RNA–Protein interactions for RNA: YDR457W

TOM1, Transcript of E3 ubiquitin ligase of the hect-domain class, yeast

Gene TOM1, Length 9,807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TOM1	YDR457W	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	MMM1	P41800	426 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	TWF1	P53250	332 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	CLD1	P53264	445 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	REC102	Q02721	264 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	ATG16	Q03818	150 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	AIM32	Q04689	311 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	HOF1	Q05080	669 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	GSH2	Q08220	491 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	YOR131C	Q12486	218 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	ENA1	P13587	1091 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	UBC8	P28263	218 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	GAA1	P39012	614 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	BUD16	P39988	312 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	YIR042C	P40586	236 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	MET12	P46151	657 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	MDE1	P47095	244 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	COQ6	P53318	479 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	ENA2	Q01896	1091 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	MUK1	Q02866	612 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	PIG1	Q06216	648 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	ENA5	Q12691	1091 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	COB	P00163	385 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	HYM1	P32464	399 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	PTM1	P32857	523 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	PMT1	P33775	817 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	SMF1	P38925	575 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	AIM2	P39721	246 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	YJR030C	P47101	745 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	YJR039W	P47107	1121 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	RSM7	P47150	247 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	PET117	Q02771	107 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	PEX25	Q02969	394 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	CDA1	Q06702	301 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	PET112	P33893	541 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	EXO5	P38289	585 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	ERC1	P38767	581 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	VMA7	P39111	118 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	YGR026W	P53217	278 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	HXT17	P53631	564 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	RSN1	Q03516	953 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	BUD7	Q08754	746 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	MPH2	P0CD99	609 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	CAP2	P13517	287 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	BIT2	P38346	545 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	BIG1	P38813	335 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	CYC2	P38909	366 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	COG3	P40094	801 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	MGS1	P40151	587 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	SLZ1	P40167	298 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	ALG5	P40350	334 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	MET28	P40573	187 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	RPA43	P46669	326 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	PFD1	P46988	109 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	MAK3	Q03503	176 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	ADY4	Q05955	493 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	PCL8	Q08966	492 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	SRO7	Q12038	1033 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	YOR114W	Q12219	294 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	SPE4	Q12455	300 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	SUS1	Q6WNK7	96 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	RPO41	P13433	1351 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	ROM2	P51862	1356 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	FOB1	O13329	566 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	DSF1	P0CX08	502 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	YNR073C	P0CX09	502 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	YDR089W	P38966	869 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	COX15	P40086	486 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	HUL4	P40985	892 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	BUL1	P48524	976 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	CLA4	P48562	842 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	RSM23	Q01163	450 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	RRN5	Q02983	363 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	YDR124W	Q04608	324 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	RIF2	Q06208	395 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	APN1	P22936	367 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	ERG9	P29704	444 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	MCM10	P32354	571 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	ISC10	P32645	267 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	ERG5	P54781	538 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	MET31	Q03081	177 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	YMR210W	Q03649	449 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	YPR127W	Q06494	345 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	SAS5	Q99314	248 aa		2.76	□□□□□ -1.97

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