RNA–Protein interactions for RNA: YKL050C

YKL050C, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YKL050C, Length 2,769 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKL050C	YKL050C	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	3.82	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	KRE6	P32486	720 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	DOA4	P32571	926 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	SRP101	P32916	621 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	MUP3	P38734	546 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	YEL076C	P39971	216 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	MET18	P40469	1032 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	3.82	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	IMA1	P53051	589 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	ORC4	P54791	529 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	VPS54	Q12071	889 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	3.82	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	YLR302C	O13544	120 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	3.82	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	CDC26	P14724	124 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	UBP11	P36026	717 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	YKR051W	P36142	418 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	SLX1	P38324	304 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	3.82	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	SLS1	P42900	643 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	TCB2	P48231	1178 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	MLC1	P53141	149 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	ECM18	Q04623	453 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	TRI1	Q05024	226 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	MMR1	Q06324	491 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	YLL054C	Q12244	843 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	STE12	P13574	688 aa		3.81	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	RIT1	P23796	513 aa		3.81	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	SPS22	P25380	463 aa		3.81	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	YKR018C	P36114	725 aa		3.81	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	PRE3	P38624	215 aa		3.81	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	MSC7	P38694	644 aa		3.81	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	RRM3	P38766	723 aa		3.81	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	RSB1	Q08417	382 aa		3.81	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	YPL260W	Q08977	551 aa		3.81	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	YCK1	P23291	538 aa		3.81	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	PRD1	P25375	712 aa		3.81	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	TRK2	P28584	889 aa		3.81	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	SRO77	P38163	1010 aa		3.81	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	NGL3	Q03210	505 aa		3.81	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	RCO1	Q04779	684 aa		3.81	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	CSR2	Q12734	1121 aa		3.81	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	CTF3	Q12748	733 aa		3.81	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	MRP20	P32387	263 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	YEL057C	P39983	233 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	MAD2	P40958	196 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	SHR5	P41912	237 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	NUP85	P46673	744 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	LCL3	P53153	274 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	YNL050C	P53952	270 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	HED1	Q03937	162 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	COX17	Q12287	69 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	AFI1	Q99222	893 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	PCK1	P10963	549 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	PRO1	P32264	428 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	LTV1	P34078	463 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	YSW1	P38280	609 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	WSS1	P38838	269 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	REV7	P38927	245 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	BST1	P43571	1029 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	ALT2	P52892	507 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	HST3	P53687	447 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	HRQ1	Q05549	1077 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	ENT4	Q07872	247 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	TCO89	Q08921	799 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	NFS1	P25374	497 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	MEI5	P32489	222 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
YKL050C	YKL050C	KDX1	P36005	433 aa		3.8	□□□□□ -1.8

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