RNA–Protein interactions for RNA: YDR107C

TMN2, Transcript of Protein with a role in cellular adhesion and filamentous growth, yeast

Gene TMN2, Length 2,019 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TMN2	YDR107C	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	YIH1	P25637	258 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	ELF1	P36053	145 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	THI2	P38141	450 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	ERC1	P38767	581 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	PET130	P47065	347 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	SNO2	P53823	222 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	YMR187C	Q03236	431 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	GCN5	Q03330	439 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	YDR239C	Q03780	787 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	YDR132C	Q03900	495 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	MLH3	Q12083	715 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	TY1B-BR	Q12193	1756 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	TY1B-GR3	Q12316	1755 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	TY1B-OR	Q92393	1755 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	PDR15	Q04182	1529 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	TRP3	P00937	484 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	REC107	P21651	314 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	BUD14	P27637	709 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	CDC5	P32562	705 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	SMI1	P32566	505 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	CTP1	P38152	299 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	UBC11	P52492	156 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	PDE1	P22434	369 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	CMC1	P36064	111 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	CTR1	P49573	406 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	AMA1	P50082	593 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	SNF12	P53628	566 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	EOS1	P53938	366 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	GRX3	Q03835	250 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	CRN1	Q06440	651 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	AVL9	Q12500	764 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	ULS1	Q08562	1619 aa		4.84	□□□□□ -1.64
TMN2	YDR107C	MRE11	P32829	692 aa		4.84	□□□□□ -1.64
TMN2	YDR107C	SEC66	P33754	206 aa		4.84	□□□□□ -1.64
TMN2	YDR107C	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
TMN2	YDR107C	PHO11	P35842	467 aa		4.84	□□□□□ -1.64
TMN2	YDR107C	PHO12	P38693	467 aa		4.84	□□□□□ -1.64
TMN2	YDR107C	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
TMN2	YDR107C	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
TMN2	YDR107C	TWF1	P53250	332 aa		4.84	□□□□□ -1.64
TMN2	YDR107C	NSG2	P53898	299 aa		4.84	□□□□□ -1.64
TMN2	YDR107C	YNL092W	P53934	400 aa		4.84	□□□□□ -1.64
TMN2	YDR107C	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.64
TMN2	YDR107C	IRC13	Q08630	104 aa		4.84	□□□□□ -1.64
TMN2	YDR107C	RLM1	Q12224	676 aa		4.84	□□□□□ -1.64
TMN2	YDR107C	PSY3	Q12318	242 aa		4.84	□□□□□ -1.64
TMN2	YDR107C	TRM13	Q12383	476 aa		4.84	□□□□□ -1.64
TMN2	YDR107C	AMD2	P22580	549 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TMN2	YDR107C	NTH1	P32356	751 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TMN2	YDR107C	GYP6	P32806	458 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TMN2	YDR107C	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TMN2	YDR107C	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TMN2	YDR107C	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TMN2	YDR107C	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TMN2	YDR107C	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TMN2	YDR107C	YAT1	P80235	687 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TMN2	YDR107C	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TMN2	YDR107C	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TMN2	YDR107C	CTF3	Q12748	733 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TMN2	YDR107C	TPK2	P06245	380 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TMN2	YDR107C	SIR3	P06701	978 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TMN2	YDR107C	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TMN2	YDR107C	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TMN2	YDR107C	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TMN2	YDR107C	SWH1	P35845	1188 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TMN2	YDR107C	YPT10	P38146	199 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TMN2	YDR107C	RRT2	P38332	387 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TMN2	YDR107C	MUP3	P38734	546 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TMN2	YDR107C	YHR054C	P38780	354 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TMN2	YDR107C	NPA3	P47122	385 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TMN2	YDR107C	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TMN2	YDR107C	BUL1	P48524	976 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TMN2	YDR107C	YNR068C	P53754	272 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TMN2	YDR107C	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TMN2	YDR107C	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.82	□□□□□ -1.64	not detected
TMN2	YDR107C	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TMN2	YDR107C	STH1	P32597	1359 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TMN2	YDR107C	COX1	P00401	534 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TMN2	YDR107C	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TMN2	YDR107C	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TMN2	YDR107C	DAP2	P18962	818 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TMN2	YDR107C	FUB1	P25659	250 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TMN2	YDR107C	TFB1	P32776	642 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TMN2	YDR107C	AGP2	P38090	596 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TMN2	YDR107C	SKN7	P38889	622 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TMN2	YDR107C	PCL7	P40186	285 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TMN2	YDR107C	HXT14	P42833	540 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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