RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000039061.14

Trappc11-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 11, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trappc11, Length 4,332 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa14.96□□□□□ -0.01
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Arhgap27A2AB59 869 aa14.96□□□□□ -0.01
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Taok2Q6ZQ29 1240 aa14.96□□□□□ -0.01
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Trim44Q9QXA7 346 aa14.95□□□□□ -0.02
Trappc11-201ENSMUST00000039061 PnisrA2AJT4 805 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Mtus2Q3UHD3 1353 aa14.94□□□□□ -0.02
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Trak1Q6PD31 939 aa14.94□□□□□ -0.02
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Ccnb3Q810T2 1396 aa14.94□□□□□ -0.02
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Plcb2A3KGF7 1181 aa14.93□□□□□ -0.02
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
Trappc11-201ENSMUST00000039061 PtprkP35822 1457 aa14.92□□□□□ -0.02
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
Trappc11-201ENSMUST00000039061 CrbnQ8C7D2 445 aa14.92□□□□□ -0.02
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Mbd3Q9Z2D8 285 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Kif27Q7M6Z4 1394 aa14.9□□□□□ -0.02
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Ttll13A4Q9F6 804 aa14.9□□□□□ -0.02
Trappc11-201ENSMUST00000039061 L3mbtl2P59178 703 aa14.89□□□□□ -0.03
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Kdm2aP59997 1161 aa14.89□□□□□ -0.03
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Vps8Q0P5W1 1427 aa14.89□□□□□ -0.03
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Ythdc1E9Q5K9 736 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Gm6268A2A3U9 297 aa14.88□□□□□ -0.03
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Speer4f1Q9D5Q6 258 aa14.87□□□□□ -0.03
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Ipo8Q7TMY7 1010 aa14.87□□□□□ -0.03
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Zfp644E9QA22 1323 aa14.86□□□□□ -0.03
Trappc11-201ENSMUST00000039061 NudcO35685 332 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Carmil1Q6EDY6 1374 aa14.86□□□□□ -0.03
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Rpgrip1lQ8CG73 1264 aa14.85□□□□□ -0.03
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Eif2s2Q99L45 331 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Mre11Q61216 706 aa14.85□□□□□ -0.03
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Tiam1Q60610 1591 aa14.85□□□□□ -0.03
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Rtn4Q99P72 1162 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Prkrip1Q9CWV6 186 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Egfem1Q8C088 590 aa14.84□□□□□ -0.03
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Ipo4Q8VI75 1082 aa14.83□□□□□ -0.03
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Clstn2Q9ER65 966 aa14.83□□□□□ -0.04
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Lmod3E9QA62 571 aa14.82□□□□□ -0.04
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Dapk1Q80YE7 1442 aa14.81□□□□□ -0.04
Trappc11-201ENSMUST00000039061 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Shroom4Q1W617 1475 aa14.81□□□□□ -0.04
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Mroh3A0A1D5RM54 893 aa14.8□□□□□ -0.04
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Esx1O88933 382 aa14.8□□□□□ -0.04
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Map4P27546 1125 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Zfp444Q3TDV8 331 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
Trappc11-201ENSMUST00000039061 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa14.79□□□□□ -0.04
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Fgd1P52734 960 aa14.79□□□□□ -0.04
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Q7TT23 1179 aa14.78□□□□□ -0.04
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Ak7Q9D2H2 614 aa14.78□□□□□ -0.04
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Mapk8ip3Q9ESN9 1337 aa14.77□□□□□ -0.05
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Ifit1bl1D3Z6F0 470 aa14.76□□□□□ -0.05
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Rrp7aQ9D1C9 280 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Pank3Q8R2W9 370 aa14.75□□□□□ -0.05
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Inpp5dQ9ES52 1191 aa14.75□□□□□ -0.05
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Cluap1Q8R3P7 413 aa14.74□□□□□ -0.05
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Znf692Q3U381 531 aa14.73□□□□□ -0.05
Trappc11-201ENSMUST00000039061 PtmaP26350 111 aa14.73□□□□□ -0.05
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Naip5Q9R016 1403 aa14.73□□□□□ -0.05
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Tmf1B9EKI3 1091 aa14.73□□□□□ -0.05
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Pdcl3Q8BVF2 240 aa14.72□□□□□ -0.05
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Atp1b4Q99ME6 356 aa14.72□□□□□ -0.05
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Plekhh2Q8C115 1491 aa14.72□□□□□ -0.05
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Mfap1aC0HKD8 439 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Mfap1bC0HKD9 439 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa14.71□□□□□ -0.05
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Ercc6F8VPZ5 1481 aa14.71□□□□□ -0.05
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Cnga1P29974 684 aa14.71□□□□□ -0.05
Trappc11-201ENSMUST00000039061 NrkQ9R0G8 1455 aa14.7□□□□□ -0.06
Trappc11-201ENSMUST00000039061 SlkO54988 1233 aa14.7□□□□□ -0.06
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Slc4a1apE9PX68 744 aa14.7□□□□□ -0.06
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Efcab5A0JP43 1406 aa14.69□□□□□ -0.06
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Map3k1P53349 1493 aa14.69□□□□□ -0.06
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Rock1P70335 1354 aa14.68□□□□□ -0.06
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Naip2Q9QUK4 1447 aa14.68□□□□□ -0.06
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Gm20521D3Z5F7 333 aa14.68□□□□□ -0.06
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Erich6bQ9D4S6 220 aa14.68□□□□□ -0.06
Trappc11-201ENSMUST00000039061 3425401B19RikD3Z1D3 1412 aa14.68□□□□□ -0.06
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Cux2P70298 1426 aa14.67□□□□□ -0.06
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Golga2Q921M4 999 aa14.67□□□□□ -0.06
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Ncoa1P70365 1447 aa14.67□□□□□ -0.06
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Rock2P70336 1388 aa14.66□□□□□ -0.06
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa14.66□□□□□ -0.06
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Nup155Q99P88 1391 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Plekhg5Q66T02 1073 aa14.66□□□□□ -0.06
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Ecm2Q5FW85 670 aa14.65□□□□□ -0.06
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Dcaf11Q91VU6 549 aa14.65□□□□□ -0.06
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Map7O88735 730 aa14.64□□□□□ -0.07
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Pcf11G3X9Z4 1553 aa14.64□□□□□ -0.07
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Ccdc183A2AJB1 534 aa14.63□□□□□ -0.07
Trappc11-201ENSMUST00000039061 KarsQ99MN1 595 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Rrp12Q6P5B0 1295 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa14.63□□□□□ -0.07
Trappc11-201ENSMUST00000039061 BicraF8VPZ9 1578 aa14.62□□□□□ -0.07
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Slx4Q6P1D7 1565 aa14.62□□□□□ -0.07
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Cux1P53564 1515 aa14.62□□□□□ -0.07
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Kif16bB1AVY7 1312 aa14.61□□□□□ -0.07
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Ift140E9PY46 1464 aa14.61□□□□□ -0.07
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Znf330Q922H9 316 aa14.61□□□□□ -0.07
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Srpk2O54781 681 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Zscan10Q3URR7 782 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 15 ms