RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, humanhuman

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Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-210ENST00000489475 TRAK2O60296 914 aa31.06■■■□□ 2.56
HOXB3-210ENST00000489475 KRT40Q6A162 431 aa31.06■■■□□ 2.56
HOXB3-210ENST00000489475 LZTS2Q9BRK4 669 aa31.06■■■□□ 2.56
HOXB3-210ENST00000489475 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa31.06■■■□□ 2.56
HOXB3-210ENST00000489475 UTRNP46939 3433 aa31.06■■■□□ 2.56
HOXB3-210ENST00000489475 TBC1D12O60347 775 aa31.05■■■□□ 2.56
HOXB3-210ENST00000489475 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP31.05■■■□□ 2.56
HOXB3-210ENST00000489475 KRT85P78386 507 aa31.05■■■□□ 2.56
HOXB3-210ENST00000489475 ATP2B2Q01814 1243 aa31.05■■■□□ 2.56
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HOXB3-210ENST00000489475 FAM173BQ6P4H8 233 aa31.05■■■□□ 2.56
HOXB3-210ENST00000489475 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP31.05■■■□□ 2.56
HOXB3-210ENST00000489475 STAG2Q8N3U4 1231 aa31.05■■■□□ 2.56
HOXB3-210ENST00000489475 CABP5Q9NP86 173 aa31.05■■■□□ 2.56
HOXB3-210ENST00000489475 HACL1Q9UJ83 578 aa31.05■■■□□ 2.56
HOXB3-210ENST00000489475 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP31.05■■■□□ 2.56
HOXB3-210ENST00000489475 GDF11O95390 407 aa31.05■■■□□ 2.56
HOXB3-210ENST00000489475 C9orf131Q5VYM1 1079 aa31.05■■■□□ 2.56
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HOXB3-210ENST00000489475 TCHHQ07283 1943 aa31.04■■■□□ 2.56
HOXB3-210ENST00000489475 XBP1P17861 261 aa31.03■■■□□ 2.56
HOXB3-210ENST00000489475 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa31.03■■■□□ 2.56
HOXB3-210ENST00000489475 CDAN1Q8IWY9 1227 aa31.03■■■□□ 2.56
HOXB3-210ENST00000489475 GDPD2Q9HCC8 539 aa31.03■■■□□ 2.56
HOXB3-210ENST00000489475 NYAP2Q9P242 653 aa31.03■■■□□ 2.56
HOXB3-210ENST00000489475 SEPT2Q15019 361 aa31.03■■■□□ 2.56
HOXB3-210ENST00000489475 GPR162Q16538 588 aa31.03■■■□□ 2.56
HOXB3-210ENST00000489475 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP31.03■■■□□ 2.56
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HOXB3-210ENST00000489475 GH2P01242 217 aa31.02■■■□□ 2.56
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HOXB3-210ENST00000489475 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP31.02■■■□□ 2.56
HOXB3-210ENST00000489475 USP17L2Q6R6M4 530 aa31.02■■■□□ 2.56
HOXB3-210ENST00000489475 TMEM87AQ8NBN3 555 aa31.02■■■□□ 2.56
HOXB3-210ENST00000489475 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa31.01■■■□□ 2.56
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HOXB3-210ENST00000489475 ICA1Q05084 483 aa31.01■■■□□ 2.56
HOXB3-210ENST00000489475 BRAPQ7Z569 592 aa31.01■■■□□ 2.56
HOXB3-210ENST00000489475 USP48Q86UV5 1035 aa31.01■■■□□ 2.56
HOXB3-210ENST00000489475 USP17L5A8MUK1 530 aa31.01■■■□□ 2.55
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HOXB3-210ENST00000489475 EPS15P42566 896 aa31.01■■■□□ 2.55
HOXB3-210ENST00000489475 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP31.01■■■□□ 2.55
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HOXB3-210ENST00000489475 MIGA2Q7L4E1 593 aa31.01■■■□□ 2.55
HOXB3-210ENST00000489475 TRPM4Q8TD43 1214 aa31.01■■■□□ 2.55
HOXB3-210ENST00000489475 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP31.01■■■□□ 2.55
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HOXB3-210ENST00000489475 ASPRV1Q53RT3 343 aa30.99■■■□□ 2.55
HOXB3-210ENST00000489475 RASGRP2Q7LDG7 609 aa30.99■■■□□ 2.55
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HOXB3-210ENST00000489475 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP30.99■■■□□ 2.55
HOXB3-210ENST00000489475 MMP1P03956 469 aa30.98■■■□□ 2.55
HOXB3-210ENST00000489475 SNHG28P0DPA3 235 aa30.98■■■□□ 2.55
HOXB3-210ENST00000489475 ATL3Q6DD88 541 aa30.98■■■□□ 2.55
HOXB3-210ENST00000489475 TEPSINQ96N21 525 aa30.98■■■□□ 2.55
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP30.98■■■□□ 2.55
HOXB3-210ENST00000489475 SPZ1Q9BXG8 430 aa30.98■■■□□ 2.55
HOXB3-210ENST00000489475 CFAP45Q9UL16 551 aa30.98■■■□□ 2.55
HOXB3-210ENST00000489475 MYH4Q9Y623 1939 aa30.98■■■□□ 2.55
HOXB3-210ENST00000489475 SCG2P13521 617 aa30.98■■■□□ 2.55
HOXB3-210ENST00000489475 SMARCA1P28370 1054 aa30.98■■■□□ 2.55
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HOXB3-210ENST00000489475 KCNJ14Q9UNX9 436 aa30.97■■■□□ 2.55
HOXB3-210ENST00000489475 VPS54Q9P1Q0 977 aa30.96■■■□□ 2.55
HOXB3-210ENST00000489475 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP30.96■■■□□ 2.55
HOXB3-210ENST00000489475 KIF28PB7ZC32 967 aa30.96■■■□□ 2.55
HOXB3-210ENST00000489475 SIAH1Q8IUQ4 282 aa30.96■■■□□ 2.55
HOXB3-210ENST00000489475 CYTH3O43739 400 aa30.95■■■□□ 2.55
HOXB3-210ENST00000489475 GRIN3BO60391 1043 aa30.95■■■□□ 2.55
HOXB3-210ENST00000489475 DPY19L2Q6NUT2 758 aa30.95■■■□□ 2.55
HOXB3-210ENST00000489475 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa30.95■■■□□ 2.55
HOXB3-210ENST00000489475 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP30.94■■■□□ 2.54
HOXB3-210ENST00000489475 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP30.94■■■□□ 2.542e-6■□□□□ 10.7
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF543Q08ER8 600 aa30.94■■■□□ 2.54
HOXB3-210ENST00000489475 KLHL40Q2TBA0 621 aa30.94■■■□□ 2.54
HOXB3-210ENST00000489475 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP30.94■■■□□ 2.54
HOXB3-210ENST00000489475 SPATA32Q96LK8 384 aa30.94■■■□□ 2.54
HOXB3-210ENST00000489475 CAP2P40123 477 aa30.94■■■□□ 2.54
HOXB3-210ENST00000489475 SLC35G1Q2M3R5 365 aa30.94■■■□□ 2.54
HOXB3-210ENST00000489475 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP30.94■■■□□ 2.54
HOXB3-210ENST00000489475 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP30.94■■■□□ 2.54
HOXB3-210ENST00000489475 GGA3Q9NZ52 723 aa30.94■■■□□ 2.54
HOXB3-210ENST00000489475 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP30.93■■■□□ 2.54
HOXB3-210ENST00000489475 CCDC96Q2M329 555 aa30.93■■■□□ 2.54
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