RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225308.12

SLC25A39-201, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC25A39, Length 1,607 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-201ENST00000225308 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
SLC25A39-201ENST00000225308 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa25.68■■□□□ 1.7
SLC25A39-201ENST00000225308 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
SLC25A39-201ENST00000225308 SPICE1Q8N0Z3 855 aa25.67■■□□□ 1.7
SLC25A39-201ENST00000225308 LPAR1Q92633 364 aa25.67■■□□□ 1.7
SLC25A39-201ENST00000225308 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
SLC25A39-201ENST00000225308 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa25.67■■□□□ 1.7
SLC25A39-201ENST00000225308 ZSWIM5Q9P217 1185 aa25.67■■□□□ 1.7
SLC25A39-201ENST00000225308 STX8Q9UNK0 236 aa25.67■■□□□ 1.7
SLC25A39-201ENST00000225308 ADGRA2Q96PE1 1338 aa25.67■■□□□ 1.7
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SLC25A39-201ENST00000225308 TLR2O60603 784 aa25.66■■□□□ 1.7
SLC25A39-201ENST00000225308 LBX1P52954 281 aa25.66■■□□□ 1.7
SLC25A39-201ENST00000225308 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP25.66■■□□□ 1.78e-7■■□□□ 13.9
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SLC25A39-201ENST00000225308 NCOA7Q8NI08 942 aa25.64■■□□□ 1.7
SLC25A39-201ENST00000225308 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
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SLC25A39-201ENST00000225308 KLRC3Q07444 240 aa25.63■■□□□ 1.69
SLC25A39-201ENST00000225308 CYB5R4Q7L1T6 521 aa25.63■■□□□ 1.69
SLC25A39-201ENST00000225308 IQCA1Q86XH1 822 aa25.63■■□□□ 1.69
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SLC25A39-201ENST00000225308 USP17L15C9J2P7 530 aa25.63■■□□□ 1.69
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SLC25A39-201ENST00000225308 USP17L11C9JVI0 530 aa25.63■■□□□ 1.69
SLC25A39-201ENST00000225308 USP17L18D6R9N7 530 aa25.63■■□□□ 1.69
SLC25A39-201ENST00000225308 USP17L22D6RA61 530 aa25.63■■□□□ 1.69
SLC25A39-201ENST00000225308 USP17L17D6RBQ6 530 aa25.63■■□□□ 1.69
SLC25A39-201ENST00000225308 USP17L19D6RCP7 530 aa25.63■■□□□ 1.69
SLC25A39-201ENST00000225308 USP17L20D6RJB6 530 aa25.63■■□□□ 1.69
SLC25A39-201ENST00000225308 GPR25O00155 361 aa25.63■■□□□ 1.69
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SLC25A39-201ENST00000225308 USP17L24Q0WX57 530 aa25.63■■□□□ 1.69
SLC25A39-201ENST00000225308 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
SLC25A39-201ENST00000225308 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa25.63■■□□□ 1.69
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SLC25A39-201ENST00000225308 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
SLC25A39-201ENST00000225308 RAD21O60216 631 aa25.62■■□□□ 1.69
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SLC25A39-201ENST00000225308 C17orf99Q6UX52 265 aa25.62■■□□□ 1.69
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SLC25A39-201ENST00000225308 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
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SLC25A39-201ENST00000225308 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
SLC25A39-201ENST00000225308 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
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SLC25A39-201ENST00000225308 CPA4Q9UI42 421 aa25.61■■□□□ 1.69
SLC25A39-201ENST00000225308 HTTP42858 3142 aa25.61■■□□□ 1.69
SLC25A39-201ENST00000225308 TOP1P11387 765 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
SLC25A39-201ENST00000225308 KCNB2Q92953 911 aa25.6■■□□□ 1.69
SLC25A39-201ENST00000225308 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
SLC25A39-201ENST00000225308 UBAC1Q9BSL1 405 aa25.6■■□□□ 1.69
SLC25A39-201ENST00000225308 TANGO6Q9C0B7 1094 aa25.6■■□□□ 1.69
SLC25A39-201ENST00000225308 A0A0G2JMZ2 1700 aa25.6■■□□□ 1.69
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SLC25A39-201ENST00000225308 ANTXR2P58335 489 aa25.59■■□□□ 1.69
SLC25A39-201ENST00000225308 HERVK_113P62684 666 aa25.59■■□□□ 1.69
SLC25A39-201ENST00000225308 FAM83BQ5T0W9 1011 aa25.59■■□□□ 1.69
SLC25A39-201ENST00000225308 DGKHQ86XP1 1220 aa25.59■■□□□ 1.69
SLC25A39-201ENST00000225308 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa25.59■■□□□ 1.69
SLC25A39-201ENST00000225308 C8orf34Q49A92 452 aa25.59■■□□□ 1.69
SLC25A39-201ENST00000225308 CCDC178Q5BJE1 867 aa25.59■■□□□ 1.69
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SLC25A39-201ENST00000225308 RASGRP2Q7LDG7 609 aa25.59■■□□□ 1.69
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SLC25A39-201ENST00000225308 CHST3Q7LGC8 479 aa25.58■■□□□ 1.69
SLC25A39-201ENST00000225308 ANKS1AQ92625 1134 aa25.58■■□□□ 1.69
SLC25A39-201ENST00000225308 MGAMO43451 1857 aa25.57■■□□□ 1.68
SLC25A39-201ENST00000225308 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
SLC25A39-201ENST00000225308 ADCK5Q3MIX3 580 aa25.57■■□□□ 1.68
SLC25A39-201ENST00000225308 GMCL1Q96IK5 515 aa25.57■■□□□ 1.68
SLC25A39-201ENST00000225308 PRDM10Q9NQV6 1147 aa25.57■■□□□ 1.68
SLC25A39-201ENST00000225308 FBXO28Q9NVF7 368 aa25.57■■□□□ 1.68
SLC25A39-201ENST00000225308 DOCK3Q8IZD9 2030 aa25.57■■□□□ 1.68
SLC25A39-201ENST00000225308 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
SLC25A39-201ENST00000225308 FKTNO75072 461 aa25.56■■□□□ 1.68
SLC25A39-201ENST00000225308 SP3Q02447 781 aa25.56■■□□□ 1.68
SLC25A39-201ENST00000225308 COG2Q14746 738 aa25.56■■□□□ 1.68
SLC25A39-201ENST00000225308 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa25.56■■□□□ 1.68
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