RNA–Protein interactions for RNA: tK(UUU)P

tK(UUU)P, Transcript of Lysine tRNA (tRNA-Lys), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tK(UUU)P, Length 73 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tK(UUU)PtK(UUU)P URA7P28274 579 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P HRR25P29295 494 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P MF(ALPHA)2P32435 120 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P RIM1P32445 135 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P AIM26P32858 118 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P NFU1P32860 256 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P DOM34P33309 386 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P YKL100CP34248 587 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P NTR2P36118 322 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P RPF2P36160 344 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P LDB7P38210 180 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P TRM7P38238 310 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P OCA5P38738 679 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P WSC4P38739 605 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P SEO1P39709 593 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P HAT2P39984 401 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P SSU1P41930 458 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P ZIM17P42844 174 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P CTK3P46963 296 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P TAH11P47112 604 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P NBP35P52920 328 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P YGR250CP53316 781 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P VAC7P53950 1165 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P PRO2P54885 456 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P NHX1Q04121 633 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P RRN11Q04712 507 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P DIC1Q06143 298 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P ATG23Q06671 453 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P SMF3Q12078 473 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P SKM1Q12469 655 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P HSH49Q99181 213 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P NOP14Q99207 810 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P ACC1Q00955 2233 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P TOR1P35169 2470 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P GAL4P04386 881 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P CMD1P06787 147 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P GCR1P07261 785 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P SWI5P08153 709 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P RPB4P20433 221 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P CIN8P27895 1000 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P CWP1P28319 239 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P GCD6P32501 712 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P YME1P32795 747 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P TFC3P34111 1160 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P EMC3P36039 253 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P PBP2P38151 413 aaKnown RBP RIP-Chip data3.25□□□□□ -1.89not detected
tK(UUU)PtK(UUU)P YHR033WP38690 423 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P DED81P38707 554 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P DMA1P38823 416 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P REV7P38927 245 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P YEL073CP39974 107 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P SPF1P39986 1215 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P YER034WP40022 185 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P TES1P41903 349 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P MTO1P53070 669 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P MPS2P53159 387 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P RIM8P53179 542 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P GND2P53319 492 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P NAM8Q00539 523 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P YDR132CQ03900 495 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P URH1Q04179 340 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P YDR278CQ05612 105 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P ADE13Q05911 482 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P RSC2Q06488 889 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P CUE5Q08412 411 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P VHS3Q08438 674 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P NUR1Q12066 484 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P LEU9Q12166 604 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P ADH4P10127 382 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P NSP1P14907 823 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P CBF1P17106 351 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P STE4P18851 423 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P TRX2P22803 104 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P KAR4P25583 335 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P NTH1P32356 751 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P GCD11P32481 527 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P PET309P32522 965 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P GDA1P32621 518 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P CDC13P32797 924 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P IRS4P36115 615 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P LAS1P36146 502 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P MRPL37P36532 105 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P SPP381P38282 291 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P RIM11P38615 370 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P MNN1P39106 762 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P CEM1P39525 442 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P LSM5P40089 93 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P ALR2P43553 858 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P DUG1P43616 481 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P CIS3P47001 227 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P NRM1P53718 249 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P RHO3Q00245 231 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P OSH6Q02201 448 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P SPP2Q02521 185 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P RCO1Q04779 684 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P CDC123Q05791 360 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P YLR177WQ06251 628 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P RSC3Q06639 885 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P SYT1Q06836 1226 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)PtK(UUU)P BUD20Q08004 166 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 43.5 ms