RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600964.1

AP2S1-208, Transcript of adaptor related protein complex 2 subunit sigma 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene AP2S1, Length 458 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1-208ENST00000600964 STAP2Q9UGK3 403 aa22.08■■□□□ 1.13
AP2S1-208ENST00000600964 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.08■■□□□ 1.13
AP2S1-208ENST00000600964 SMIM22K7EJ46 135 aa22.07■■□□□ 1.12
AP2S1-208ENST00000600964 BMP8BP34820 402 aa22.07■■□□□ 1.12
AP2S1-208ENST00000600964 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.07■■□□□ 1.12
AP2S1-208ENST00000600964 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
AP2S1-208ENST00000600964 DYNLL2Q96FJ2 89 aa22.07■■□□□ 1.12
AP2S1-208ENST00000600964 C11orf49Q9H6J7 331 aa22.07■■□□□ 1.12
AP2S1-208ENST00000600964 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa22.07■■□□□ 1.12
AP2S1-208ENST00000600964 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
AP2S1-208ENST00000600964 GRB14Q14449 540 aa22.06■■□□□ 1.12
AP2S1-208ENST00000600964 COG2Q14746 738 aa22.06■■□□□ 1.12
AP2S1-208ENST00000600964 TMEM179Q6ZVK1 233 aa22.06■■□□□ 1.12
AP2S1-208ENST00000600964 NPLOC4Q8TAT6 608 aa22.06■■□□□ 1.12
AP2S1-208ENST00000600964 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
AP2S1-208ENST00000600964 SWAP70Q9UH65 585 aa22.06■■□□□ 1.12
AP2S1-208ENST00000600964 LAMA3Q16787 3333 aa22.05■■□□□ 1.12
AP2S1-208ENST00000600964 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
AP2S1-208ENST00000600964 UBE3CQ15386 1083 aa22.05■■□□□ 1.12
AP2S1-208ENST00000600964 C12orf60Q5U649 245 aa22.05■■□□□ 1.12
AP2S1-208ENST00000600964 HOXC10Q9NYD6 342 aa22.05■■□□□ 1.12
AP2S1-208ENST00000600964 MBD4O95243 580 aa22.04■■□□□ 1.12
AP2S1-208ENST00000600964 C7orf61Q8IZ16 206 aa22.04■■□□□ 1.12
AP2S1-208ENST00000600964 TMX2Q9Y320 296 aa22.04■■□□□ 1.12
AP2S1-208ENST00000600964 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa22.04■■□□□ 1.12
AP2S1-208ENST00000600964 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
AP2S1-208ENST00000600964 AKR1B1P15121 316 aa22.03■■□□□ 1.12
AP2S1-208ENST00000600964 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
AP2S1-208ENST00000600964 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa22.02■■□□□ 1.12
AP2S1-208ENST00000600964 USP17L12C9JPN9 530 aa22.02■■□□□ 1.12
AP2S1-208ENST00000600964 USP17L21D6R901 530 aa22.02■■□□□ 1.12
AP2S1-208ENST00000600964 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
AP2S1-208ENST00000600964 CDK8P49336 464 aa22.02■■□□□ 1.12
AP2S1-208ENST00000600964 C16orf86Q6ZW13 317 aa22.02■■□□□ 1.12
AP2S1-208ENST00000600964 CCDC17Q96LX7 622 aa22.02■■□□□ 1.12
AP2S1-208ENST00000600964 LRRCC1Q9C099 1032 aa22.02■■□□□ 1.12
AP2S1-208ENST00000600964 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP22.02■■□□□ 1.12
AP2S1-208ENST00000600964 STRNO43815 780 aa22.01■■□□□ 1.11
AP2S1-208ENST00000600964 DSG3P32926 999 aa22.01■■□□□ 1.11
AP2S1-208ENST00000600964 MFSD14CQ5VZR4 134 aa22.01■■□□□ 1.11
AP2S1-208ENST00000600964 CLEC10AQ8IUN9 316 aa22.01■■□□□ 1.11
AP2S1-208ENST00000600964 SHCBP1Q8NEM2 672 aa22.01■■□□□ 1.11
AP2S1-208ENST00000600964 TRPV1Q8NER1 839 aa22.01■■□□□ 1.11
AP2S1-208ENST00000600964 LPAR1Q92633 364 aa22.01■■□□□ 1.11
AP2S1-208ENST00000600964 SPATC1LQ9H0A9 340 aa22.01■■□□□ 1.11
AP2S1-208ENST00000600964 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
AP2S1-208ENST00000600964 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
AP2S1-208ENST00000600964 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
