RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 PRO3102Q9H379 93 aa23.18■■□□□ 1.3
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa23.18■■□□□ 1.3
SH3BP2-220ENST00000511663 NAV1Q8NEY1 1877 aa23.17■■□□□ 1.3
SH3BP2-220ENST00000511663 USP17L12C9JPN9 530 aa23.17■■□□□ 1.3
SH3BP2-220ENST00000511663 USP17L21D6R901 530 aa23.17■■□□□ 1.3
SH3BP2-220ENST00000511663 STRNO43815 780 aa23.17■■□□□ 1.3
SH3BP2-220ENST00000511663 CNGA1P29973 690 aa23.17■■□□□ 1.3
SH3BP2-220ENST00000511663 EVX2Q03828 476 aa23.17■■□□□ 1.3
SH3BP2-220ENST00000511663 MB21D1Q8N884 522 aa23.17■■□□□ 1.3
SH3BP2-220ENST00000511663 GPATCH3Q96I76 525 aa23.17■■□□□ 1.3
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC5A4Q9NY91 659 aa23.17■■□□□ 1.3
SH3BP2-220ENST00000511663 CEP290O15078 2479 aa23.17■■□□□ 1.3
SH3BP2-220ENST00000511663 MSCO60682 206 aa23.16■■□□□ 1.3
SH3BP2-220ENST00000511663 CDK8P49336 464 aa23.16■■□□□ 1.3
SH3BP2-220ENST00000511663 ICA1Q05084 483 aa23.16■■□□□ 1.3
SH3BP2-220ENST00000511663 GRB14Q14449 540 aa23.16■■□□□ 1.3
SH3BP2-220ENST00000511663 PLS1Q14651 629 aa23.16■■□□□ 1.3
SH3BP2-220ENST00000511663 SLFNL1Q499Z3 407 aa23.16■■□□□ 1.3
SH3BP2-220ENST00000511663 C12orf60Q5U649 245 aa23.16■■□□□ 1.3
SH3BP2-220ENST00000511663 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
SH3BP2-220ENST00000511663 FLOT1O75955 427 aa23.15■■□□□ 1.3
SH3BP2-220ENST00000511663 HOXC6P09630 235 aa23.15■■□□□ 1.3
SH3BP2-220ENST00000511663 AKR1B1P15121 316 aa23.15■■□□□ 1.3
SH3BP2-220ENST00000511663 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
SH3BP2-220ENST00000511663 LHX8Q68G74 356 aa23.15■■□□□ 1.3
SH3BP2-220ENST00000511663 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
SH3BP2-220ENST00000511663 SPATC1LQ9H0A9 340 aa23.15■■□□□ 1.3
SH3BP2-220ENST00000511663 ECHDC1Q9NTX5 307 aa23.15■■□□□ 1.3
SH3BP2-220ENST00000511663 TMX2Q9Y320 296 aa23.15■■□□□ 1.3
SH3BP2-220ENST00000511663 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
SH3BP2-220ENST00000511663 DSG3P32926 999 aa23.14■■□□□ 1.29
SH3BP2-220ENST00000511663 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
SH3BP2-220ENST00000511663 SHCBP1Q8NEM2 672 aa23.14■■□□□ 1.29
SH3BP2-220ENST00000511663 VCPKMTQ9H867 229 aa23.14■■□□□ 1.29
SH3BP2-220ENST00000511663 KANSL2Q9H9L4 492 aa23.14■■□□□ 1.29
SH3BP2-220ENST00000511663 BMP8BP34820 402 aa23.13■■□□□ 1.29
SH3BP2-220ENST00000511663 C20orf194Q5TEA3 1177 aa23.13■■□□□ 1.29
SH3BP2-220ENST00000511663 C16orf86Q6ZW13 317 aa23.13■■□□□ 1.29
SH3BP2-220ENST00000511663 SPICE1Q8N0Z3 855 aa23.13■■□□□ 1.29
SH3BP2-220ENST00000511663 NPLOC4Q8TAT6 608 aa23.13■■□□□ 1.29
SH3BP2-220ENST00000511663 MROH8Q9H579 483 aa23.13■■□□□ 1.29
SH3BP2-220ENST00000511663 FLRT1Q9NZU1 646 aa23.13■■□□□ 1.29
SH3BP2-220ENST00000511663 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
SH3BP2-220ENST00000511663 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa23.12■■□□□ 1.29
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SH3BP2-220ENST00000511663 SYN1P17600 705 aa23.12■■□□□ 1.29
SH3BP2-220ENST00000511663 ERCC3P19447 782 aa23.12■■□□□ 1.29
SH3BP2-220ENST00000511663 ADORA2AP29274 412 aa23.12■■□□□ 1.29
SH3BP2-220ENST00000511663 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
SH3BP2-220ENST00000511663 NCAPG2Q86XI2 1143 aa23.12■■□□□ 1.29
