RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	14.49	□□□□□ -0.09
TTLL3-233	ENST00000602338	CYBA	P13498	195 aa		14.49	□□□□□ -0.09
TTLL3-233	ENST00000602338	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		14.49	□□□□□ -0.09
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		14.49	□□□□□ -0.09
TTLL3-233	ENST00000602338	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		14.49	□□□□□ -0.09
TTLL3-233	ENST00000602338	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	14.49	□□□□□ -0.09
TTLL3-233	ENST00000602338	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	14.49	□□□□□ -0.09
TTLL3-233	ENST00000602338	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	14.49	□□□□□ -0.09
TTLL3-233	ENST00000602338	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	14.49	□□□□□ -0.09
TTLL3-233	ENST00000602338	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		14.49	□□□□□ -0.09
TTLL3-233	ENST00000602338	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		14.49	□□□□□ -0.09
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	14.49	□□□□□ -0.09
TTLL3-233	ENST00000602338	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		14.48	□□□□□ -0.09
TTLL3-233	ENST00000602338	GOLIM4	O00461	696 aa		14.48	□□□□□ -0.09
TTLL3-233	ENST00000602338	DLL1	O00548	723 aa		14.48	□□□□□ -0.09
TTLL3-233	ENST00000602338	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	14.48	□□□□□ -0.09
TTLL3-233	ENST00000602338	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	14.48	□□□□□ -0.09
TTLL3-233	ENST00000602338	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	14.48	□□□□□ -0.09
TTLL3-233	ENST00000602338	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		14.48	□□□□□ -0.09
TTLL3-233	ENST00000602338	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	14.48	□□□□□ -0.09
TTLL3-233	ENST00000602338	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		14.48	□□□□□ -0.09
TTLL3-233	ENST00000602338	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	14.48	□□□□□ -0.09
TTLL3-233	ENST00000602338	VCAN	P13611	3396 aa		14.47	□□□□□ -0.09
TTLL3-233	ENST00000602338	APBB1	O00213	710 aa		14.47	□□□□□ -0.09
TTLL3-233	ENST00000602338	CHGB	P05060	677 aa		14.47	□□□□□ -0.09
TTLL3-233	ENST00000602338	ADORA2A	P29274	412 aa		14.47	□□□□□ -0.09
TTLL3-233	ENST00000602338	CNGA1	P29973	690 aa		14.47	□□□□□ -0.09
TTLL3-233	ENST00000602338	ATP2B2	Q01814	1243 aa		14.47	□□□□□ -0.09
TTLL3-233	ENST00000602338	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	14.47	□□□□□ -0.09
TTLL3-233	ENST00000602338	LPAR1	Q92633	364 aa		14.47	□□□□□ -0.09
TTLL3-233	ENST00000602338	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		14.47	□□□□□ -0.09
TTLL3-233	ENST00000602338	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		14.47	□□□□□ -0.09
TTLL3-233	ENST00000602338	ARMT1	Q9H993	441 aa		14.47	□□□□□ -0.09
TTLL3-233	ENST00000602338	DNM1L	O00429	736 aa		14.46	□□□□□ -0.09
TTLL3-233	ENST00000602338	PRKAB2	O43741	272 aa		14.46	□□□□□ -0.09
TTLL3-233	ENST00000602338	COBL	O75128	1261 aa		14.46	□□□□□ -0.09
TTLL3-233	ENST00000602338	AKR1B1	P15121	316 aa		14.46	□□□□□ -0.09
TTLL3-233	ENST00000602338	ERCC3	P19447	782 aa		14.46	□□□□□ -0.09
TTLL3-233	ENST00000602338	COG2	Q14746	738 aa		14.46	□□□□□ -0.09
TTLL3-233	ENST00000602338	ANO1	Q5XXA6	986 aa		14.46	□□□□□ -0.09
TTLL3-233	ENST00000602338	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		14.46	□□□□□ -0.09
TTLL3-233	ENST00000602338	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		14.46	□□□□□ -0.09
TTLL3-233	ENST00000602338	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	14.46	□□□□□ -0.09
TTLL3-233	ENST00000602338	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		14.46	□□□□□ -0.09
TTLL3-233	ENST00000602338	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		14.45	□□□□□ -0.1
TTLL3-233	ENST00000602338	MSC	O60682	206 aa		14.45	□□□□□ -0.1
TTLL3-233	ENST00000602338	RTP1	P59025	263 aa		14.45	□□□□□ -0.1
TTLL3-233	ENST00000602338	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	14.45	□□□□□ -0.1
TTLL3-233	ENST00000602338	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		14.45	□□□□□ -0.1
