RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389416.8

PTPRN2-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN2, Length 4,692 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2-202ENST00000389416 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
PTPRN2-202ENST00000389416 WDR11Q9BZH6 1224 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRN2-202ENST00000389416 CASP7P55210 303 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRN2-202ENST00000389416 QRICH1Q2TAL8 776 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRN2-202ENST00000389416 DPCR1Q3MIW9 517 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRN2-202ENST00000389416 TRIML1Q8N9V2 468 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRN2-202ENST00000389416 SLFN14P0C7P3 912 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRN2-202ENST00000389416 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
PTPRN2-202ENST00000389416 IWS1Q96ST2 819 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRN2-202ENST00000389416 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
PTPRN2-202ENST00000389416 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
PTPRN2-202ENST00000389416 CTAGE15A4D2H0 777 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 KCNJ18B7U540 433 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 CTAGE8P0CG41 777 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 ACTN2P35609 894 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 IFFO1Q0D2I5 559 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 KCNJ12Q14500 433 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 GRM4Q14833 912 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 LRRC41Q15345 812 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 ARHGAP44Q17R89 818 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 CTAGE6Q86UF2 777 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 HOOK3Q86VS8 718 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 CTAGE4Q8IX94 777 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 CCDC127Q96BQ5 260 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 TRIM14Q14142 442 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 LONRF3Q496Y0 759 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 HS1BP3Q53T59 392 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 HHIPL2Q6UWX4 724 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 RNF207Q6ZRF8 634 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 ATP6V0A1Q93050 837 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 GSDMAQ96QA5 445 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 PPP1R9BQ96SB3 815 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 SLF1Q9BQI6 1058 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 ADKP55263 362 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 MCM6Q14566 821 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 TTBK2Q6IQ55 1244 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 SAMD7Q7Z3H4 446 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 C2orf69Q8N8R5 385 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 LMBR1Q8WVP7 490 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 NRBP2Q9NSY0 501 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 M0QZ92 97 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 LIG4P49917 911 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 GUCY1A2P33402 732 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 RNF169Q8NCN4 708 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 SELENOOQ9BVL4 669 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 TMEM260Q9NX78 707 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 MTMR4Q9NYA4 1195 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 CD19P15391 556 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 PLCB3Q01970 1234 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 ADAM9Q13443 819 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 RRAGAQ7L523 313 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 ADGRF4Q8IZF3 695 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 KCNG1Q9UIX4 513 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 STX10O60499 249 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 PLCG1P19174 1290 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 VWA3BQ502W6 1294 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 RMDN3Q96TC7 470 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 NUP58Q9BVL2 599 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 PCDHA6Q9UN73 950 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 MCM3P25205 808 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 ASIC2Q16515 512 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 SBK1Q52WX2 424 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 HMGCS2P54868 508 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 CEP170P1Q96L14 293 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 SENP2Q9HC62 589 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 STK36Q9NRP7 1315 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 KLHL30Q0D2K2 578 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 SPATA1Q5VX52 437 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 ARMCX5Q6P1M9 558 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 CYP26C1Q6V0L0 522 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 SLC7A3Q8WY07 619 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 KIFAP3Q92845 792 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 HOXC10Q9NYD6 342 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 FGFR2P21802 821 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 PRPHP41219 470 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 RCAN1P53805 252 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 CCDC50Q8IVM0 306 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 CDHR1Q96JP9 859 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRN2-202ENST00000389416 TMEM39BQ9GZU3 492 aa14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms