RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 INF2Q27J81 1249 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 SDCCAG3Q96C92 435 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP5.41□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 DISP3Q9P2K9 1392 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 PODXLO00592 558 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 SNAPC5O75971 98 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 KRT79Q5XKE5 535 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 TTC6Q86TZ1 520 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP5.41□□□□□ -1.54
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PTPRD-201ENST00000355233 SCOCQ9UIL1 159 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 MAP3K19Q56UN5 1328 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 MYH2Q9UKX2 1941 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 ABCA6Q8N139 1617 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
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PTPRD-201ENST00000355233 MYH3P11055 1940 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 RPS6KB1P23443 525 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 GPTP24298 496 aa5.4□□□□□ -1.54
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PTPRD-201ENST00000355233 PROM2Q8N271 834 aa5.4□□□□□ -1.54
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PTPRD-201ENST00000355233 ATP2B3Q16720 1220 aa5.4□□□□□ -1.54
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PTPRD-201ENST00000355233 XAGE3Q8WTP9 111 aa5.4□□□□□ -1.54
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PTPRD-201ENST00000355233 GSDMAQ96QA5 445 aa5.4□□□□□ -1.54
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PTPRD-201ENST00000355233 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP5.4□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 SPTLC3Q9NUV7 552 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 DENND2AQ9ULE3 1009 aa5.4□□□□□ -1.54
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PTPRD-201ENST00000355233 ORAI2Q96SN7 254 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 MBIPQ9NS73 344 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa5.4□□□□□ -1.54
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PTPRD-201ENST00000355233 SV2BQ7L1I2 683 aa5.4□□□□□ -1.55
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PTPRD-201ENST00000355233 DPY19L2Q6NUT2 758 aa5.4□□□□□ -1.55
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PTPRD-201ENST00000355233 USP16Q9Y5T5 823 aa5.4□□□□□ -1.55
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PTPRD-201ENST00000355233 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
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PTPRD-201ENST00000355233 POLR3EQ9NVU0 708 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 MPP6Q9NZW5 540 aa5.39□□□□□ -1.55
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