RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP34.64■■■■□ 3.14
ECHS1-201ENST00000368547 TMTC2Q8N394 836 aa34.64■■■■□ 3.14
ECHS1-201ENST00000368547 SH2D4AQ9H788 454 aa34.64■■■■□ 3.14
ECHS1-201ENST00000368547 MTMR2Q13614 643 aa34.63■■■■□ 3.13
ECHS1-201ENST00000368547 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP34.63■■■■□ 3.13
ECHS1-201ENST00000368547 NFXL1Q6ZNB6 911 aa34.63■■■■□ 3.13
ECHS1-201ENST00000368547 HHIPL1Q96JK4 782 aa34.63■■■■□ 3.13
ECHS1-201ENST00000368547 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP34.63■■■■□ 3.13
ECHS1-201ENST00000368547 MCM2P49736 904 aa34.63■■■■□ 3.13
ECHS1-201ENST00000368547 AK2P54819 239 aa34.63■■■■□ 3.13
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC69A6NI79 296 aa34.62■■■■□ 3.13
ECHS1-201ENST00000368547 BACE1P56817 501 aa34.62■■■■□ 3.13
ECHS1-201ENST00000368547 SPRYD7Q5W111 196 aa34.62■■■■□ 3.13
ECHS1-201ENST00000368547 SGMS1Q86VZ5 419 aa34.62■■■■□ 3.13
ECHS1-201ENST00000368547 RASAL3Q86YV0 1011 aa34.62■■■■□ 3.13
ECHS1-201ENST00000368547 PNMA1Q8ND90 353 aa34.62■■■■□ 3.13
ECHS1-201ENST00000368547 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa34.62■■■■□ 3.13
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ECHS1-201ENST00000368547 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa34.61■■■■□ 3.13
ECHS1-201ENST00000368547 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP34.6■■■■□ 3.13
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ECHS1-201ENST00000368547 KCNH4Q9UQ05 1017 aa34.6■■■■□ 3.13
ECHS1-201ENST00000368547 RAD21O60216 631 aa34.59■■■■□ 3.13
ECHS1-201ENST00000368547 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP34.59■■■■□ 3.13
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ECHS1-201ENST00000368547 MTMR7Q9Y216 660 aa34.59■■■■□ 3.13
ECHS1-201ENST00000368547 CXCL11O14625 94 aa34.59■■■■□ 3.13
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ECHS1-201ENST00000368547 ANKRD1Q15327 319 aa34.59■■■■□ 3.13
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ECHS1-201ENST00000368547 GOPCQ9HD26 462 aa34.59■■■■□ 3.13
ECHS1-201ENST00000368547 C19orf81C9J6K1 198 aa34.58■■■■□ 3.13
ECHS1-201ENST00000368547 F5H6K3 240 aa34.58■■■■□ 3.13
ECHS1-201ENST00000368547 USP14P54578 494 aa34.58■■■■□ 3.13
ECHS1-201ENST00000368547 HMGCS2P54868 508 aa34.58■■■■□ 3.13
ECHS1-201ENST00000368547 C1QTNF8P60827 252 aa34.58■■■■□ 3.13
ECHS1-201ENST00000368547 KLRC3Q07444 240 aa34.58■■■■□ 3.13
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ECHS1-201ENST00000368547 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa34.58■■■■□ 3.13
ECHS1-201ENST00000368547 SLC12A7Q9Y666 1083 aa34.58■■■■□ 3.13
ECHS1-201ENST00000368547 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa34.57■■■■□ 3.12
ECHS1-201ENST00000368547 RASSF10A6NK89 507 aa34.57■■■■□ 3.12
ECHS1-201ENST00000368547 SLC10A3P09131 477 aa34.57■■■■□ 3.12
ECHS1-201ENST00000368547 DEFB115Q30KQ5 88 aa34.57■■■■□ 3.12
ECHS1-201ENST00000368547 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa34.57■■■■□ 3.12
ECHS1-201ENST00000368547 CATIPQ7Z7H3 387 aa34.57■■■■□ 3.12
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC102AQ96A19 550 aa34.57■■■■□ 3.12
ECHS1-201ENST00000368547 CHMP4CQ96CF2 233 aa34.57■■■■□ 3.12
ECHS1-201ENST00000368547 APOA5Q6Q788 366 aa34.56■■■■□ 3.12
ECHS1-201ENST00000368547 USP17L2Q6R6M4 530 aa34.56■■■■□ 3.12
ECHS1-201ENST00000368547 SPICE1Q8N0Z3 855 aa34.56■■■■□ 3.12
ECHS1-201ENST00000368547 MYL10Q9BUA6 226 aa34.56■■■■□ 3.12
ECHS1-201ENST00000368547 EMILIN3Q9NT22 766 aa34.56■■■■□ 3.12
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ECHS1-201ENST00000368547 SNAPC2Q13487 334 aa34.55■■■■□ 3.12
ECHS1-201ENST00000368547 SH3D19Q5HYK7 790 aa34.55■■■■□ 3.12
ECHS1-201ENST00000368547 RASGRP2Q7LDG7 609 aa34.55■■■■□ 3.12
ECHS1-201ENST00000368547 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP34.55■■■■□ 3.12
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ECHS1-201ENST00000368547 EVCP57679 992 aa34.55■■■■□ 3.12
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ECHS1-201ENST00000368547 CYP4F22Q6NT55 531 aa34.55■■■■□ 3.12
ECHS1-201ENST00000368547 LOC285556D6RIA3 1793 aa34.54■■■■□ 3.12
ECHS1-201ENST00000368547 TROAPQ12815 778 aa34.54■■■■□ 3.12
ECHS1-201ENST00000368547 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa34.54■■■■□ 3.12
ECHS1-201ENST00000368547 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa34.54■■■■□ 3.12
ECHS1-201ENST00000368547 TMOD4Q9NZQ9 345 aa34.54■■■■□ 3.12
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ECHS1-201ENST00000368547 DDAH1O94760 285 aa34.52■■■■□ 3.12
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ECHS1-201ENST00000368547 RXRAP19793 462 aa34.52■■■■□ 3.12
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ECHS1-201ENST00000368547 LPAR1Q92633 364 aa34.52■■■■□ 3.12
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ECHS1-201ENST00000368547 C12orf42Q96LP6 360 aa34.52■■■■□ 3.12
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ECHS1-201ENST00000368547 GADL1Q6ZQY3 521 aa34.51■■■■□ 3.11
ECHS1-201ENST00000368547 GMCL1Q96IK5 515 aa34.51■■■■□ 3.11
ECHS1-201ENST00000368547 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP34.51■■■■□ 3.11
ECHS1-201ENST00000368547 SNHG28P0DPA3 235 aa34.5■■■■□ 3.11
ECHS1-201ENST00000368547 VCAM1P19320 739 aa34.5■■■■□ 3.11
ECHS1-201ENST00000368547 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP34.5■■■■□ 3.11
ECHS1-201ENST00000368547 SLC1A4P43007 532 aa34.5■■■■□ 3.11
ECHS1-201ENST00000368547 DCAF4Q8WV16 495 aa34.5■■■■□ 3.11
ECHS1-201ENST00000368547 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa34.5■■■■□ 3.11
ECHS1-201ENST00000368547 CALM1P0DP23 149 aa34.49■■■■□ 3.11
ECHS1-201ENST00000368547 CALM2P0DP24 149 aa34.49■■■■□ 3.11
ECHS1-201ENST00000368547 CALM3P0DP25 149 aa34.49■■■■□ 3.11
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