RNA–Protein interactions for RNA: YLR349W

YLR349W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLR349W, Length 507 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR349WYLR349W YDR278CQ05612 105 aa9.21□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W YLR287CQ05881 355 aa9.21□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W CBC2Q08920 208 aaKnown RBP RIP-Chip data9.21□□□□□ -0.94not detected
YLR349WYLR349W AIM44Q99299 758 aa9.21□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W EPT1P22140 391 aa9.2□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W ELO3P40319 345 aa9.2□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W BIR1P47134 954 aa9.2□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W PMT3P47190 753 aa9.2□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W RFX1P48743 811 aa9.2□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W COG1P53079 417 aa9.2□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W GND2P53319 492 aa9.2□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W NOG2P53742 486 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W YNL247WP53852 767 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W SSL2Q00578 843 aa9.2□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W TRS23Q03784 219 aa9.2□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W MCP2Q06567 569 aa9.2□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W HBT1Q07653 1046 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W GUP2Q08929 609 aa9.2□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W PFA4Q12006 378 aa9.2□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W LSP1Q12230 341 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W YDR262WQ12331 272 aa9.2□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W IPP1P00817 287 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W TUB3P09734 445 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W YCR006CP25350 157 aa9.19□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W AEP1P32493 518 aa9.19□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W PCA1P38360 1216 aa9.19□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W DED81P38707 554 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W CYC2P38909 366 aa9.19□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W BUD13P46947 266 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W ERV41Q04651 352 aa9.19□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W DIC1Q06143 298 aa9.19□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W LDB18Q07887 179 aa9.19□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W ATE1P16639 503 aa9.18□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W SFL1P20134 766 aa9.18□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W MSB1P21339 1137 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W RTT107P38850 1070 aa9.18□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W RGD2P43556 714 aa9.18□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W SAP4P53036 818 aa9.18□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W YMR160WQ03823 816 aa9.18□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W ARX1Q03862 593 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W CIA1Q05583 330 aa9.18□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W SMF3Q12078 473 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W RRP6Q12149 733 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W ACO1P19414 778 aaKnown RBP RIP-Chip data9.17□□□□□ -0.94not detected
YLR349WYLR349W CLN1P20437 546 aa9.17□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W GMH1P36125 273 aa9.17□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W PCL5P38794 229 aa9.17□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W RPH1P39956 796 aa9.17□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W SSU1P41930 458 aa9.17□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W YFR018CP43599 363 aa9.17□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W TGL2P54857 326 aa9.17□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W YDR132CQ03900 495 aa9.17□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W MSL5Q12186 476 aaKnown RBP RIP-Chip data9.17□□□□□ -0.94not detected
YLR349WYLR349W YLR149CQ99296 730 aa9.17□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W DBF4P32325 704 aa9.16□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W SPS19P32573 292 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W FLC2P39719 783 aa9.16□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W FAU1P40099 211 aa9.16□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W ALY2P47029 1046 aa9.16□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W YGL260WP53056 76 aa9.16□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W HAP5Q02516 242 aa9.16□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W ELP4Q02884 456 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W SIZ1Q04195 904 aa9.16□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W AAD15Q08361 143 aa9.16□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W SPO12P17123 173 aa9.15□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W EMC1P25574 760 aa9.15□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W CDC13P32797 924 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W YHL008CP38750 627 aa9.15□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W STN1P38960 494 aa9.15□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W SMC2P38989 1170 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W SAW1P39735 261 aa9.15□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W SLX8P40072 274 aa9.15□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W CDC14Q00684 551 aa9.15□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W ARP9Q05123 467 aa9.15□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W GYP1Q08484 637 aa9.15□□□□□ -0.94
YLR349WYLR349W STT4P37297 1900 aa9.15□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W GFA1P14742 717 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W APA1P16550 321 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W PET309P32522 965 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W TAF14P35189 244 aa9.14□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W LYS1P38998 373 aaRIP-Chip data9.14□□□□□ -0.95not detected
YLR349WYLR349W YMR124WP39523 943 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W ARE2P53629 642 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W GSF2Q04697 403 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W RCO1Q04779 684 aa9.14□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W FRT1Q99332 602 aa9.14□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W LDB16P25587 256 aa9.13□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W MVD1P32377 396 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W PLC1P32383 869 aa9.13□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W SQT1P35184 431 aa9.13□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W EMC3P36039 253 aa9.13□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W HIS2P38635 335 aa9.13□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W DBP8P38719 431 aa9.13□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W LRO1P40345 661 aa9.13□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W IRR1P40541 1150 aa9.13□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W DJP1P40564 432 aa9.13□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W RIM21P48565 533 aa9.13□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W NMA111P53920 997 aa9.13□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W SIW14P53965 281 aa9.13□□□□□ -0.95
YLR349WYLR349W ECM9Q02202 377 aa9.13□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 255.7 ms