RNA–Protein interactions for RNA: YDL117W

CYK3, Transcript of SH3-domain protein located in the bud neck and cytokinetic actin ring, yeastyeast

Gene CYK3, Length 2,658 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CYK3YDL117W LOT5P34234 306 aa5.09□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W LAS1P36146 502 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W TSC10P38342 320 aa5.09□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W AIM18P38884 321 aa5.09□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W LYS9P38999 446 aa5.09□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W CCT2P39076 527 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W FHL1P39521 936 aa5.09□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W CIN1P40987 1014 aa5.09□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W NSA1P53136 463 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W RPT4P53549 437 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W CWC24P53769 259 aa5.09□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W ALO1P54783 526 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W RSN1Q03516 953 aa5.09□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W CSN9Q03981 162 aa5.09□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W SOV1Q04748 898 aa5.09□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W CIA1Q05583 330 aa5.09□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W ZEO1Q08245 113 aa5.09□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W DCS2Q12123 353 aa5.09□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W MTR10Q99189 972 aa5.09□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W YPT6Q99260 215 aa5.09□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W RAD10P06838 210 aa5.09□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W CMK2P22517 447 aa5.09□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W YSP3P25036 478 aa5.09□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W PHA2P32452 334 aa5.09□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W GSP1P32835 219 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W GSP2P32836 220 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W AKL1P38080 1108 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W MCX1P38323 520 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W MNN9P39107 395 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W SOP4P39543 234 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W FET5P43561 622 aa5.09□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W MPS3P47069 682 aa5.09□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W ASK10P48361 1146 aa5.09□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W RMT2Q03305 412 aa5.09□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W ENT5Q03769 411 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W NHX1Q04121 633 aa5.09□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W SMP3Q04174 516 aa5.09□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W SDO1Q07953 250 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W FEX2Q08991 375 aa5.09□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W LEU9Q12166 604 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W VAM3Q12241 283 aa5.09□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W TUB2P02557 457 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W RPP2AP05319 106 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W PUT2P07275 575 aa5.08□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W HSF1P10961 833 aa5.08□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W SEC18P18759 758 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W SGV1P23293 657 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W RRT12P25381 491 aa5.08□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W SYP1P25623 870 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W CCR4P31384 837 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W NTR2P36118 322 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W PAC1P39946 494 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W SMX2P40204 77 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W SOK1P40317 901 aa5.08□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W ORC5P50874 479 aa5.08□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W LSC2P53312 427 aa5.08□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W YPL107WQ02873 248 aa5.08□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W BOP2Q06150 570 aa5.08□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W BRE4Q07660 1125 aa5.08□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W PNO1Q99216 274 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W RPS9AO13516 197 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W RPS9BP05755 195 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W CDC36P06100 191 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W ADE5,7P07244 802 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W FBA1P14540 359 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W SLY1P22213 666 aa5.08□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W CHL1P22516 861 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W GRR1P24814 1151 aa5.08□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W BEM3P32873 1128 aa5.08□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W PDR3P33200 976 aa5.08□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W MCD4P36051 919 aa5.08□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W YBP1P38315 674 aa5.08□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W HRB1P38922 454 aaKnown RBP RIP-Chip data5.08□□□□□ -1.6not detected
CYK3YDL117W SCC4P40090 624 aa5.08□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W GSM1P42950 618 aa5.08□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W YPT11P48559 417 aa5.08□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W SLI1P53304 468 aa5.08□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W SSU72P53538 206 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W NPL3Q01560 414 aaKnown RBP RIP-Chip data5.08□□□□□ -1.6not detected
CYK3YDL117W YDR387CQ04162 555 aa5.08□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W YDL129WQ07555 291 aa5.08□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W YOR214CQ12282 236 aa5.08□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W YDL206WQ12424 762 aa5.08□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W AI5_BETAQ9ZZX0 354 aa5.08□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W TRP5P00931 707 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W SPS4P09937 338 aa5.07□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W NFT1P0CE68 1218 aa5.07□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W INO1P11986 533 aa5.07□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W FRS1P15624 595 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W GID7P25569 745 aa5.07□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W NDI1P32340 513 aa5.07□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W PET309P32522 965 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W ECM25P32525 599 aa5.07□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W SEF1P34228 1148 aa5.07□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W PTC1P35182 281 aa5.07□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W BDF1P35817 686 aa5.07□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W AIM29P36154 155 aa5.07□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W DUG2P38149 878 aa5.07□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W RFC3P38629 340 aa5.07□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W YHL008CP38750 627 aa5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 61 ms