RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616558.4

SYTL1-210, Transcript of synaptotagmin like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYTL1, Length 1,878 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL1-210ENST00000616558 CIAPIN1Q6FI81 312 aa22.55■■□□□ 1.2
SYTL1-210ENST00000616558 NEDD1Q8NHV4 660 aa22.55■■□□□ 1.2
SYTL1-210ENST00000616558 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
SYTL1-210ENST00000616558 STK36Q9NRP7 1315 aa22.55■■□□□ 1.2
SYTL1-210ENST00000616558 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa22.54■■□□□ 1.2
SYTL1-210ENST00000616558 FAM196BA6NMK8 535 aa22.54■■□□□ 1.2
SYTL1-210ENST00000616558 TRIM29Q14134 588 aa22.54■■□□□ 1.2
SYTL1-210ENST00000616558 PPP2R5BQ15173 497 aa22.54■■□□□ 1.2
SYTL1-210ENST00000616558 SPDYE2BA6NHP3 402 aa22.54■■□□□ 1.2
SYTL1-210ENST00000616558 SPDYE6P0CI01 402 aa22.54■■□□□ 1.2
SYTL1-210ENST00000616558 AKR1B1P15121 316 aa22.54■■□□□ 1.2
SYTL1-210ENST00000616558 CEP95Q96GE4 821 aa22.54■■□□□ 1.2
SYTL1-210ENST00000616558 TMEM47Q9BQJ4 181 aa22.54■■□□□ 1.2
SYTL1-210ENST00000616558 SWAP70Q9UH65 585 aa22.54■■□□□ 1.2
SYTL1-210ENST00000616558 TCP10L2B9ZVM9 353 aa22.53■■□□□ 1.2
SYTL1-210ENST00000616558 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
SYTL1-210ENST00000616558 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
SYTL1-210ENST00000616558 KRT40Q6A162 431 aa22.53■■□□□ 1.2
SYTL1-210ENST00000616558 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
SYTL1-210ENST00000616558 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa22.53■■□□□ 1.2
SYTL1-210ENST00000616558 TMEM87AQ8NBN3 555 aa22.53■■□□□ 1.2
SYTL1-210ENST00000616558 WASF1Q92558 559 aa22.53■■□□□ 1.2
SYTL1-210ENST00000616558 SIPA1L1O43166 1804 aa22.53■■□□□ 1.2
SYTL1-210ENST00000616558 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa22.52■■□□□ 1.2
SYTL1-210ENST00000616558 SHMT1P34896 483 aa22.52■■□□□ 1.2
SYTL1-210ENST00000616558 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa22.52■■□□□ 1.2
SYTL1-210ENST00000616558 AGBL3Q8NEM8 1001 aa22.52■■□□□ 1.2
SYTL1-210ENST00000616558 ANKS1AQ92625 1134 aa22.52■■□□□ 1.2
SYTL1-210ENST00000616558 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
SYTL1-210ENST00000616558 TMOD2Q9NZR1 351 aa22.52■■□□□ 1.2
SYTL1-210ENST00000616558 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
SYTL1-210ENST00000616558 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 DEXIO95424 95 aa22.51■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 EIF6P56537 245 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 TMTC3Q6ZXV5 915 aa22.51■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 PIBF1Q8WXW3 757 aa22.51■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 TRIM34Q9BYJ4 488 aa22.51■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 SHTN1A0MZ66 631 aa22.51■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 PRELPP51888 382 aa22.51■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 CLEC10AQ8IUN9 316 aa22.51■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 SPATA32Q96LK8 384 aa22.51■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 PI4KBQ9UBF8 816 aa22.51■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 V9GY48 417 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 UTRNP46939 3433 aa22.51■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 KIF28PB7ZC32 967 aa22.5■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 KIF5BP33176 963 aa22.5■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 TNIP1Q15025 636 aa22.5■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 RASGRP2Q7LDG7 609 aa22.5■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP22.5■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP22.5■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 DNAJC18Q9H819 358 aa22.5■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 VEZTQ9HBM0 779 aa22.5■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 MBD3O95983 291 aa22.49■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 FUT2Q10981 343 aa22.49■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 STAG2Q8N3U4 1231 aa22.49■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 EHD4Q9H223 541 aa22.49■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 KCNJ14Q9UNX9 436 aa22.49■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 ENTPD3O75355 529 aa22.49■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 GJA3Q9Y6H8 435 aa22.49■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa22.48■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 LTBP3Q9NS15 1303 aa22.48■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 NPM3O75607 178 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 CFAP45Q9UL16 551 aa22.48■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 GOLGA8HP0CJ92 632 aa22.47■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 TOP1P11387 765 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 UBE2HP62256 183 aa22.47■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 GRM4Q14833 912 aa22.47■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 CSRNP1Q96S65 589 aa22.47■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 MTMR4Q9NYA4 1195 aa22.47■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 ATP2B2Q01814 1243 aa22.47■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 PKN1Q16512 942 aa22.47■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa22.47■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 USP28Q96RU2 1077 aa22.47■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 MAD2L2Q9UI95 211 aa22.47■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 PLIN4Q96Q06 1357 aa22.47■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 DEKP35659 375 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 SPDYE2Q495Y8 402 aa22.46■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 MYOZ2Q9NPC6 264 aa22.46■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 VPS54Q9P1Q0 977 aa22.46■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 CLIP2Q9UDT6 1046 aa22.46■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 NBPF9Q3BBW0 867 aa22.45■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 BRAPQ7Z569 592 aa22.45■■□□□ 1.19
SYTL1-210ENST00000616558 MYO1BO43795 1136 aa22.45■■□□□ 1.18
SYTL1-210ENST00000616558 MMP1P03956 469 aa22.45■■□□□ 1.18
SYTL1-210ENST00000616558 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms