RNA–Protein interactions for RNA: YLR349W

YLR349W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLR349W, Length 507 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR349WYLR349W CTK1Q03957 528 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
YLR349WYLR349W LDB17Q12342 491 aa9.05□□□□□ -0.96
YLR349WYLR349W VAC17P25591 423 aa9.04□□□□□ -0.96
YLR349WYLR349W IMG1P25626 169 aa9.04□□□□□ -0.96
YLR349WYLR349W MSH1P25846 959 aa9.04□□□□□ -0.96
YLR349WYLR349W PET112P33893 541 aa9.04□□□□□ -0.96
YLR349WYLR349W YHR210CP38893 341 aa9.04□□□□□ -0.96
YLR349WYLR349W PLB1P39105 664 aa9.04□□□□□ -0.96
YLR349WYLR349W ELP2P42935 788 aa9.04□□□□□ -0.96
YLR349WYLR349W YJR030CP47101 745 aa9.04□□□□□ -0.96
YLR349WYLR349W VPS75P53853 264 aa9.04□□□□□ -0.96
YLR349WYLR349W ADE12P80210 433 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
YLR349WYLR349W MET14Q02196 202 aa9.04□□□□□ -0.96
YLR349WYLR349W OSH6Q02201 448 aa9.04□□□□□ -0.96
YLR349WYLR349W CDC9P04819 755 aa9.03□□□□□ -0.96
YLR349WYLR349W PMS1P14242 873 aa9.03□□□□□ -0.96
YLR349WYLR349W DBP2P24783 546 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
YLR349WYLR349W FMP46P36141 133 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
YLR349WYLR349W TRM7P38238 310 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
YLR349WYLR349W PTC2P39966 464 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
YLR349WYLR349W ALG8P40351 577 aa9.03□□□□□ -0.96
YLR349WYLR349W GTS1P40956 396 aa9.03□□□□□ -0.96
YLR349WYLR349W TRM9P49957 279 aa9.03□□□□□ -0.96
YLR349WYLR349W ZRG17P53735 605 aa9.03□□□□□ -0.96
YLR349WYLR349W EFM6P53970 246 aa9.03□□□□□ -0.96
YLR349WYLR349W SLU7Q02775 382 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
YLR349WYLR349W DIN7Q12086 430 aa9.03□□□□□ -0.96
YLR349WYLR349W CYR1P08678 2026 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W FUM1P08417 488 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W DEF1P35732 738 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W FTH1P38310 465 aa9.02□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W IME4P41833 600 aa9.02□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W TFG2P41896 400 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W STR2P47164 639 aa9.02□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W ASK10P48361 1146 aa9.02□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W ERG5P54781 538 aa9.02□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W CCE1Q03702 353 aa9.02□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W RSF1Q05043 376 aa9.02□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W HSP42Q12329 375 aa9.02□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W CMR1Q12510 522 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W AMD1P15274 810 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W RSC6P25632 483 aa9.01□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W NDI1P32340 513 aa9.01□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W CKB2P38930 258 aa9.01□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W SGF73P53165 657 aa9.01□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W TRS31Q03337 283 aa9.01□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W FAP7Q12055 197 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W URA4P20051 364 aa9□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W TAH11P47112 604 aa9□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W ESF2P53743 316 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W RPN9Q04062 393 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W VTA1Q06263 330 aa9□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W CDA1Q06702 301 aa9□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W MCA1Q08601 432 aa9□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W HRK1Q08732 759 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W MCD1Q12158 566 aa9□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W YLR462WO13556 202 aa8.99□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W YHL049CP38722 271 aa8.99□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W GIM4P40005 111 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W ALA1P40825 983 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W YFL064CP43540 174 aa8.99□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W HLJ1P48353 224 aa8.99□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W RRN11Q04712 507 aa8.99□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W SOV1Q04748 898 aa8.99□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W YBL111CQ3E7Y5 667 aa8.99□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W HSH49Q99181 213 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W SEM1O94742 89 aa8.98□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W RRP43P25359 394 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W MSP1P28737 362 aa8.98□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W ATP11P32453 318 aa8.98□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W MEI5P32489 222 aa8.98□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W NIP1P32497 812 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W RPF2P36160 344 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W UBA4P38820 440 aa8.98□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W ACO2P39533 789 aa8.98□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W LCP5P40079 357 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W YIL086CP40503 102 aa8.98□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W FHN1P53279 174 aa8.98□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W UTP5Q04177 643 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W RSC3Q06639 885 aa8.98□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W YBL029C-AQ3E756 94 aa8.98□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W ERG20P08524 352 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W GDA1P32621 518 aa8.97□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W SRP101P32916 621 aa8.97□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W GIC1P38785 314 aa8.97□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W SSN3P39073 555 aa8.97□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W PFA3P42836 336 aa8.97□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W KAP114P53067 1004 aa8.97□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W AAT1Q01802 451 aa8.97□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W BLS1Q06071 122 aa8.97□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W BUD20Q08004 166 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W WSC3Q12215 556 aa8.97□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W GTT2Q12390 233 aa8.97□□□□□ -0.97
YLR349WYLR349W MDM35O60200 86 aa8.96□□□□□ -0.98
YLR349WYLR349W FUR1P18562 216 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
YLR349WYLR349W PRI2P20457 528 aa8.96□□□□□ -0.98
YLR349WYLR349W HEM12P32347 362 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
YLR349WYLR349W CNS1P33313 385 aa8.96□□□□□ -0.98
YLR349WYLR349W STB6P36085 766 aa8.96□□□□□ -0.98
YLR349WYLR349W MRPL10P36520 322 aa8.96□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 28.5 ms