RNA–Protein interactions for RNA: YKR015C

YKR015C, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YKR015C, Length 1,707 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKR015C	YKR015C	VTC2	P43585	828 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YKR015C	YKR015C	DSD1	P53095	428 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YKR015C	YKR015C	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
YKR015C	YKR015C	RSM28	Q03430	361 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YKR015C	YKR015C	ARP9	Q05123	467 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YKR015C	YKR015C	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
YKR015C	YKR015C	PSR1	Q07800	427 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YKR015C	YKR015C	CKA1	P15790	372 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YKR015C	YKR015C	GSH1	P32477	678 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YKR015C	YKR015C	RGI2	P40188	164 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YKR015C	YKR015C	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
YKR015C	YKR015C	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
YKR015C	YKR015C	MLH2	Q07980	695 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YKR015C	YKR015C	NRT1	Q08485	598 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YKR015C	YKR015C	YPL272C	Q08984	517 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YKR015C	YKR015C	ERP4	Q12450	207 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YKR015C	YKR015C	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
YKR015C	YKR015C	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
YKR015C	YKR015C	ARG3	P05150	338 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YKR015C	YKR015C	CBS1	P14066	229 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YKR015C	YKR015C	PEP3	P27801	918 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YKR015C	YKR015C	NFU1	P32860	256 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YKR015C	YKR015C	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
YKR015C	YKR015C	UIP3	P39547	235 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YKR015C	YKR015C	ECM10	P39987	644 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YKR015C	YKR015C	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
YKR015C	YKR015C	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
YKR015C	YKR015C	YEH1	Q07804	573 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YKR015C	YKR015C	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YKR015C	YKR015C	VMA16	P23968	213 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YKR015C	YKR015C	POL4	P25615	582 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YKR015C	YKR015C	UBP13	P38187	747 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YKR015C	YKR015C	SPO22	P40511	975 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YKR015C	YKR015C	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YKR015C	YKR015C	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YKR015C	YKR015C	YGR066C	P53242	292 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YKR015C	YKR015C	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YKR015C	YKR015C	GRS2	Q06817	618 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YKR015C	YKR015C	SFI1	Q12369	946 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YKR015C	YKR015C	SPE4	Q12455	300 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YKR015C	YKR015C	RRI1	Q12468	440 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YKR015C	YKR015C	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YKR015C	YKR015C	CNA1	P23287	553 aa		4.21	□□□□□ -1.73
YKR015C	YKR015C	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.73
YKR015C	YKR015C	ADH7	P25377	361 aa		4.21	□□□□□ -1.73
YKR015C	YKR015C	YIH1	P25637	258 aa		4.21	□□□□□ -1.73
YKR015C	YKR015C	PKP1	P40530	394 aa		4.21	□□□□□ -1.73
YKR015C	YKR015C	CTK2	P46962	323 aa		4.21	□□□□□ -1.73
YKR015C	YKR015C	YPT11	P48559	417 aa		4.21	□□□□□ -1.73
YKR015C	YKR015C	YML037C	Q03703	340 aa		4.21	□□□□□ -1.73
YKR015C	YKR015C	PHO2	P07269	559 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YKR015C	YKR015C	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.21	□□□□□ -1.74	not detected
YKR015C	YKR015C	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YKR015C	YKR015C	RED1	P14291	827 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YKR015C	YKR015C	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YKR015C	YKR015C	ROX1	P25042	368 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YKR015C	YKR015C	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YKR015C	YKR015C	RKM3	P38222	552 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YKR015C	YKR015C	MET30	P39014	640 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YKR015C	YKR015C	BUR6	P40096	142 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YKR015C	YKR015C	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YKR015C	YKR015C	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YKR015C	YKR015C	THI3	Q07471	609 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YKR015C	YKR015C	INP53	Q12271	1107 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YKR015C	YKR015C	YPT6	Q99260	215 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YKR015C	YKR015C	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YKR015C	YKR015C	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YKR015C	YKR015C	REG2	P38232	338 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YKR015C	YKR015C	CCT6	P39079	546 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YKR015C	YKR015C	MET28	P40573	187 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YKR015C	YKR015C	YJL107C	P42947	387 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YKR015C	YKR015C	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YKR015C	YKR015C	SMC3	P47037	1230 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YKR015C	YKR015C	YPR003C	P53394	754 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YKR015C	YKR015C	SCW10	Q04951	389 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YKR015C	YKR015C	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YKR015C	YKR015C	MET17	P06106	444 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YKR015C	YKR015C	PET111	P08468	800 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YKR015C	YKR015C	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
YKR015C	YKR015C	ERG3	P32353	365 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YKR015C	YKR015C	YIL169C	P40442	995 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YKR015C	YKR015C	CDC1	P40986	491 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YKR015C	YKR015C	DIA3	P52290	468 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YKR015C	YKR015C	YGL260W	P53056	76 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YKR015C	YKR015C	ATG9	Q12142	997 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YKR015C	YKR015C	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
YKR015C	YKR015C	YFL068W	P0CX99	160 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YKR015C	YKR015C	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YKR015C	YKR015C	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YKR015C	YKR015C	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YKR015C	YKR015C	VID30	P53076	958 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YKR015C	YKR015C	YLR455W	Q06188	304 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YKR015C	YKR015C	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YKR015C	YKR015C	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YKR015C	YKR015C	SPE2	P21182	396 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YKR015C	YKR015C	YKL050C	P35736	922 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YKR015C	YKR015C	SRO77	P38163	1010 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YKR015C	YKR015C	MUM2	P38236	366 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YKR015C	YKR015C	YEL057C	P39983	233 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YKR015C	YKR015C	YFR020W	P43600	232 aa		4.18	□□□□□ -1.74

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 71.3 ms