RNA–Protein interactions for RNA: YLR407W

YLR407W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YLR407W, Length 687 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLR407W	YLR407W	MTF2	P10849	440 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	TUP1	P16649	713 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	APL3	P38065	1025 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	CTP1	P38152	299 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	FUI1	P38196	639 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	CAJ1	P39101	391 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	YNL195C	P40168	261 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	EFM4	P40516	257 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	STB2	P46679	850 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	SMC3	P47037	1230 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	MPS3	P47069	682 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	COS5	P47187	383 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	TAM41	P53230	385 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	MDR1	P53258	950 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	YMR321C	Q04898	105 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	DON1	Q05610	365 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	COQ9	Q05779	260 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	YLR297W	Q05899	129 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	OPY2	Q06810	360 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	YDL121C	Q07541	149 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	THI73	Q07904	523 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	SMC5	Q08204	1093 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	SLX4	Q12098	748 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	MOT1	P32333	1867 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	TPK2	P06245	380 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	SWI6	P09959	803 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	PET123	P17558	318 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	HXT1	P32465	570 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	RGT1	P32862	1170 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	HSL7	P38274	827 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	ERC1	P38767	581 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	SEC9	P40357	651 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	IES1	P43579	692 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	GPG1	P53130	126 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	RTT102	P53330	157 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	BOP3	P53958	396 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	STP1	Q00947	519 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	VPS60	Q03390	229 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	SML1	Q04964	104 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	YPR078C	Q06813	372 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	YLR001C	Q07895	862 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	CIR2	Q08822	631 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	DAS2	Q12084	232 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	MDM12	Q92328	271 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	RAD57	P25301	460 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	KIN82	P25341	720 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	SRB4	P32569	687 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	XRS2	P33301	854 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	NIP100	P33420	868 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	HOT13	P36078	116 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	DSS1	P39112	969 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	LAA1	P39526	2014 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	CAF16	P43569	289 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	SHE10	P53075	577 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	ESBP6	P53918	673 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	TIM8	P57744	87 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	VTC3	Q02725	835 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	SND1	Q04007	877 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	TDA9	Q04545	1251 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	VAC14	Q06708	880 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	MLH2	Q07980	695 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	IES4	Q08561	116 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	RKI1	Q12189	258 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLR407W	YLR407W	RIF1	P29539	1916 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLR407W	YLR407W	POX1	P13711	748 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLR407W	YLR407W	CKI1	P20485	582 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLR407W	YLR407W	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YLR407W	YLR407W	MIH1	P23748	554 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLR407W	YLR407W	DPB3	P27344	201 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLR407W	YLR407W	DPH2	P32461	534 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLR407W	YLR407W	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YLR407W	YLR407W	YEL043W	P32618	956 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLR407W	YLR407W	JNM1	P36224	373 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLR407W	YLR407W	APN2	P38207	520 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLR407W	YLR407W	TCD1	P38756	429 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLR407W	YLR407W	BUD16	P39988	312 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLR407W	YLR407W	EAF5	P39995	279 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLR407W	YLR407W	RFX1	P48743	811 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLR407W	YLR407W	MAL13	P53338	473 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLR407W	YLR407W	ARP4	P80428	489 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLR407W	YLR407W	NGL3	Q03210	505 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLR407W	YLR407W	YDR179W-A	Q03983	463 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLR407W	YLR407W	NHX1	Q04121	633 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLR407W	YLR407W	SOV1	Q04748	898 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLR407W	YLR407W	SFI1	Q12369	946 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLR407W	YLR407W	ATP4	P05626	244 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YLR407W	YLR407W	NTH1	P32356	751 aa		4.57	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 11.6 ms