RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531461.5

ACER3-211, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 2

Gene ACER3, Length 1,292 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-211ENST00000531461 USP17L15C9J2P7 530 aa29.12■■■□□ 2.25
ACER3-211ENST00000531461 USP17L13C9JLJ4 530 aa29.12■■■□□ 2.25
ACER3-211ENST00000531461 USP17L11C9JVI0 530 aa29.12■■■□□ 2.25
ACER3-211ENST00000531461 USP17L18D6R9N7 530 aa29.12■■■□□ 2.25
ACER3-211ENST00000531461 USP17L22D6RA61 530 aa29.12■■■□□ 2.25
ACER3-211ENST00000531461 USP17L17D6RBQ6 530 aa29.12■■■□□ 2.25
ACER3-211ENST00000531461 USP17L19D6RCP7 530 aa29.12■■■□□ 2.25
ACER3-211ENST00000531461 USP17L20D6RJB6 530 aa29.12■■■□□ 2.25
ACER3-211ENST00000531461 PEX10O60683 326 aa29.12■■■□□ 2.25
ACER3-211ENST00000531461 CYP2B6P20813 491 aa29.12■■■□□ 2.25
ACER3-211ENST00000531461 USP17L24Q0WX57 530 aa29.12■■■□□ 2.25
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ACER3-211ENST00000531461 PDE3AQ14432 1141 aa29.12■■■□□ 2.25
ACER3-211ENST00000531461 FEZ1Q99689 392 aa29.12■■■□□ 2.25
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ACER3-211ENST00000531461 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa29.12■■■□□ 2.25
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ACER3-211ENST00000531461 RAB11FIP3O75154 756 aa29.11■■■□□ 2.25
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ACER3-211ENST00000531461 MORN1Q5T089 497 aa29.11■■■□□ 2.25
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ACER3-211ENST00000531461 GPR142Q7Z601 462 aa29.11■■■□□ 2.25
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ACER3-211ENST00000531461 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
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ACER3-211ENST00000531461 OGDHLQ9ULD0 1010 aa29.1■■■□□ 2.25
ACER3-211ENST00000531461 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
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ACER3-211ENST00000531461 ZNF532Q9HCE3 1301 aa29.09■■■□□ 2.25
ACER3-211ENST00000531461 GOLIM4O00461 696 aa29.08■■■□□ 2.25
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ACER3-211ENST00000531461 VCAM1P19320 739 aa29.08■■■□□ 2.25
ACER3-211ENST00000531461 GUCY1A2P33402 732 aa29.08■■■□□ 2.25
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ACER3-211ENST00000531461 CCNA1P78396 465 aa29.08■■■□□ 2.25
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ACER3-211ENST00000531461 A0A1W2PPC1 479 aa29.07■■■□□ 2.24
ACER3-211ENST00000531461 CNMDO75829 334 aa29.07■■■□□ 2.24
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ACER3-211ENST00000531461 ACER1Q8TDN7 264 aa29.07■■■□□ 2.24
ACER3-211ENST00000531461 NBPF3Q9H094 633 aa29.07■■■□□ 2.24
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ACER3-211ENST00000531461 SEPT2Q15019 361 aa29.03■■■□□ 2.24
ACER3-211ENST00000531461 LCORLQ8N3X6 602 aa29.03■■■□□ 2.24
ACER3-211ENST00000531461 SDR42E1Q8WUS8 393 aa29.03■■■□□ 2.24
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ACER3-211ENST00000531461 SWAP70Q9UH65 585 aa29.03■■■□□ 2.24
ACER3-211ENST00000531461 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
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ACER3-211ENST00000531461 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
ACER3-211ENST00000531461 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa29.02■■■□□ 2.24
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ACER3-211ENST00000531461 C11orf49Q9H6J7 331 aa29.01■■■□□ 2.23
ACER3-211ENST00000531461 RCAN3Q9UKA8 241 aa29.01■■■□□ 2.23
ACER3-211ENST00000531461 LAMA3Q16787 3333 aa29■■■□□ 2.23
ACER3-211ENST00000531461 A0A1W2PRG0 241 aa29■■■□□ 2.23
ACER3-211ENST00000531461 HOXC6P09630 235 aa29■■■□□ 2.23
ACER3-211ENST00000531461 PTPREP23469 700 aa29■■■□□ 2.23
ACER3-211ENST00000531461 EVX2Q03828 476 aa29■■■□□ 2.23
ACER3-211ENST00000531461 CCL14Q16627 93 aa29■■■□□ 2.23
ACER3-211ENST00000531461 TMEM179Q6ZVK1 233 aa29■■■□□ 2.23
ACER3-211ENST00000531461 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP29■■■□□ 2.23
ACER3-211ENST00000531461 BOLA2Q9H3K6 86 aa29■■■□□ 2.23
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ACER3-211ENST00000531461 BTBD7Q9P203 1132 aa29■■■□□ 2.23
ACER3-211ENST00000531461 FRMPD3Q5JV73 1810 aa28.99■■■□□ 2.23
ACER3-211ENST00000531461 LHX8Q68G74 356 aa28.99■■■□□ 2.23
ACER3-211ENST00000531461 ARMT1Q9H993 441 aa28.99■■■□□ 2.23
ACER3-211ENST00000531461 A0A0G2JMZ2 1700 aa28.98■■■□□ 2.23
ACER3-211ENST00000531461 GRB14Q14449 540 aa28.98■■■□□ 2.23
ACER3-211ENST00000531461 COG2Q14746 738 aa28.98■■■□□ 2.23
ACER3-211ENST00000531461 UBE3CQ15386 1083 aa28.98■■■□□ 2.23
ACER3-211ENST00000531461 HOXC10Q9NYD6 342 aa28.98■■■□□ 2.23
ACER3-211ENST00000531461 ZNF236Q9UL36 1845 aa28.97■■■□□ 2.23
ACER3-211ENST00000531461 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
ACER3-211ENST00000531461 COL6A1P12109 1028 aa28.97■■■□□ 2.23
ACER3-211ENST00000531461 BMP8BP34820 402 aa28.97■■■□□ 2.23
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