RNA–Protein interactions for RNA: YDR457W

TOM1, Transcript of E3 ubiquitin ligase of the hect-domain class, yeast

Gene TOM1, Length 9,807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TOM1	YDR457W	YRF1-4	O13559	1382 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	SWI5	P08153	709 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	DAL2	P25335	343 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	PER1	P25625	357 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	HIR2	P32480	875 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	AAD10	P47182	288 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	SOL4	P53315	255 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	FRK1	Q03002	865 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	PEX10	Q05568	337 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	TFC8	Q12308	588 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	HSP42	Q12329	375 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	PDC2	P32896	925 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	SBE22	P38814	852 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	RBG1	P39729	369 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	YMR1	P47147	688 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.76	□□□□□ -1.97	not detected
TOM1	YDR457W	GNP1	P48813	663 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	SPC98	P53540	846 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	HDA1	P53973	706 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	REC8	Q12188	680 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	MST1	P07236	462 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	NAM2	P11325	894 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	ADE1	P27616	306 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	SUL1	P38359	859 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	YMR262W	P38430	313 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	LAG1	P38703	411 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	SKN7	P38889	622 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	ECM10	P39987	644 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	COS10	P52924	374 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	YGR053C	P53234	283 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	GTR2	P53290	341 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	BSC5	P53755	489 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	SLD5	Q03406	294 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	GPI17	Q04080	534 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	TCO89	Q08921	799 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	ATG31	Q12421	196 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	RGS2	Q99188	309 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	RAD51	P25454	400 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	GID7	P25569	745 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	TAF14	P35189	244 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	YCR087C-A	P37263	153 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	PCA1	P38360	1216 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	CHS6	P40955	746 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	RPA14	P50106	137 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	YGR273C	P53329	174 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	RPN4	Q03465	531 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	DCR2	Q05924	578 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	LDB19	Q12502	818 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	IZH4	Q99393	312 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	XRN1	P22147	1528 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	ECM5	Q03214	1411 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	HOP1	P20050	605 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	BCS1	P32839	456 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	POP7	P38291	140 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	PIH1	P38768	344 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	SUR2	P38992	349 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	ERV41	Q04651	352 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	MMS22	Q06164	1454 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	SLX5	P32828	619 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	RIB7	P33312	244 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	FUI1	P38196	639 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	LYS9	P38999	446 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	PLB1	P39105	664 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	PCL6	P40038	420 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.76	□□□□□ -1.97	not detected
TOM1	YDR457W	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	YNL035C	P53962	389 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	CDC14	Q00684	551 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	SSY1	Q03770	852 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	RTT103	Q05543	409 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	CDC73	Q06697	393 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	CYB2	P00175	591 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	SPS4	P09937	338 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		2.75	□□□□□ -1.97

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