RNA–Protein interactions for RNA: YLR349W

YLR349W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLR349W, Length 507 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR349WYLR349W RSC4Q02206 625 aa9.13□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W SYH1Q02875 849 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W THI7Q05998 598 aa9.13□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W YLR001CQ07895 862 aa9.13□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W NEW1Q08972 1196 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W YPL272CQ08984 517 aa9.13□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W TGL5Q12043 749 aa9.13□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W BMT6Q12291 365 aa9.13□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W CPA1P07258 411 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W HOP1P20050 605 aa9.12□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W SLY1P22213 666 aa9.12□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W MRPL9P31334 269 aa9.12□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W SKN1P33336 771 aa9.12□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W SEF1P34228 1148 aa9.12□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W LSM5P40089 93 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W ATG16Q03818 150 aa9.12□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W RRP12Q12754 1228 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W AI5_ALPHAQ9ZZX1 630 aa9.12□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W RAD10P06838 210 aa9.11□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W PDR1P12383 1068 aa9.11□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W NAR1P23503 491 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W YSP3P25036 478 aa9.11□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W RPN12P32496 274 aa9.11□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W UTR2P32623 467 aa9.11□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W VPS24P36095 224 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W YAT2P40017 923 aa9.11□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W IKS1P47042 667 aa9.11□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W BRO1P48582 844 aa9.11□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W YGR021WP53212 290 aa9.11□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W NUP100Q02629 959 aa9.11□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W CDA2Q06703 312 aa9.11□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W AI4P03878 556 aa9.1□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W ILS1P09436 1072 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W VPS34P22543 875 aa9.1□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W YSR3P23501 404 aa9.1□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W RAD5P32849 1169 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W DOM34P33309 386 aa9.1□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W MRPL37P36532 105 aa9.1□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W YBP1P38315 674 aa9.1□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W RRT2P38332 387 aa9.1□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W CHS7P38843 316 aa9.1□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W SET5P38890 526 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W PMC1P38929 1173 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W YEL073CP39974 107 aa9.1□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W UBX6P47049 396 aa9.1□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W ARP4P80428 489 aa9.1□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W NGL3Q03210 505 aa9.1□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W NRT1Q08485 598 aa9.1□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W BUD7Q08754 746 aa9.1□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W SEC23P15303 768 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W PHO84P25297 587 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W NTH1P32356 751 aa9.09□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W HOG1P32485 435 aa9.09□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W DIA4P38705 446 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W GND1P38720 489 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W YHR182WP38870 785 aa9.09□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W MGS1P40151 587 aa9.09□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W RGI2P40188 164 aa9.09□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W JJJ1P53863 590 aa9.09□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W ROT1Q03691 256 aa9.09□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W YOL024WQ08172 172 aa9.09□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W YLL056CQ12177 298 aa9.09□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W YPL066WQ12194 479 aa9.09□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W PHO13P19881 312 aa9.08□□□□□ -0.96
YLR349WYLR349W VAN1P23642 535 aa9.08□□□□□ -0.96
YLR349WYLR349W SIN4P32259 974 aa9.08□□□□□ -0.96
YLR349WYLR349W ECM2P38241 364 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
YLR349WYLR349W ATG3P40344 310 aa9.08□□□□□ -0.96
YLR349WYLR349W RTS3P53289 263 aa9.08□□□□□ -0.96
YLR349WYLR349W RHO3Q00245 231 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
YLR349WYLR349W VID22Q05934 901 aa9.08□□□□□ -0.96
YLR349WYLR349W ESC2Q06340 456 aa9.08□□□□□ -0.96
YLR349WYLR349W YLR030WQ07967 263 aa9.08□□□□□ -0.96
YLR349WYLR349W IMP3P32899 183 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
YLR349WYLR349W PRP18P33411 251 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
YLR349WYLR349W CTF13P35203 478 aa9.07□□□□□ -0.96
YLR349WYLR349W BLI1P35727 113 aa9.07□□□□□ -0.96
YLR349WYLR349W NTR2P36118 322 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
YLR349WYLR349W CTP1P38152 299 aa9.07□□□□□ -0.96
YLR349WYLR349W ARG2P40360 574 aa9.07□□□□□ -0.96
YLR349WYLR349W MND2P40577 368 aa9.07□□□□□ -0.96
YLR349WYLR349W TMS1Q12116 473 aa9.07□□□□□ -0.96
YLR349WYLR349W ATG9Q12142 997 aa9.07□□□□□ -0.96
YLR349WYLR349W BCY1P07278 416 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
YLR349WYLR349W ERG11P10614 530 aa9.06□□□□□ -0.96
YLR349WYLR349W YBL055CP34220 418 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
YLR349WYLR349W LDB7P38210 180 aa9.06□□□□□ -0.96
YLR349WYLR349W YHR033WP38690 423 aa9.06□□□□□ -0.96
YLR349WYLR349W MTG2P38860 518 aa9.06□□□□□ -0.96
YLR349WYLR349W SPC72P39723 622 aa9.06□□□□□ -0.96
YLR349WYLR349W PEX25Q02969 394 aa9.06□□□□□ -0.96
YLR349WYLR349W RRP45Q05636 305 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
YLR349WYLR349W OPY2Q06810 360 aa9.06□□□□□ -0.96
YLR349WYLR349W PUF3Q07807 879 aaKnown RBP RIP-Chip data9.06□□□□□ -0.96not detected
YLR349WYLR349W YDR018CQ12185 396 aa9.06□□□□□ -0.96
YLR349WYLR349W SPS1P08458 490 aa9.05□□□□□ -0.96
YLR349WYLR349W YJL107CP42947 387 aa9.05□□□□□ -0.96
YLR349WYLR349W YML6P51998 286 aa9.05□□□□□ -0.96
YLR349WYLR349W DIG1Q03063 452 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
YLR349WYLR349W RLI1Q03195 608 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 67.8 ms