21.85■■□□□ 1.09
Trim11-201ENSMUST00000093061 Pik3c2gO70167 1506 aa21.85■■□□□ 1.09
Trim11-201ENSMUST00000093061 Rnf17Q99MV7 1640 aa21.83■■□□□ 1.08
Trim11-201ENSMUST00000093061 Gm38655A0A286YDK6 273 aa21.82■■□□□ 1.08
Trim11-201ENSMUST00000093061 Arhgap5P97393 1501 aa21.82■■□□□ 1.08
Trim11-201ENSMUST00000093061 Abcc1O35379 1528 aa21.81■■□□□ 1.08
Trim11-201ENSMUST00000093061 Trpm2Q91YD4 1506 aa21.8■■□□□ 1.08
Trim11-201ENSMUST00000093061 Gm32742A0A1B0GT42 1604 aa21.8■■□□□ 1.08
Trim11-201ENSMUST00000093061 Sin3aQ60520 1274 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
Trim11-201ENSMUST00000093061 NhsB1AV60 1647 aa21.79■■□□□ 1.08
Trim11-201ENSMUST00000093061 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa21.78■■□□□ 1.08
Trim11-201ENSMUST00000093061 Pdcd11Q6NS46 1862 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
Trim11-201ENSMUST00000093061 Kif14L0N7N1 1674 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
Trim11-201ENSMUST00000093061 Ttll5Q8CHB8 1328 aa21.77■■□□□ 1.07
Trim11-201ENSMUST00000093061 Nup155Q99P88 1391 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
Trim11-201ENSMUST00000093061 Dhx9O70133 1380 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
Trim11-201ENSMUST00000093061 DroshaQ5HZJ0 1373 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
Trim11-201ENSMUST00000093061 Adgrl2Q8JZZ7 1487 aa21.74■■□□□ 1.07
Trim11-201ENSMUST00000093061 Stra8P70278 393 aa21.73■■□□□ 1.07
Trim11-201ENSMUST00000093061 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
Trim11-201ENSMUST00000093061 Cfap74Q3UY96 1578 aa21.71■■□□□ 1.07
Trim11-201ENSMUST00000093061 Wdr7Q920I9 1489 aa21.71■■□□□ 1.07
Trim11-201ENSMUST00000093061 Trak1Q6PD31 939 aa21.71■■□□□ 1.07
Trim11-201ENSMUST00000093061 Mast1Q9R1L5 1570 aa21.7■■□□□ 1.07
Trim11-201ENSMUST00000093061 Lrrc9Q8CDN9 1456 aa21.7■■□□□ 1.06
Trim11-201ENSMUST00000093061 Hecw1Q8K4P8 1604 aa21.7■■□□□ 1.06
Trim11-201ENSMUST00000093061 Trappc8E9PWG2 1437 aa21.69■■□□□ 1.06
Trim11-201ENSMUST00000093061 Abca8bQ8K440 1620 aa21.67■■□□□ 1.06
Trim11-201ENSMUST00000093061 Map4P27546 1125 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
Trim11-201ENSMUST00000093061 Neurl4Q5NCX5 1563 aa21.65■■□□□ 1.06
Trim11-201ENSMUST00000093061 Ssh2Q5SW75 1423 aa21.65■■□□□ 1.06
Trim11-201ENSMUST00000093061 Ncoa1P70365 1447 aa21.64■■□□□ 1.06
Trim11-201ENSMUST00000093061 Rgl3Q3UYI5 709 aa21.64■■□□□ 1.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Smg6P61406 1418 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Rrp7aQ9D1C9 280 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Mbd5B1AYB6 1498 aa21.63■■□□□ 1.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Cdc42bpbQ7TT50 1713 aa21.62■■□□□ 1.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Sart1Q9Z315 806 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Atp10dQ8K2X1 1416 aa21.62■■□□□ 1.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Asxl1P59598 1514 aa21.61■■□□□ 1.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Clstn2Q9ER65 966 aa21.59■■□□□ 1.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 Abcc3B2RX12 1523 aa21.59■■□□□ 1.05
Trim11-201ENSMUST00000093061 PtprgQ05909 1442 aa21.57■■□□□ 1.04
Trim11-201ENSMUST00000093061 SafbD3YXK2 937 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
Trim11-201ENSMUST00000093061 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa21.57■■□□□ 1.04
Trim11-201ENSMUST00000093061 Mug2P28666 1451 aa21.56■■□□□ 1.04
Trim11-201ENSMUST00000093061 Dot1lQ6XZL8 1540 aa21.56■■□□□ 1.04
Trim11-201ENSMUST00000093061 Dapk1Q80YE7 1442 aa21.55■■□□□ 1.04
Trim11-201ENSMUST00000093061 Znf608Q56A10 1511 aa21.54■■□□□ 1.04
Trim11-201ENSMUST00000093061 Fam71e1A1L3C1 212 aa21.54■■□□□ 1.04
Trim11-201ENSMUST00000093061 Cwc22Q8C5N3 908 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
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