RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409296.7

IPO11-202, Transcript of importin 11, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene IPO11, Length 3,564 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IPO11-202ENST00000409296 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa4.77□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 ITGB4P16144 1822 aa4.77□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 NUP98P52948 1817 aa4.77□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 A0A087WWV3 80 aa4.77□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa4.77□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 WFS1O76024 890 aa4.77□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 LMAN1P49257 510 aa4.77□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 GCKRQ14397 625 aa4.77□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 SPDYAQ5MJ70 313 aa4.77□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa4.77□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 TEX11Q8IYF3 940 aa4.77□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 C4orf32Q8N8J7 132 aa4.77□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 NCSTNQ92542 709 aa4.77□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 AZIN2Q96A70 460 aa4.77□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 TLCD1Q96CP7 247 aa4.77□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 SGSM3Q96HU1 749 aa4.77□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 GSDMAQ96QA5 445 aa4.77□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 SELENOOQ9BVL4 669 aa4.77□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 BATF3Q9NR55 127 aa4.77□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 CHPF2Q9P2E5 772 aa4.77□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 RWDD2AQ9UIY3 292 aa4.77□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 TSKSQ9UJT2 592 aa4.77□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 STRCP1A6NGW2 1772 aa4.77□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 TNRQ92752 1358 aa4.77□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 A0A087X0B3 334 aa4.76□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 PI4KAP2A4QPH2 592 aa4.76□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 ZNF233A6NK53 670 aa4.76□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 FAM107AO95990 144 aa4.76□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 GGCXP38435 758 aa4.76□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 ADCY2Q08462 1091 aa4.76□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 RBL2Q08999 1139 aa4.76□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 NEDD9Q14511 834 aa4.76□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 PTGISQ16647 500 aa4.76□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 PIGWQ7Z7B1 504 aa4.76□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 CNGA4Q8IV77 575 aa4.76□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa4.76□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 SH3TC2Q8TF17 1288 aa4.76□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 CCDC34Q96HJ3 373 aa4.76□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 MTRQ99707 1265 aa4.76□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 NDST4Q9H3R1 872 aa4.76□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 HAUS4Q9H6D7 363 aa4.76□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 TBX22Q9Y458 520 aa4.76□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 TACC3Q9Y6A5 838 aa4.76□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa4.76□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 A0A0G2JLW4 131 aa4.76□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 CTAGE9A4FU28 777 aa4.76□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 TRAPPC3O43617 180 aa4.76□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 URI1O94763 535 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 TOP1P11387 765 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 MAP2K2P36507 400 aa4.76□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa4.76□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 HAUS3Q68CZ6 603 aa4.76□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa4.76□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 CCDC170Q8IYT3 715 aa4.76□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 SLC35F6Q8N357 371 aa4.76□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 HOOK2Q96ED9 719 aa4.76□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 CTAGE1Q96RT6 745 aa4.76□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 MMS19Q96T76 1030 aa4.76□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 TMEM109Q9BVC6 243 aa4.76□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 OSBPL7Q9BZF2 842 aa4.76□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 PLCB1Q9NQ66 1216 aa4.76□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP4.76□□□□□ -1.651e-6■■■□□ 14.8
IPO11-202ENST00000409296 ZNF263O14978 683 aa4.76□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP4.76□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 FESP07332 822 aa4.76□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 GNG11P61952 73 aa4.76□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 TCEAL1Q15170 157 aa4.76□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 SPRED3Q2MJR0 410 aa4.76□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 NAA35Q5VZE5 725 aa4.76□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 ASRGL1Q7L266 308 aa4.76□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 CCDC50Q8IVM0 306 aa4.76□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 FUKQ8N0W3 1084 aa4.76□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 VGLL2Q8N8G2 317 aa4.76□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 RETREG2Q8NC44 543 aa4.76□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 TEX33O43247 280 aa4.75□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 CCT5P48643 541 aa4.75□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 PNOCQ13519 176 aa4.75□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 KCNB1Q14721 858 aa4.75□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 SLMAPQ14BN4 828 aa4.75□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 POSTNQ15063 836 aa4.75□□□□□ -1.65
IPO11-202ENST00000409296 PROSER3Q2NL68 480 aa4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.1 ms