RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493829.5

USP39-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 39, humanhuman

TSL 2

Gene USP39, Length 1,660 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP39-218ENST00000493829 GOLGA8AA7E2F4 631 aa22.66■■□□□ 1.22
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USP39-218ENST00000493829 CCDC83Q8IWF9 413 aa22.66■■□□□ 1.22
USP39-218ENST00000493829 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
USP39-218ENST00000493829 FOXD4L1Q9NU39 408 aa22.66■■□□□ 1.22
USP39-218ENST00000493829 HPS5Q9UPZ3 1129 aa22.66■■□□□ 1.22
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USP39-218ENST00000493829 USP17L5A8MUK1 530 aa22.65■■□□□ 1.22
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USP39-218ENST00000493829 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP22.65■■□□□ 1.222e-7■■■□□ 16.1
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USP39-218ENST00000493829 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa22.65■■□□□ 1.22
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USP39-218ENST00000493829 ZHX2Q9Y6X8 837 aa22.65■■□□□ 1.22
USP39-218ENST00000493829 PASKQ96RG2 1323 aa22.64■■□□□ 1.21
USP39-218ENST00000493829 DDAH1O94760 285 aa22.64■■□□□ 1.21
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USP39-218ENST00000493829 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
USP39-218ENST00000493829 SH2D4AQ9H788 454 aa22.62■■□□□ 1.21
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USP39-218ENST00000493829 USP17L2Q6R6M4 530 aa22.61■■□□□ 1.21
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USP39-218ENST00000493829 CALM3P0DP25 149 aa22.6■■□□□ 1.21
USP39-218ENST00000493829 PDHBP11177 359 aa22.6■■□□□ 1.21
USP39-218ENST00000493829 KLRC3Q07444 240 aa22.6■■□□□ 1.21
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USP39-218ENST00000493829 STAG2Q8N3U4 1231 aa22.59■■□□□ 1.21
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USP39-218ENST00000493829 USP17L10C9JJH3 530 aa22.58■■□□□ 1.21
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USP39-218ENST00000493829 CPVLQ9H3G5 476 aa22.58■■□□□ 1.2
USP39-218ENST00000493829 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
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USP39-218ENST00000493829 SLC1A4P43007 532 aa22.57■■□□□ 1.2
USP39-218ENST00000493829 IRF6O14896 467 aa22.56■■□□□ 1.2
USP39-218ENST00000493829 JAK2O60674 1132 aa22.56■■□□□ 1.2
USP39-218ENST00000493829 KIF5BP33176 963 aa22.56■■□□□ 1.2
USP39-218ENST00000493829 GJA5P36382 358 aa22.56■■□□□ 1.2
USP39-218ENST00000493829 RCAN1P53805 252 aa22.56■■□□□ 1.2
USP39-218ENST00000493829 BACE1P56817 501 aa22.56■■□□□ 1.2
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