RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362827.1

RNU6-446P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 446, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-446P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-446P-201ENST00000362827 KRT2P35908 639 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-446P-201ENST00000362827 TAF6P49848 677 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-446P-201ENST00000362827 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-446P-201ENST00000362827 NR1H3Q13133 447 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-446P-201ENST00000362827 SLFNL1Q499Z3 407 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-446P-201ENST00000362827 SLC44A4Q53GD3 710 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-446P-201ENST00000362827 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-446P-201ENST00000362827 ERICH6Q7L0X2 663 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-446P-201ENST00000362827 IL17DQ8TAD2 202 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-446P-201ENST00000362827 BSNDQ8WZ55 320 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-446P-201ENST00000362827 NR4A3Q92570 626 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-446P-201ENST00000362827 PTPN18Q99952 460 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-446P-201ENST00000362827 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-446P-201ENST00000362827 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-446P-201ENST00000362827 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-446P-201ENST00000362827 ZNF358Q9NW07 568 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-446P-201ENST00000362827 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 TMPRSS2O15393 492 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 B4GALT3O60512 393 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 CYP7A1P22680 504 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 ARL4AP40617 200 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 EPHA4P54764 986 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 ERVFRD-1P60508 538 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 PSME1Q06323 249 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 VAC14Q08AM6 782 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 LCE3CQ5T5A8 94 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 MYSM1Q5VVJ2 828 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 OLFML1Q6UWY5 402 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 VN1R5Q7Z5H4 357 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 EDAQ92838 391 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 FCRL4Q96PJ5 515 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 WDR18Q9BV38 432 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 SPRY2O43597 315 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 KIF4AO95239 1232 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 PRG2P13727 222 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 ATF2P15336 505 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 EPHB4P54760 987 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 ID3Q02535 119 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 FAM26FQ5R3K3 315 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 GFI1BQ5VTD9 330 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 RNF111Q6ZNA4 994 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 KREMEN1Q96MU8 473 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 DISC1Q9NRI5 854 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 DUSP13Q9UII6 198 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 WDR91A4D1P6 747 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 WASH4PA8MWX3 477 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 NTN1O95631 604 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 CGAP01215 116 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 NAALADL2Q58DX5 795 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 KCNV2Q8TDN2 545 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 ISL2Q96A47 359 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 ZBTB8AQ96BR9 441 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 NRSN2Q9GZP1 204 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 KLK14Q9P0G3 267 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 PROCRQ9UNN8 238 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 TRPA1O75762 1119 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 ACRP10323 421 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 COMTP21964 271 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 NR4A1P22736 598 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 HOXC13P31276 330 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 KRTAP12-2P59991 146 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 AGBL4Q5VU57 503 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 POTEAQ6S8J7 498 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 SH2D6Q7Z4S9 175 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 MTMR14Q8NCE2 650 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 SIMC1Q8NDZ2 872 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 SYNPO2LQ9H987 977 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP0.42□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 NOTOA8MTQ0 251 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 PRSS44E7EML9 344 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 INSIG1O15503 277 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 FOXS1O43638 330 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 ECEL1O95672 775 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 EFEMP2O95967 443 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 LIG1P18858 919 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 BMP8BP34820 402 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 CLK2P49760 499 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP0.42□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 CYB5RLQ6IPT4 315 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 RPTNQ6XPR3 784 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-446P-201ENST00000362827 CEP128Q6ZU80 1094 aa0.42□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.2 ms