RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
SH3BP2-220ENST00000511663 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
SH3BP2-220ENST00000511663 TXNRD2Q9NNW7 524 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP2-220ENST00000511663 MCM9Q9NXL9 1143 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP2-220ENST00000511663 DOCK3Q8IZD9 2030 aa23.33■■□□□ 1.32
SH3BP2-220ENST00000511663 MYH1P12882 1939 aa23.33■■□□□ 1.32
SH3BP2-220ENST00000511663 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
SH3BP2-220ENST00000511663 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
SH3BP2-220ENST00000511663 PDE6AP16499 860 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP2-220ENST00000511663 PLCD1P51178 756 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP2-220ENST00000511663 Q3C1V9 767 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP2-220ENST00000511663 C12orf42Q96LP6 360 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP2-220ENST00000511663 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP2-220ENST00000511663 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-220ENST00000511663 PLEKHH3Q7Z736 793 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-220ENST00000511663 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-220ENST00000511663 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF532Q9HCE3 1301 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-220ENST00000511663 PEX10O60683 326 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-220ENST00000511663 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-220ENST00000511663 RGS2P41220 211 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-220ENST00000511663 GPR142Q7Z601 462 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-220ENST00000511663 TRIB2Q92519 343 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-220ENST00000511663 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-220ENST00000511663 TRIM32Q13049 653 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2-220ENST00000511663 WDR78Q5VTH9 848 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2-220ENST00000511663 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2-220ENST00000511663 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP23.29■■□□□ 1.327e-9■■■□□ 15.3
SH3BP2-220ENST00000511663 NBPF3Q9H094 633 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2-220ENST00000511663 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2-220ENST00000511663 RCAN3Q9UKA8 241 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2-220ENST00000511663 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-220ENST00000511663 SHMT1P34896 483 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-220ENST00000511663 AMOTL1Q8IY63 956 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-220ENST00000511663 ACER1Q8TDN7 264 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-220ENST00000511663 PORCNQ9H237 461 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-220ENST00000511663 BOLA2Q9H3K6 86 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-220ENST00000511663 PAG1Q9NWQ8 432 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-220ENST00000511663 BRCA2P51587 3418 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP2-220ENST00000511663 VCAM1P19320 739 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP2-220ENST00000511663 SIRT2Q8IXJ6 389 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP2-220ENST00000511663 SDR42E1Q8WUS8 393 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP2-220ENST00000511663 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
SH3BP2-220ENST00000511663 DDRGK1Q96HY6 314 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP2-220ENST00000511663 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP2-220ENST00000511663 SEPT2Q15019 361 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BP2-220ENST00000511663 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
SH3BP2-220ENST00000511663 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
SH3BP2-220ENST00000511663 SWAP70Q9UH65 585 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BP2-220ENST00000511663 ATP5JP18859 108 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP2-220ENST00000511663 GABPAQ06546 454 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP2-220ENST00000511663 MORN1Q5T089 497 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP2-220ENST00000511663 LCORLQ8N3X6 602 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP2-220ENST00000511663 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
SH3BP2-220ENST00000511663 APBA2Q99767 749 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP2-220ENST00000511663 C11orf49Q9H6J7 331 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP2-220ENST00000511663 ARMT1Q9H993 441 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP2-220ENST00000511663 HOXC10Q9NYD6 342 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP2-220ENST00000511663 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa23.24■■□□□ 1.31
SH3BP2-220ENST00000511663 MAP2K5Q13163 448 aa23.24■■□□□ 1.31
SH3BP2-220ENST00000511663 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa23.24■■□□□ 1.31
SH3BP2-220ENST00000511663 MFSD14CQ5VZR4 134 aa23.24■■□□□ 1.31
SH3BP2-220ENST00000511663 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa23.24■■□□□ 1.31
SH3BP2-220ENST00000511663 USP6NLQ92738 828 aa23.24■■□□□ 1.31
SH3BP2-220ENST00000511663 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa23.24■■□□□ 1.31
SH3BP2-220ENST00000511663 OGDHLQ9ULD0 1010 aa23.24■■□□□ 1.31
SH3BP2-220ENST00000511663 ADD2P35612 726 aa23.23■■□□□ 1.31
SH3BP2-220ENST00000511663 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
SH3BP2-220ENST00000511663 COG2Q14746 738 aa23.23■■□□□ 1.31
SH3BP2-220ENST00000511663 LBX2Q6XYB7 198 aa23.23■■□□□ 1.31
SH3BP2-220ENST00000511663 TMEM179Q6ZVK1 233 aa23.23■■□□□ 1.31
SH3BP2-220ENST00000511663 LRRCC1Q9C099 1032 aa23.23■■□□□ 1.31
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC15A5A6NIM6 579 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BP2-220ENST00000511663 GUCY1A2P33402 732 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BP2-220ENST00000511663 ATP2B2Q01814 1243 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BP2-220ENST00000511663 C7orf61Q8IZ16 206 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BP2-220ENST00000511663 HAUS7Q99871 368 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BP2-220ENST00000511663 TANGO6Q9C0B7 1094 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BP2-220ENST00000511663 SH2D4AQ9H788 454 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BP2-220ENST00000511663 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BP2-220ENST00000511663 A0A1W2PPC1 479 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP2-220ENST00000511663 CNMDO75829 334 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP2-220ENST00000511663 MBD4O95243 580 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP2-220ENST00000511663 PTPREP23469 700 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP2-220ENST00000511663 CCL14Q16627 93 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP2-220ENST00000511663 POTEEQ6S8J3 1075 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP2-220ENST00000511663 CYP2D6P10635 497 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP2-220ENST00000511663 CCDC17Q96LX7 622 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP2-220ENST00000511663 BTBD7Q9P203 1132 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP2-220ENST00000511663 STAP2Q9UGK3 403 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP2-220ENST00000511663 PLXNB2O15031 1838 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP2-220ENST00000511663 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
SH3BP2-220ENST00000511663 PRKAB2O43741 272 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP2-220ENST00000511663 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
SH3BP2-220ENST00000511663 UBE3CQ15386 1083 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP2-220ENST00000511663 DPP9Q86TI2 863 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP2-220ENST00000511663 LPAR1Q92633 364 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP2-220ENST00000511663 DYNLL2Q96FJ2 89 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP2-220ENST00000511663 A0A1W2PRG0 241 aa23.18■■□□□ 1.3
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC44A5Q8NCS7 719 aa23.18■■□□□ 1.3
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