RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590367.5

EFTUD2-218, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 3,638 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-218ENST00000590367 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP8.59□□□□□ -1.041e-7■■□□□ 11.8
EFTUD2-218ENST00000590367 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP8.59□□□□□ -1.042e-10■□□□□ 10.5
EFTUD2-218ENST00000590367 LBRQ14739 615 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa8.59□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 ATL3Q6DD88 541 aa8.59□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 OLFML1Q6UWY5 402 aa8.59□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 ATP11CQ8NB49 1132 aa8.59□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa8.59□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 SUCLG2Q96I99 432 aa8.59□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP8.59□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 SNX14Q9Y5W7 946 aa8.59□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 FLOT1O75955 427 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 GYS1P13807 737 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 ADRA2BP18089 450 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 NLRP12P59046 1061 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 SESTD1Q86VW0 696 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 SAMD3Q8N6K7 520 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 LZTFL1Q9NQ48 299 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 DOT1LQ8TEK3 1739 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 F8VZ95 297 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 N4BP3O15049 544 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 A1BGP04217 495 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 RPL13P26373 211 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 FAM173BQ6P4H8 233 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 FSIP1Q8NA03 581 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 NACA2Q9H009 215 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 GALNT8Q9NY28 637 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 LRP5O75197 1615 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 A0A087WZG4 1122 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 A0A1B0GVL5 298 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 C6orf89Q6UWU4 347 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 OLFM4Q6UX06 510 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 Q6ZUG5 572 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 IQCF2Q8IXL9 164 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 ARHGAP18Q8N392 663 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 CXorf38Q8TB03 319 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 KCNV2Q8TDN2 545 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 HVCN1Q96D96 273 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 FGD4Q96M96 766 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 ABCF2Q9UG63 623 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 STAP2Q9UGK3 403 aa8.58□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 UBN2Q6ZU65 1347 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 PRC1O43663 620 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 KRT38O76015 456 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 GSTA1P08263 222 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 DPEP1P16444 411 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 PCK1P35558 622 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 PSMC4P43686 418 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 POSTNQ15063 836 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 PPP4R3AQ6IN85 833 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP8.57□□□□□ -1.043e-9■■□□□ 13.8
EFTUD2-218ENST00000590367 MYOCDQ8IZQ8 938 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 SMYD1Q8NB12 490 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 CAGE1Q8TC20 777 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 TCEANC2Q96MN5 208 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNF510Q9Y2H8 683 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 RREB1Q92766 1687 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 CLTAP09496 248 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 ATP1A2P50993 1020 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 ME3Q16798 604 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 FAM167BQ9BTA0 163 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 TM6SF1Q9BZW5 370 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 TRPV5Q9NQA5 729 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 SLC5A4Q9NY91 659 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 CIDEBQ9UHD4 219 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa8.57□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 USP54Q70EL1 1684 aa8.56□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 TMEM232C9JQI7 657 aa8.56□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 ATP2C2O75185 946 aa8.56□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 FAM200BP0CF97 657 aa8.56□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 CCDC166P0CW27 439 aa8.56□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP8.56□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 HARSP12081 509 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 CHRNA5P30532 468 aa8.56□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms