RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-222ENST00000635152 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
BRF1-222ENST00000635152 NDUFA10O95299 355 aa14.65□□□□□ -0.06
BRF1-222ENST00000635152 FECHP22830 423 aa14.65□□□□□ -0.06
BRF1-222ENST00000635152 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
BRF1-222ENST00000635152 ADCY7P51828 1080 aa14.65□□□□□ -0.06
BRF1-222ENST00000635152 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa14.65□□□□□ -0.06
BRF1-222ENST00000635152 KCTD1Q719H9 257 aa14.65□□□□□ -0.06
BRF1-222ENST00000635152 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
BRF1-222ENST00000635152 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
BRF1-222ENST00000635152 ZNF507Q8TCN5 953 aa14.65□□□□□ -0.06
BRF1-222ENST00000635152 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa14.65□□□□□ -0.06
BRF1-222ENST00000635152 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
BRF1-222ENST00000635152 FAM53CQ9NYF3 392 aa14.65□□□□□ -0.06
BRF1-222ENST00000635152 SERPINB13Q9UIV8 391 aa14.65□□□□□ -0.06
BRF1-222ENST00000635152 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
BRF1-222ENST00000635152 ARHGAP25P42331 645 aa14.65□□□□□ -0.06
BRF1-222ENST00000635152 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
BRF1-222ENST00000635152 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
BRF1-222ENST00000635152 CUEDC2Q9H467 287 aa14.65□□□□□ -0.06
BRF1-222ENST00000635152 CDC23Q9UJX2 597 aa14.65□□□□□ -0.06
BRF1-222ENST00000635152 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 IDEP14735 1019 aa14.64□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 CCNE1P24864 410 aa14.64□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 CCDC96Q2M329 555 aa14.64□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 GPIHBP1Q8IV16 184 aa14.64□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 KIAA0895Q8NCT3 520 aa14.64□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 NUDT12Q9BQG2 462 aa14.64□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 FAM196BA6NMK8 535 aa14.64□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 G3V3G9 751 aa14.64□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 CACNB3P54284 484 aa14.64□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 AMPD3Q01432 767 aa14.64□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 GABPAQ06546 454 aa14.64□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 GRB10Q13322 594 aa14.64□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 DCAF8Q5TAQ9 597 aa14.64□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 SV2BQ7L1I2 683 aa14.64□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa14.64□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 ADGRF4Q8IZF3 695 aa14.64□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 CRAMP1Q96RY5 1269 aa14.64□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 C7orf25Q9BPX7 421 aa14.64□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 JMJD4Q9H9V9 463 aa14.64□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 EDIL3O43854 480 aa14.63□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 TTLL1O95922 423 aa14.63□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 DNM2P50570 870 aa14.63□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 NFIAQ12857 509 aa14.63□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 WDR59Q6PJI9 974 aa14.63□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 RABGGTAQ92696 567 aa14.63□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 MTMR9Q96QG7 549 aa14.63□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa14.63□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 BICDL2A1A5D9 508 aa14.63□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 MYMKA6NI61 221 aa14.63□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 ENC1O14682 589 aa14.63□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 PLA2G4AP47712 749 aa14.63□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 ASPRV1Q53RT3 343 aa14.63□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 SNX29Q8TEQ0 813 aa14.63□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa14.63□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa14.63□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 A0A1W2PQC6 194 aa14.63□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 MARCH6O60337 910 aa14.63□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 LY75O60449 1722 aa14.63□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 SASH3O75995 380 aa14.63□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 SMARCA1P28370 1054 aa14.63□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 TCP10Q12799 353 aa14.63□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 SP8Q8IXZ3 490 aa14.63□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 PNMA5Q96PV4 448 aa14.63□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 COA1Q9GZY4 146 aa14.63□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 SEMA6BQ9H3T3 888 aa14.63□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 MAGEF1Q9HAY2 307 aa14.63□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 KCNQ5Q9NR82 932 aa14.63□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 CAPN11Q9UMQ6 739 aa14.63□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 ESYT2A0FGR8 921 aa14.62□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 USP17L10C9JJH3 530 aa14.62□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 SRGNP10124 158 aa14.62□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 NOVP48745 357 aa14.62□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 TERF2Q15554 542 aa14.62□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 TMEM266Q2M3C6 531 aa14.62□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 CNNM4Q6P4Q7 775 aa14.62□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 KCNK18Q7Z418 384 aa14.62□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 ZFPM1Q8IX07 1006 aa14.62□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 DNAJC7Q99615 494 aa14.62□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa14.62□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 MYH1P12882 1939 aa14.62□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 RHOXF2BP0C7M4 288 aa14.62□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 ZNF543Q08ER8 600 aa14.62□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 LRRC41Q15345 812 aa14.62□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa14.62□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 GLIS3Q8NEA6 775 aa14.62□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 RHOXF2Q9BQY4 288 aa14.62□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 ARFGAP3Q9NP61 516 aa14.62□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa14.62□□□□□ -0.07
BRF1-222ENST00000635152 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.1 ms