RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475195.5

ATG4B-216, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 762 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-216ENST00000475195 DSCC1Q9BVC3 393 aa19.57■□□□□ 0.72
ATG4B-216ENST00000475195 IL25Q9H293 177 aa19.57■□□□□ 0.72
ATG4B-216ENST00000475195 INCENPQ9NQS7 918 aa19.57■□□□□ 0.72
ATG4B-216ENST00000475195 MTMR4Q9NYA4 1195 aa19.57■□□□□ 0.72
ATG4B-216ENST00000475195 SRRDQ9UH36 339 aa19.57■□□□□ 0.72
ATG4B-216ENST00000475195 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa19.57■□□□□ 0.72
ATG4B-216ENST00000475195 MGAMO43451 1857 aa19.56■□□□□ 0.72
ATG4B-216ENST00000475195 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP19.56■□□□□ 0.72
ATG4B-216ENST00000475195 NOVP48745 357 aa19.56■□□□□ 0.72
ATG4B-216ENST00000475195 FCGRTP55899 365 aa19.56■□□□□ 0.72
ATG4B-216ENST00000475195 TFAP4Q01664 338 aa19.56■□□□□ 0.72
ATG4B-216ENST00000475195 COG2Q14746 738 aa19.56■□□□□ 0.72
ATG4B-216ENST00000475195 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP19.56■□□□□ 0.72
ATG4B-216ENST00000475195 TXNRD2Q9NNW7 524 aa19.56■□□□□ 0.72
ATG4B-216ENST00000475195 HOXC10Q9NYD6 342 aa19.56■□□□□ 0.72
ATG4B-216ENST00000475195 RLFQ13129 1914 aa19.55■□□□□ 0.72
ATG4B-216ENST00000475195 PCP11498 1178 aaKnown RBP19.55■□□□□ 0.72
ATG4B-216ENST00000475195 Q3C1V9 767 aa19.55■□□□□ 0.72
ATG4B-216ENST00000475195 ERICH6BQ5W0A0 696 aa19.55■□□□□ 0.72
ATG4B-216ENST00000475195 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa19.55■□□□□ 0.72
ATG4B-216ENST00000475195 CEP95Q96GE4 821 aa19.55■□□□□ 0.72
ATG4B-216ENST00000475195 CCDC136Q96JN2 1154 aa19.55■□□□□ 0.72
ATG4B-216ENST00000475195 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa19.55■□□□□ 0.72
ATG4B-216ENST00000475195 RAD50Q92878 1312 aa19.54■□□□□ 0.72
ATG4B-216ENST00000475195 WDR46O15213 610 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
ATG4B-216ENST00000475195 CNMDO75829 334 aa19.54■□□□□ 0.72
ATG4B-216ENST00000475195 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP19.54■□□□□ 0.72
ATG4B-216ENST00000475195 TSPY3P0CV98 308 aa19.54■□□□□ 0.72
ATG4B-216ENST00000475195 TSPY8P0CW00 308 aa19.54■□□□□ 0.72
ATG4B-216ENST00000475195 FAM47AQ5JRC9 791 aa19.54■□□□□ 0.72
ATG4B-216ENST00000475195 RUFY2Q8WXA3 655 aa19.54■□□□□ 0.72
ATG4B-216ENST00000475195 NBPF3Q9H094 633 aa19.54■□□□□ 0.72
ATG4B-216ENST00000475195 IL17RBQ9NRM6 502 aa19.54■□□□□ 0.72
ATG4B-216ENST00000475195 CLIP2Q9UDT6 1046 aa19.54■□□□□ 0.72
ATG4B-216ENST00000475195 CCDC85CA6NKD9 419 aa19.53■□□□□ 0.72
ATG4B-216ENST00000475195 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
ATG4B-216ENST00000475195 F5H6K3 240 aa19.53■□□□□ 0.72
ATG4B-216ENST00000475195 TTLL1O95922 423 aa19.53■□□□□ 0.72
ATG4B-216ENST00000475195 NEFLP07196 543 aa19.53■□□□□ 0.72
ATG4B-216ENST00000475195 DSG3P32926 999 aa19.53■□□□□ 0.72
ATG4B-216ENST00000475195 NT5C2P49902 561 aa19.53■□□□□ 0.72
ATG4B-216ENST00000475195 ERVK-9P63128 1117 aa19.53■□□□□ 0.72
ATG4B-216ENST00000475195 ERVK-24P63145 666 aa19.53■□□□□ 0.72
ATG4B-216ENST00000475195 KLRC3Q07444 240 aa19.53■□□□□ 0.72
ATG4B-216ENST00000475195 STAG1Q8WVM7 1258 aa19.53■□□□□ 0.72
ATG4B-216ENST00000475195 ARMC5Q96C12 935 aa19.53■□□□□ 0.72
ATG4B-216ENST00000475195 GOPCQ9HD26 462 aa19.53■□□□□ 0.72
ATG4B-216ENST00000475195 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa19.53■□□□□ 0.72
