RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466624.1

GPC1-207, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 2

Gene GPC1, Length 782 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-207ENST00000466624 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
GPC1-207ENST00000466624 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
GPC1-207ENST00000466624 GPR142Q7Z601 462 aa18.49■□□□□ 0.55
GPC1-207ENST00000466624 PLEKHH3Q7Z736 793 aa18.49■□□□□ 0.55
GPC1-207ENST00000466624 CD99L2Q8TCZ2 262 aa18.49■□□□□ 0.55
GPC1-207ENST00000466624 PHKBQ93100 1093 aa18.49■□□□□ 0.55
GPC1-207ENST00000466624 TRERF1Q96PN7 1200 aa18.49■□□□□ 0.55
GPC1-207ENST00000466624 RNF146Q9NTX7 359 aa18.49■□□□□ 0.55
GPC1-207ENST00000466624 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
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GPC1-207ENST00000466624 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa18.48■□□□□ 0.55
GPC1-207ENST00000466624 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
GPC1-207ENST00000466624 DEXIO95424 95 aa18.48■□□□□ 0.55
GPC1-207ENST00000466624 CTDNEP1O95476 244 aa18.48■□□□□ 0.55
GPC1-207ENST00000466624 CTGFP29279 349 aa18.48■□□□□ 0.55
GPC1-207ENST00000466624 USH1GQ495M9 461 aa18.48■□□□□ 0.55
GPC1-207ENST00000466624 CCDC83Q8IWF9 413 aa18.48■□□□□ 0.55
GPC1-207ENST00000466624 RGS22Q8NE09 1264 aa18.48■□□□□ 0.55
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GPC1-207ENST00000466624 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa18.48■□□□□ 0.55
GPC1-207ENST00000466624 SLC15A5A6NIM6 579 aa18.47■□□□□ 0.55
GPC1-207ENST00000466624 FCER1AP12319 257 aa18.47■□□□□ 0.55
GPC1-207ENST00000466624 SCG2P13521 617 aa18.47■□□□□ 0.55
GPC1-207ENST00000466624 PTPREP23469 700 aa18.47■□□□□ 0.55
GPC1-207ENST00000466624 LBX1P52954 281 aa18.47■□□□□ 0.55
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GPC1-207ENST00000466624 TEX2Q8IWB9 1127 aa18.47■□□□□ 0.55
GPC1-207ENST00000466624 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
GPC1-207ENST00000466624 SAMD3Q8N6K7 520 aa18.47■□□□□ 0.55
GPC1-207ENST00000466624 CLEC4DQ8WXI8 215 aa18.47■□□□□ 0.55
GPC1-207ENST00000466624 PIBF1Q8WXW3 757 aa18.47■□□□□ 0.55
GPC1-207ENST00000466624 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa18.47■□□□□ 0.55
GPC1-207ENST00000466624 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
GPC1-207ENST00000466624 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa18.46■□□□□ 0.55
GPC1-207ENST00000466624 PTPDC1A2A3K4 754 aa18.46■□□□□ 0.55
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GPC1-207ENST00000466624 HOXD10P28358 340 aa18.46■□□□□ 0.55
GPC1-207ENST00000466624 SLC4A3P48751 1232 aa18.46■□□□□ 0.55
GPC1-207ENST00000466624 PRMT2P55345 433 aa18.46■□□□□ 0.55
GPC1-207ENST00000466624 KCTD2Q14681 263 aa18.46■□□□□ 0.55
GPC1-207ENST00000466624 MUM1L1Q5H9M0 696 aa18.46■□□□□ 0.55
GPC1-207ENST00000466624 WDR78Q5VTH9 848 aa18.46■□□□□ 0.55
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GPC1-207ENST00000466624 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa18.46■□□□□ 0.55
GPC1-207ENST00000466624 SOCS4Q8WXH5 440 aa18.46■□□□□ 0.55
GPC1-207ENST00000466624 PRDM10Q9NQV6 1147 aa18.46■□□□□ 0.55
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GPC1-207ENST00000466624 MMP19Q99542 508 aa18.45■□□□□ 0.54
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GPC1-207ENST00000466624 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
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GPC1-207ENST00000466624 NUDT12Q9BQG2 462 aa18.44■□□□□ 0.54
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GPC1-207ENST00000466624 GJD2Q9UKL4 321 aa18.44■□□□□ 0.54
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GPC1-207ENST00000466624 ADORA2AP29274 412 aa18.43■□□□□ 0.54
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GPC1-207ENST00000466624 OTOP1Q7RTM1 612 aa18.43■□□□□ 0.54
GPC1-207ENST00000466624 CCDC148Q8NFR7 591 aa18.43■□□□□ 0.54
GPC1-207ENST00000466624 GLT8D2Q9H1C3 349 aa18.43■□□□□ 0.54
GPC1-207ENST00000466624 CYP39A1Q9NYL5 469 aa18.43■□□□□ 0.54
GPC1-207ENST00000466624 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
GPC1-207ENST00000466624 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa18.42■□□□□ 0.54
GPC1-207ENST00000466624 JAK2O60674 1132 aa18.42■□□□□ 0.54
GPC1-207ENST00000466624 PPFIA3O75145 1194 aa18.42■□□□□ 0.54
GPC1-207ENST00000466624 RGS2P41220 211 aa18.42■□□□□ 0.54
GPC1-207ENST00000466624 HSD17B4P51659 736 aa18.42■□□□□ 0.54
GPC1-207ENST00000466624 NAPAP54920 295 aa18.42■□□□□ 0.54
GPC1-207ENST00000466624 IRF5Q13568 498 aa18.42■□□□□ 0.54
GPC1-207ENST00000466624 TYW1BQ6NUM6 668 aa18.42■□□□□ 0.54
GPC1-207ENST00000466624 NSMFQ6X4W1 530 aa18.42■□□□□ 0.54
GPC1-207ENST00000466624 RNF207Q6ZRF8 634 aa18.42■□□□□ 0.54
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