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SH3BP2-220ENST00000511663 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
SH3BP2-220ENST00000511663 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP2-220ENST00000511663 RAD21O60216 631 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP2-220ENST00000511663 CYP2C19P33261 490 aa23.11■■□□□ 1.29
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SH3BP2-220ENST00000511663 GDF15Q99988 308 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP2-220ENST00000511663 GOPCQ9HD26 462 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP2-220ENST00000511663 PFASO15067 1338 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP2-220ENST00000511663 COL6A1P12109 1028 aa23.1■■□□□ 1.29
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SH3BP2-220ENST00000511663 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP2-220ENST00000511663 OLFML2BQ68BL8 750 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP2-220ENST00000511663 SIAH1Q8IUQ4 282 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP2-220ENST00000511663 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC25A27O95847 323 aa23.09■■□□□ 1.29
SH3BP2-220ENST00000511663 CHGBP05060 677 aa23.09■■□□□ 1.29
SH3BP2-220ENST00000511663 FCER1AP12319 257 aa23.09■■□□□ 1.29
SH3BP2-220ENST00000511663 CLEC10AQ8IUN9 316 aa23.09■■□□□ 1.29
SH3BP2-220ENST00000511663 ARRDC4Q8NCT1 418 aa23.09■■□□□ 1.29
SH3BP2-220ENST00000511663 ATG4CQ96DT6 458 aa23.09■■□□□ 1.29
SH3BP2-220ENST00000511663 DCTPP1Q9H773 170 aa23.09■■□□□ 1.29
SH3BP2-220ENST00000511663 MKNK2Q9HBH9 465 aa23.09■■□□□ 1.29
SH3BP2-220ENST00000511663 ABRAQ8N0Z2 381 aa23.08■■□□□ 1.29
SH3BP2-220ENST00000511663 KBTBD3Q8NAB2 608 aa23.08■■□□□ 1.29
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SH3BP2-220ENST00000511663 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
SH3BP2-220ENST00000511663 GIMAP6Q6P9H5 292 aa23.07■■□□□ 1.28
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SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF287Q9HBT7 754 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP2-220ENST00000511663 MYH8P13535 1937 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP2-220ENST00000511663 DNM1LO00429 736 aa23.06■■□□□ 1.28
SH3BP2-220ENST00000511663 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
SH3BP2-220ENST00000511663 APPP05067 770 aa23.06■■□□□ 1.28
SH3BP2-220ENST00000511663 GNAT2P19087 354 aa23.06■■□□□ 1.28
SH3BP2-220ENST00000511663 LRRC26Q2I0M4 334 aa23.06■■□□□ 1.28
SH3BP2-220ENST00000511663 SBK1Q52WX2 424 aa23.06■■□□□ 1.28
SH3BP2-220ENST00000511663 APPBP2Q92624 585 aa23.06■■□□□ 1.28
SH3BP2-220ENST00000511663 ALPK3Q96L96 1907 aa23.06■■□□□ 1.28
SH3BP2-220ENST00000511663 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
SH3BP2-220ENST00000511663 SMIM22K7EJ46 135 aa23.05■■□□□ 1.28
SH3BP2-220ENST00000511663 COBLO75128 1261 aa23.05■■□□□ 1.28
SH3BP2-220ENST00000511663 CYBAP13498 195 aa23.05■■□□□ 1.28
SH3BP2-220ENST00000511663 STK11IPQ8N1F8 1099 aa23.05■■□□□ 1.28
SH3BP2-220ENST00000511663 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa23.05■■□□□ 1.28
SH3BP2-220ENST00000511663 KBTBD13C9JR72 458 aa23.04■■□□□ 1.28
SH3BP2-220ENST00000511663 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
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