ATG4B-216ENST00000475195 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa19.53■□□□□ 0.72
ATG4B-216ENST00000475195 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa19.53■□□□□ 0.72
ATG4B-216ENST00000475195 MYPNQ86TC9 1320 aa19.52■□□□□ 0.72
ATG4B-216ENST00000475195 ZNF213O14771 459 aa19.52■□□□□ 0.72
ATG4B-216ENST00000475195 PEX10O60683 326 aa19.52■□□□□ 0.72
ATG4B-216ENST00000475195 ATP2B2Q01814 1243 aa19.52■□□□□ 0.72
ATG4B-216ENST00000475195 BMP2KLQ5H9B9 411 aa19.52■□□□□ 0.72
ATG4B-216ENST00000475195 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa19.52■□□□□ 0.72
ATG4B-216ENST00000475195 AKNAD1Q5T1N1 836 aa19.52■□□□□ 0.72
ATG4B-216ENST00000475195 SPICE1Q8N0Z3 855 aa19.52■□□□□ 0.72
ATG4B-216ENST00000475195 GJD2Q9UKL4 321 aa19.52■□□□□ 0.72
ATG4B-216ENST00000475195 DOCK3Q8IZD9 2030 aa19.52■□□□□ 0.72
ATG4B-216ENST00000475195 TSPY2A6NKD2 308 aa19.51■□□□□ 0.71
ATG4B-216ENST00000475195 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
ATG4B-216ENST00000475195 SGSM2O43147 1006 aa19.51■□□□□ 0.71
ATG4B-216ENST00000475195 RGS19P49795 217 aa19.51■□□□□ 0.71
ATG4B-216ENST00000475195 IRF5Q13568 498 aa19.51■□□□□ 0.71
ATG4B-216ENST00000475195 MFSD6Q6ZSS7 791 aa19.51■□□□□ 0.71
ATG4B-216ENST00000475195 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa19.51■□□□□ 0.71
ATG4B-216ENST00000475195 BTBD7Q9P203 1132 aa19.51■□□□□ 0.71
ATG4B-216ENST00000475195 CTNNA3Q9UI47 895 aa19.51■□□□□ 0.71
ATG4B-216ENST00000475195 GABRQQ9UN88 632 aa19.51■□□□□ 0.71
ATG4B-216ENST00000475195 CAPN15O75808 1086 aa19.5■□□□□ 0.71
ATG4B-216ENST00000475195 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
ATG4B-216ENST00000475195 HAND2P61296 217 aa19.5■□□□□ 0.71
ATG4B-216ENST00000475195 PRKCZQ05513 592 aa19.5■□□□□ 0.71
ATG4B-216ENST00000475195 SKAP1Q86WV1 359 aa19.5■□□□□ 0.71
ATG4B-216ENST00000475195 MB21D1Q8N884 522 aa19.5■□□□□ 0.71
ATG4B-216ENST00000475195 COA7Q96BR5 231 aa19.5■□□□□ 0.71
ATG4B-216ENST00000475195 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
ATG4B-216ENST00000475195 MYH4Q9Y623 1939 aa19.5■□□□□ 0.71
ATG4B-216ENST00000475195 CENPFP49454 3210 aa19.49■□□□□ 0.71
ATG4B-216ENST00000475195 PARP14Q460N5 1801 aa19.49■□□□□ 0.71
ATG4B-216ENST00000475195 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
ATG4B-216ENST00000475195 NDUFB10O96000 172 aa19.49■□□□□ 0.71
ATG4B-216ENST00000475195 MAPK4P31152 587 aa19.49■□□□□ 0.71
ATG4B-216ENST00000475195 FLT3LGP49771 235 aa19.49■□□□□ 0.71
ATG4B-216ENST00000475195 NBPF11Q86T75 865 aa19.49■□□□□ 0.71
ATG4B-216ENST00000475195 TBC1D10CQ8IV04 446 aa19.49■□□□□ 0.71
ATG4B-216ENST00000475195 PXYLP1Q8TE99 480 aa19.49■□□□□ 0.71
ATG4B-216ENST00000475195 ZNF333Q96JL9 665 aa19.49■□□□□ 0.71
ATG4B-216ENST00000475195 TANGO6Q9C0B7 1094 aa19.49■□□□□ 0.71
ATG4B-216ENST00000475195 FLOT1O75955 427 aa19.48■□□□□ 0.71
ATG4B-216ENST00000475195 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
ATG4B-216ENST00000475195 FAM83BQ5T0W9 1011 aa19.48■□□□□ 0.71
ATG4B-216ENST00000475195 NKX2-3Q8TAU0 364 aa19.48■□□□□ 0.71
ATG4B-216ENST00000475195 TTC14Q96N46 770 aa19.48■□□□□ 0.71
ATG4B-216ENST00000475195 PAGR1Q9BTK6 254 aa19.48■□□□□ 0.71
ATG4B-216ENST00000475195 PORCNQ9H237 461 aa19.48■□□□□ 0.71
ATG4B-216ENST00000475195 LAMA4Q16363 1823 aa19.47■□□□□ 0.71
ATG4B-216ENST00000475195 NMT2O60551 498 aa19.47■□□□□ 0.71
ATG4B-216ENST00000475195 CCNA1P78396 465 aa19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms