RNA–Protein interactions for RNA: YML063W

RPS1B, Transcript of Ribosomal protein 10 (rp10) of the small (40S) subunit, yeast

Gene RPS1B, Length 768 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS1B	YML063W	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.38	□□□□□ -1.71	not detected
RPS1B	YML063W	HXT14	P42833	540 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	VTC3	Q02725	835 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	YDR239C	Q03780	787 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	BUD7	Q08754	746 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	FRE5	Q08908	694 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	DAP2	P18962	818 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	RAD51	P25454	400 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	YCR061W	P25639	631 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	NTH1	P32356	751 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	STE14	P32584	239 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	YME2	P32843	850 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	PMT1	P33775	817 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	YUH1	P35127	236 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	YHR112C	P38716	378 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	MUP3	P38734	546 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	CTM1	P38818	585 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	MND2	P40577	368 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	MMM1	P41800	426 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	CTK2	P46962	323 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	KEL2	P50090	882 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	YGR266W	P53326	701 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	ARR3	Q06598	404 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	PLP2	Q12017	286 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	MED2	Q12124	431 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	SWM1	Q12379	170 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	PMD1	P32634	1753 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	HIP1	P06775	603 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	YML003W	P0CF16	290 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	PUT4	P15380	627 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	PRD1	P25375	712 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	NDI1	P32340	513 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	SLM4	P38247	162 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	MEF2	P39677	819 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	YTA12	P40341	825 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	SMC3	P47037	1230 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	PET130	P47065	347 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	URB2	P47108	1174 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	EFM3	P47163	339 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	COX18	P53239	316 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	SKO1	Q02100	647 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	YPR172W	Q06608	200 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	YFH1	Q07540	174 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	VPS54	Q12071	889 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	UBX3	Q12229	455 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	RPO41	P13433	1351 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	GAL80	P04387	435 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	PDE1	P22434	369 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	VMA16	P23968	213 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	EMC1	P25574	760 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	DSS4	P32601	143 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	RML2	P32611	393 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.35	□□□□□ -1.71	not detected
RPS1B	YML063W	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	MRPL4	P36517	319 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	YBL028C	P38202	106 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	YHL017W	P38745	532 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	PEX7	P39108	375 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	UBP5	P39944	805 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	EPL1	P43572	832 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	CTR1	P49573	406 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	TAM41	P53230	385 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	AQR1	P53943	586 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	ECM18	Q04623	453 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	YDR061W	Q12298	539 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	DFG16	Q99234	619 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	YLR358C	O13565	187 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
RPS1B	YML063W	ADH7	P25377	361 aa		4.34	□□□□□ -1.71

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