RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 CETPP11597 493 aa34.49■■■■□ 3.11
ECHS1-201ENST00000368547 HSPA6P17066 643 aa34.49■■■■□ 3.11
ECHS1-201ENST00000368547 MOGSQ13724 837 aa34.49■■■■□ 3.11
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa34.49■■■■□ 3.11
ECHS1-201ENST00000368547 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP34.49■■■■□ 3.11
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP34.49■■■■□ 3.11
ECHS1-201ENST00000368547 CAPNS2Q96L46 248 aa34.49■■■■□ 3.11
ECHS1-201ENST00000368547 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP34.48■■■■□ 3.11
ECHS1-201ENST00000368547 HPS5Q9UPZ3 1129 aa34.48■■■■□ 3.11
ECHS1-201ENST00000368547 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa34.48■■■■□ 3.11
ECHS1-201ENST00000368547 WDR46O15213 610 aaKnown RBP34.48■■■■□ 3.11
ECHS1-201ENST00000368547 CCL15Q16663 113 aa34.48■■■■□ 3.11
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC96Q2M329 555 aa34.48■■■■□ 3.11
ECHS1-201ENST00000368547 FAM83BQ5T0W9 1011 aa34.48■■■■□ 3.11
ECHS1-201ENST00000368547 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP34.48■■■■□ 3.11
ECHS1-201ENST00000368547 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP34.47■■■■□ 3.11
ECHS1-201ENST00000368547 BMP3P12645 472 aa34.47■■■■□ 3.11
ECHS1-201ENST00000368547 STK3Q13188 491 aa34.47■■■■□ 3.11
ECHS1-201ENST00000368547 GRM4Q14833 912 aa34.47■■■■□ 3.11
ECHS1-201ENST00000368547 KCTD1Q719H9 257 aa34.47■■■■□ 3.11
ECHS1-201ENST00000368547 MAP3K14Q99558 947 aa34.47■■■■□ 3.11
ECHS1-201ENST00000368547 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP34.46■■■■□ 3.11
ECHS1-201ENST00000368547 GOLGA8HP0CJ92 632 aa34.46■■■■□ 3.11
ECHS1-201ENST00000368547 RCAN1P53805 252 aa34.46■■■■□ 3.11
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF543Q08ER8 600 aa34.46■■■■□ 3.11
ECHS1-201ENST00000368547 ME3Q16798 604 aa34.46■■■■□ 3.11
ECHS1-201ENST00000368547 TREML2Q5T2D2 321 aa34.46■■■■□ 3.11
ECHS1-201ENST00000368547 FANCBQ8NB91 859 aa34.46■■■■□ 3.11
ECHS1-201ENST00000368547 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP34.46■■■■□ 3.11
ECHS1-201ENST00000368547 BRI3BPQ8WY22 251 aa34.46■■■■□ 3.11
ECHS1-201ENST00000368547 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP34.46■■■■□ 3.11
ECHS1-201ENST00000368547 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP34.45■■■■□ 3.11
ECHS1-201ENST00000368547 GOLGA8AA7E2F4 631 aa34.45■■■■□ 3.11
ECHS1-201ENST00000368547 LARGE1O95461 756 aa34.45■■■■□ 3.11
ECHS1-201ENST00000368547 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP34.45■■■■□ 3.11
ECHS1-201ENST00000368547 MAD2L2Q9UI95 211 aa34.45■■■■□ 3.11
ECHS1-201ENST00000368547 GPCPD1Q9NPB8 672 aa34.44■■■■□ 3.1
ECHS1-201ENST00000368547 CCT2P78371 535 aaKnown RBP34.44■■■■□ 3.1
ECHS1-201ENST00000368547 NOGQ13253 232 aa34.44■■■■□ 3.1
ECHS1-201ENST00000368547 ASPRV1Q53RT3 343 aa34.44■■■■□ 3.1
ECHS1-201ENST00000368547 STAG2Q8N3U4 1231 aa34.44■■■■□ 3.1
ECHS1-201ENST00000368547 ZIC5Q96T25 663 aa34.44■■■■□ 3.1
ECHS1-201ENST00000368547 TANGO6Q9C0B7 1094 aa34.44■■■■□ 3.1
ECHS1-201ENST00000368547 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa34.44■■■■□ 3.1
ECHS1-201ENST00000368547 KIF5BP33176 963 aa34.43■■■■□ 3.1
ECHS1-201ENST00000368547 RTN1Q16799 776 aa34.43■■■■□ 3.1
ECHS1-201ENST00000368547 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP34.43■■■■□ 3.1
ECHS1-201ENST00000368547 GPAT2Q6NUI2 795 aa34.43■■■■□ 3.1
ECHS1-201ENST00000368547 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP34.43■■■■□ 3.1
ECHS1-201ENST00000368547 NID2Q14112 1375 aa34.43■■■■□ 3.1
