RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
ACTB-201ENST00000331789 CCDC34Q96HJ3 373 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-201ENST00000331789 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-201ENST00000331789 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-201ENST00000331789 MYH7BA7E2Y1 1941 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-201ENST00000331789 IKBKBO14920 756 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-201ENST00000331789 SMC2O95347 1197 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-201ENST00000331789 TNNI2P48788 182 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-201ENST00000331789 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
ACTB-201ENST00000331789 DPYDQ12882 1025 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-201ENST00000331789 IKQ13123 557 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
ACTB-201ENST00000331789 SYDE2Q5VT97 1194 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-201ENST00000331789 NRBP1Q9UHY1 535 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-201ENST00000331789 LTBP3Q9NS15 1303 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 TXLNAP40222 546 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 POTEDQ86YR6 584 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP20.26■□□□□ 0.832e-12■■■□□ 16.7
ACTB-201ENST00000331789 HSD3B7Q9H2F3 369 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 GJA3Q9Y6H8 435 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 TDP2O95551 362 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 CDC25BP30305 580 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 TRIML1Q8N9V2 468 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 MTRQ99707 1265 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 TMX2Q9Y320 296 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 RPS12P25398 132 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 CAP2P40123 477 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 RASA3Q14644 834 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 BTNL9Q6UXG8 535 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 SAMD7Q7Z3H4 446 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 MICALL2Q8IY33 904 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 PLIN2Q99541 437 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 BLZF1Q9H2G9 400 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 USP17L15C9J2P7 530 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 USP17L13C9JLJ4 530 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 USP17L11C9JVI0 530 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 USP17L18D6R9N7 530 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 USP17L22D6RA61 530 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 USP17L17D6RBQ6 530 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 USP17L19D6RCP7 530 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 USP17L20D6RJB6 530 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 FZD9O00144 591 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 SLC37A4O43826 429 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 PTGS1P23219 599 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 UBA7P41226 1012 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 STAT6P42226 847 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 TPM4P67936 248 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 MYL5Q02045 173 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 USP17L24Q0WX57 530 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 USP17L6PQ6QN14 398 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 CCDC186Q7Z3E2 898 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 MLKLQ8NB16 471 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 CCSER1Q9C0I3 900 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 KCNF1Q9H3M0 494 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 DISC1Q9NRI5 854 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 TECP42680 631 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 MAP3K10Q02779 954 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 MTMR9Q96QG7 549 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 SMCHD1A6NHR9 2005 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 TXKP42681 527 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP20.23■□□□□ 0.831e-47■□□□□ 8.3
ACTB-201ENST00000331789 CUL4BQ13620 913 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 USH1GQ495M9 461 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 FAM83BQ5T0W9 1011 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 RRAGBQ5VZM2 374 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 FBXO11Q86XK2 927 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 AMNQ9BXJ7 453 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 GOPCQ9HD26 462 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 PRR12Q9ULL5 1215 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 ATAD5Q96QE3 1844 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 TPM3P06753 285 aa20.22■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 ATP1A3P13637 1013 aa20.22■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 MMP14P50281 582 aa20.22■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 CALCRLQ16602 461 aa20.22■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 NAALADL2Q58DX5 795 aa20.22■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 RASSF8Q8NHQ8 419 aa20.22■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 TEPSINQ96N21 525 aa20.22■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 GSDMAQ96QA5 445 aa20.22■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 CCDC144BQ3MJ40 725 aa20.21■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 CABP7Q86V35 215 aa20.21■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 LRRC15Q8TF66 581 aa20.21■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 DPF2Q92785 391 aa20.21■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 AK8Q96MA6 479 aa20.21■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 FANCLQ9NW38 375 aa20.21■□□□□ 0.83
ACTB-201ENST00000331789 IFNKQ9P0W0 207 aa20.21■□□□□ 0.83
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