AP2S1-208ENST00000600964 CTR9Q6PD62 1173 aa22■■□□□ 1.11
AP2S1-208ENST00000600964 BCL11AQ9H165 835 aa22■■□□□ 1.11
AP2S1-208ENST00000600964 VCPKMTQ9H867 229 aa22■■□□□ 1.11
AP2S1-208ENST00000600964 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa22■■□□□ 1.11
AP2S1-208ENST00000600964 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa22■■□□□ 1.11
AP2S1-208ENST00000600964 MYH4Q9Y623 1939 aa22■■□□□ 1.11
AP2S1-208ENST00000600964 ATP2B2Q01814 1243 aa21.99■■□□□ 1.11
AP2S1-208ENST00000600964 LRRC26Q2I0M4 334 aa21.99■■□□□ 1.11
AP2S1-208ENST00000600964 WDR78Q5VTH9 848 aa21.99■■□□□ 1.11
AP2S1-208ENST00000600964 MB21D1Q8N884 522 aa21.99■■□□□ 1.11
AP2S1-208ENST00000600964 TANGO6Q9C0B7 1094 aa21.99■■□□□ 1.11
AP2S1-208ENST00000600964 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
AP2S1-208ENST00000600964 COL6A3P12111 3177 aa21.99■■□□□ 1.11
AP2S1-208ENST00000600964 COBLO75128 1261 aa21.98■■□□□ 1.11
AP2S1-208ENST00000600964 CYBAP13498 195 aa21.98■■□□□ 1.11
AP2S1-208ENST00000600964 SYN1P17600 705 aa21.98■■□□□ 1.11
AP2S1-208ENST00000600964 ERCC3P19447 782 aa21.98■■□□□ 1.11
AP2S1-208ENST00000600964 ADORA2AP29274 412 aa21.98■■□□□ 1.11
AP2S1-208ENST00000600964 CYP2C19P33261 490 aa21.98■■□□□ 1.11
AP2S1-208ENST00000600964 OLFML2BQ68BL8 750 aa21.98■■□□□ 1.11
AP2S1-208ENST00000600964 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP21.98■■□□□ 1.11
AP2S1-208ENST00000600964 DCTPP1Q9H773 170 aa21.98■■□□□ 1.11
AP2S1-208ENST00000600964 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa21.98■■□□□ 1.11
AP2S1-208ENST00000600964 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
AP2S1-208ENST00000600964 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
AP2S1-208ENST00000600964 ICA1Q05084 483 aa21.97■■□□□ 1.11
AP2S1-208ENST00000600964 ATG4CQ96DT6 458 aa21.97■■□□□ 1.11
AP2S1-208ENST00000600964 LRCH3Q96II8 777 aa21.97■■□□□ 1.11
AP2S1-208ENST00000600964 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
AP2S1-208ENST00000600964 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa21.97■■□□□ 1.11
AP2S1-208ENST00000600964 WDR46O15213 610 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
AP2S1-208ENST00000600964 MSCO60682 206 aa21.96■■□□□ 1.11
AP2S1-208ENST00000600964 EEF2P13639 858 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
AP2S1-208ENST00000600964 SBK1Q52WX2 424 aa21.96■■□□□ 1.11
AP2S1-208ENST00000600964 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa21.96■■□□□ 1.11
AP2S1-208ENST00000600964 ABRAQ8N0Z2 381 aa21.96■■□□□ 1.11
AP2S1-208ENST00000600964 SPICE1Q8N0Z3 855 aa21.96■■□□□ 1.11
AP2S1-208ENST00000600964 MROH8Q9H579 483 aa21.96■■□□□ 1.11
AP2S1-208ENST00000600964 ECHDC1Q9NTX5 307 aa21.96■■□□□ 1.11
AP2S1-208ENST00000600964 GSG1L2A8MUP6 293 aa21.95■■□□□ 1.1
AP2S1-208ENST00000600964 FLOT1O75955 427 aa21.95■■□□□ 1.1
AP2S1-208ENST00000600964 TMEM132BQ14DG7 1078 aa21.95■■□□□ 1.1
AP2S1-208ENST00000600964 DPP9Q86TI2 863 aa21.95■■□□□ 1.1
AP2S1-208ENST00000600964 SH2D4AQ9H788 454 aa21.95■■□□□ 1.1
AP2S1-208ENST00000600964 KANSL2Q9H9L4 492 aa21.95■■□□□ 1.1
AP2S1-208ENST00000600964 LTBP2Q14767 1821 aa21.94■■□□□ 1.1
AP2S1-208ENST00000600964 LRIT3Q3SXY7 679 aa21.94■■□□□ 1.1
AP2S1-208ENST00000600964 KBTBD3Q8NAB2 608 aa21.94■■□□□ 1.1
AP2S1-208ENST00000600964 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
AP2S1-208ENST00000600964 GPR153Q6NV75 609 aa21.93■■□□□ 1.1
AP2S1-208ENST00000600964 GIMAP6Q6P9H5 292 aa21.93■■□□□ 1.1
AP2S1-208ENST00000600964 OSBP2Q969R2 916 aa21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.1 ms