RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 GNAQP50148 359 aa13.66□□□□□ -0.22
NISCH-211ENST00000488243 VGLL4Q14135 290 aa13.66□□□□□ -0.22
NISCH-211ENST00000488243 APOA5Q6Q788 366 aa13.66□□□□□ -0.22
NISCH-211ENST00000488243 PNMA1Q8ND90 353 aa13.66□□□□□ -0.22
NISCH-211ENST00000488243 OTUD5Q96G74 571 aa13.66□□□□□ -0.22
NISCH-211ENST00000488243 TMEM47Q9BQJ4 181 aa13.66□□□□□ -0.22
NISCH-211ENST00000488243 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa13.66□□□□□ -0.22
NISCH-211ENST00000488243 ELP3Q9H9T3 547 aa13.66□□□□□ -0.22
NISCH-211ENST00000488243 GOPCQ9HD26 462 aa13.66□□□□□ -0.22
NISCH-211ENST00000488243 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
NISCH-211ENST00000488243 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa13.65□□□□□ -0.22
NISCH-211ENST00000488243 SPDYE5A6NIY4 337 aa13.65□□□□□ -0.22
NISCH-211ENST00000488243 USP17L10C9JJH3 530 aa13.65□□□□□ -0.22
NISCH-211ENST00000488243 CXCL11O14625 94 aa13.65□□□□□ -0.22
NISCH-211ENST00000488243 ZBTB43O43298 467 aa13.65□□□□□ -0.22
NISCH-211ENST00000488243 NMT2O60551 498 aa13.65□□□□□ -0.22
NISCH-211ENST00000488243 PFKFB2O60825 505 aa13.65□□□□□ -0.22
NISCH-211ENST00000488243 SLURP2P0DP57 97 aa13.65□□□□□ -0.22
NISCH-211ENST00000488243 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
NISCH-211ENST00000488243 ZNF654Q8IZM8 581 aa13.65□□□□□ -0.22
NISCH-211ENST00000488243 ZNF280CQ8ND82 737 aa13.65□□□□□ -0.22
NISCH-211ENST00000488243 SLC17A8Q8NDX2 589 aa13.65□□□□□ -0.22
NISCH-211ENST00000488243 NKX2-3Q8TAU0 364 aa13.65□□□□□ -0.22
NISCH-211ENST00000488243 LPAR1Q92633 364 aa13.65□□□□□ -0.22
NISCH-211ENST00000488243 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
NISCH-211ENST00000488243 OPTNQ96CV9 577 aa13.65□□□□□ -0.22
NISCH-211ENST00000488243 TCEANC2Q96MN5 208 aa13.65□□□□□ -0.22
NISCH-211ENST00000488243 LZTS2Q9BRK4 669 aa13.65□□□□□ -0.22
NISCH-211ENST00000488243 LRRC2Q9BYS8 371 aa13.65□□□□□ -0.22
NISCH-211ENST00000488243 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
NISCH-211ENST00000488243 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa13.65□□□□□ -0.22
NISCH-211ENST00000488243 DOCK1Q14185 1865 aa13.65□□□□□ -0.22
NISCH-211ENST00000488243 H0YGN5 161 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 SMARCA1P28370 1054 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 JAG1P78504 1218 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 APOBRQ0VD83 1088 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 TROAPQ12815 778 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 PPIL2Q13356 520 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 ASPRV1Q53RT3 343 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 SIAH1Q8IUQ4 282 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 DCAF4Q8WV16 495 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 GMCL1Q96IK5 515 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 ZNF333Q96JL9 665 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 VCPKMTQ9H867 229 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 TPCN1Q9ULQ1 816 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 ZHX2Q9Y6X8 837 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 OTOFQ9HC10 1997 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 GOLGA8BA8MQT2 603 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 F5H6K3 240 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 CDKL5O76039 1030 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 SNHG28P0DPA3 235 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP13.63□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 BACE1P56817 501 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 ATP2B2Q01814 1243 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 KLRC3Q07444 240 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 SH3D19Q5HYK7 790 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 USP17L2Q6R6M4 530 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 FANCBQ8NB91 859 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 TMX3Q96JJ7 454 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 C12orf42Q96LP6 360 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 BRPF3Q9ULD4 1205 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 GOLGA8AA7E2F4 631 aa13.62□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 PLA2G6O60733 806 aa13.62□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 CUL4AQ13619 759 aa13.62□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 GRM4Q14833 912 aa13.62□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 ME3Q16798 604 aa13.62□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 CHRDL2Q6WN34 429 aa13.62□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 NBPF11Q86T75 865 aa13.62□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 FEZ1Q99689 392 aa13.62□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 KCNH4Q9UQ05 1017 aa13.62□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa13.61□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 A0A1W2PRG0 241 aa13.61□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 WDR46O15213 610 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 PDHBP11177 359 aa13.61□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 SLC1A4P43007 532 aa13.61□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 SPP2Q13103 211 aa13.61□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 ARHGEF6Q15052 776 aa13.61□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 CCL15Q16663 113 aa13.61□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 RTN1Q16799 776 aa13.61□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 SLFN13Q68D06 897 aa13.61□□□□□ -0.23
NISCH-211ENST00000488243 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 130 ms