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		14.45	□□□□□ -0.1
TTLL3-233	ENST00000602338	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		14.45	□□□□□ -0.1
TTLL3-233	ENST00000602338	ATG4C	Q96DT6	458 aa		14.45	□□□□□ -0.1
TTLL3-233	ENST00000602338	BCL11A	Q9H165	835 aa		14.45	□□□□□ -0.1
TTLL3-233	ENST00000602338	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		14.44	□□□□□ -0.1
TTLL3-233	ENST00000602338	MBD4	O95243	580 aa		14.44	□□□□□ -0.1
TTLL3-233	ENST00000602338	DSG3	P32926	999 aa		14.44	□□□□□ -0.1
TTLL3-233	ENST00000602338	ICA1	Q05084	483 aa		14.44	□□□□□ -0.1
TTLL3-233	ENST00000602338	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		14.44	□□□□□ -0.1
TTLL3-233	ENST00000602338	DPP9	Q86TI2	863 aa		14.44	□□□□□ -0.1
TTLL3-233	ENST00000602338	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	14.44	□□□□□ -0.1
TTLL3-233	ENST00000602338	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		14.44	□□□□□ -0.1
TTLL3-233	ENST00000602338	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		14.44	□□□□□ -0.1
TTLL3-233	ENST00000602338	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	14.44	□□□□□ -0.1
TTLL3-233	ENST00000602338	FLOT1	O75955	427 aa		14.43	□□□□□ -0.1
TTLL3-233	ENST00000602338	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	14.43	□□□□□ -0.1
TTLL3-233	ENST00000602338	ADD2	P35612	726 aa		14.43	□□□□□ -0.1
TTLL3-233	ENST00000602338	MIER1	Q8N108	512 aa		14.43	□□□□□ -0.1
TTLL3-233	ENST00000602338	GUCD1	Q96NT3	240 aa		14.43	□□□□□ -0.1
TTLL3-233	ENST00000602338	VCPKMT	Q9H867	229 aa		14.43	□□□□□ -0.1
TTLL3-233	ENST00000602338	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		14.43	□□□□□ -0.1
TTLL3-233	ENST00000602338	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		14.43	□□□□□ -0.1
TTLL3-233	ENST00000602338	SWAP70	Q9UH65	585 aa		14.43	□□□□□ -0.1
TTLL3-233	ENST00000602338	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		14.43	□□□□□ -0.1
TTLL3-233	ENST00000602338	TMX2	Q9Y320	296 aa		14.43	□□□□□ -0.1
TTLL3-233	ENST00000602338	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		14.42	□□□□□ -0.1
TTLL3-233	ENST00000602338	SEPT4	O43236	478 aa		14.42	□□□□□ -0.1
TTLL3-233	ENST00000602338	STRN	O43815	780 aa		14.42	□□□□□ -0.1
TTLL3-233	ENST00000602338	PLS1	Q14651	629 aa		14.42	□□□□□ -0.1
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		14.42	□□□□□ -0.1
TTLL3-233	ENST00000602338	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		14.42	□□□□□ -0.1
TTLL3-233	ENST00000602338	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	14.42	□□□□□ -0.1
TTLL3-233	ENST00000602338	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		14.42	□□□□□ -0.1
TTLL3-233	ENST00000602338	MB21D1	Q8N884	522 aa		14.42	□□□□□ -0.1
TTLL3-233	ENST00000602338	MAML3	Q96JK9	1138 aa		14.42	□□□□□ -0.1
TTLL3-233	ENST00000602338	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	14.42	□□□□□ -0.1
TTLL3-233	ENST00000602338	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		14.42	□□□□□ -0.1
TTLL3-233	ENST00000602338	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		14.42	□□□□□ -0.1
TTLL3-233	ENST00000602338	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		14.42	□□□□□ -0.1
TTLL3-233	ENST00000602338	POTEB2	H3BUK9	544 aa		14.41	□□□□□ -0.1
TTLL3-233	ENST00000602338	CDK8	P49336	464 aa		14.41	□□□□□ -0.1
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		14.41	□□□□□ -0.1
TTLL3-233	ENST00000602338	SNX17	Q15036	470 aa		14.41	□□□□□ -0.1
TTLL3-233	ENST00000602338	TRIM60	Q495X7	471 aa		14.41	□□□□□ -0.1
TTLL3-233	ENST00000602338	C12orf60	Q5U649	245 aa		14.41	□□□□□ -0.1
TTLL3-233	ENST00000602338	MROH8	Q9H579	483 aa		14.41	□□□□□ -0.1
TTLL3-233	ENST00000602338	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		14.41	□□□□□ -0.1
TTLL3-233	ENST00000602338	COG6	Q9Y2V7	657 aa		14.41	□□□□□ -0.1
TTLL3-233	ENST00000602338	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		14.41	□□□□□ -0.1
TTLL3-233	ENST00000602338	USP17L12	C9JPN9	530 aa		14.4	□□□□□ -0.1
TTLL3-233	ENST00000602338	KBTBD13	C9JR72	458 aa		14.4	□□□□□ -0.1

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