ECHS1-201ENST00000368547 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP34.42■■■■□ 3.1
ECHS1-201ENST00000368547 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP34.42■■■■□ 3.1
ECHS1-201ENST00000368547 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP34.42■■■■□ 3.1
ECHS1-201ENST00000368547 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP34.42■■■■□ 3.1
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM232C9JQI7 657 aa34.41■■■■□ 3.1
ECHS1-201ENST00000368547 PFKFB2O60825 505 aa34.41■■■■□ 3.1
ECHS1-201ENST00000368547 AOC2O75106 756 aa34.41■■■■□ 3.1
ECHS1-201ENST00000368547 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP34.41■■■■□ 3.1
ECHS1-201ENST00000368547 TTBK2Q6IQ55 1244 aa34.41■■■■□ 3.1
ECHS1-201ENST00000368547 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP34.41■■■■□ 3.1
ECHS1-201ENST00000368547 PARP14Q460N5 1801 aa34.41■■■■□ 3.1
ECHS1-201ENST00000368547 CDC27P30260 824 aa34.41■■■■□ 3.1
ECHS1-201ENST00000368547 VEGFBP49765 207 aa34.41■■■■□ 3.1
ECHS1-201ENST00000368547 TMX3Q96JJ7 454 aa34.41■■■■□ 3.1
ECHS1-201ENST00000368547 PTPN18Q99952 460 aa34.41■■■■□ 3.1
ECHS1-201ENST00000368547 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP34.41■■■■□ 3.1
ECHS1-201ENST00000368547 USP17L15C9J2P7 530 aa34.4■■■■□ 3.1
ECHS1-201ENST00000368547 BTBD19C9JJ37 291 aa34.4■■■■□ 3.1
ECHS1-201ENST00000368547 USP17L13C9JLJ4 530 aa34.4■■■■□ 3.1
ECHS1-201ENST00000368547 USP17L11C9JVI0 530 aa34.4■■■■□ 3.1
ECHS1-201ENST00000368547 KLRF2D3W0D1 207 aa34.4■■■■□ 3.1
ECHS1-201ENST00000368547 USP17L18D6R9N7 530 aa34.4■■■■□ 3.1
ECHS1-201ENST00000368547 USP17L22D6RA61 530 aa34.4■■■■□ 3.1
ECHS1-201ENST00000368547 USP17L17D6RBQ6 530 aa34.4■■■■□ 3.1
ECHS1-201ENST00000368547 USP17L19D6RCP7 530 aa34.4■■■■□ 3.1
ECHS1-201ENST00000368547 USP17L20D6RJB6 530 aa34.4■■■■□ 3.1
ECHS1-201ENST00000368547 USP17L24Q0WX57 530 aa34.4■■■■□ 3.1
ECHS1-201ENST00000368547 NECAB1Q8N987 351 aa34.4■■■■□ 3.1
ECHS1-201ENST00000368547 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP34.4■■■■□ 3.1
ECHS1-201ENST00000368547 ADD1P35611 737 aaKnown RBP34.39■■■■□ 3.1
ECHS1-201ENST00000368547 INHBEP58166 350 aa34.39■■■■□ 3.1
ECHS1-201ENST00000368547 SCRN1Q12765 414 aa34.39■■■■□ 3.1
ECHS1-201ENST00000368547 PPP2R5BQ15173 497 aa34.39■■■■□ 3.1
ECHS1-201ENST00000368547 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa34.39■■■■□ 3.1
ECHS1-201ENST00000368547 CPVLQ9H3G5 476 aa34.39■■■■□ 3.1
ECHS1-201ENST00000368547 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP34.39■■■■□ 3.1
ECHS1-201ENST00000368547 FBXO28Q9NVF7 368 aa34.39■■■■□ 3.1
ECHS1-201ENST00000368547 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP34.38■■■■□ 3.09
ECHS1-201ENST00000368547 SLC16A2P36021 539 aa34.38■■■■□ 3.09
ECHS1-201ENST00000368547 STAT2P52630 851 aa34.38■■■■□ 3.09
ECHS1-201ENST00000368547 SREBF2Q12772 1141 aa34.38■■■■□ 3.09
ECHS1-201ENST00000368547 IKQ13123 557 aaPredicted RBP34.38■■■■□ 3.09
ECHS1-201ENST00000368547 ANKRD23Q86SG2 305 aa34.38■■■■□ 3.09
ECHS1-201ENST00000368547 UBA5Q9GZZ9 404 aa34.38■■■■□ 3.09
ECHS1-201ENST00000368547 FEM1BQ9UK73 627 aa34.38■■■■□ 3.09
ECHS1-201ENST00000368547 RLFQ13129 1914 aa34.38■■■■□ 3.09
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa34.37■■■■□ 3.09
ECHS1-201ENST00000368547 FLOT1O75955 427 aa34.37■■■■□ 3.09
ECHS1-201ENST00000368547 PLEKHA8P1O95397 391 aa34.37■■■■□ 3.09
ECHS1-201ENST00000368547 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP34.37■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 91.7 ms