RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496909.5

HDAC10-218, Transcript of histone deacetylase 10, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC10, Length 732 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC10-218ENST00000496909 PNMA3Q9UL41 463 aa22.69■■□□□ 1.22
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HDAC10-218ENST00000496909 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.68■■□□□ 1.22
HDAC10-218ENST00000496909 ARHGEF6Q15052 776 aa22.68■■□□□ 1.22
HDAC10-218ENST00000496909 TMEM179Q6ZVK1 233 aa22.68■■□□□ 1.22
HDAC10-218ENST00000496909 AMOTL1Q8IY63 956 aa22.68■■□□□ 1.22
HDAC10-218ENST00000496909 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
HDAC10-218ENST00000496909 CCDC17Q96LX7 622 aa22.68■■□□□ 1.22
HDAC10-218ENST00000496909 FAM227BQ96M60 508 aa22.68■■□□□ 1.22
HDAC10-218ENST00000496909 MYH7P12883 1935 aa22.68■■□□□ 1.22
HDAC10-218ENST00000496909 ATAD5Q96QE3 1844 aa22.68■■□□□ 1.22
HDAC10-218ENST00000496909 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
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HDAC10-218ENST00000496909 OSBPP22059 807 aa22.67■■□□□ 1.22
HDAC10-218ENST00000496909 KIF22Q14807 665 aa22.67■■□□□ 1.22
HDAC10-218ENST00000496909 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa22.67■■□□□ 1.22
HDAC10-218ENST00000496909 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa22.67■■□□□ 1.22
HDAC10-218ENST00000496909 ROBO3Q96MS0 1386 aa22.66■■□□□ 1.22
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HDAC10-218ENST00000496909 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
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HDAC10-218ENST00000496909 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
HDAC10-218ENST00000496909 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa22.66■■□□□ 1.22
HDAC10-218ENST00000496909 CLEC10AQ8IUN9 316 aa22.66■■□□□ 1.22
HDAC10-218ENST00000496909 HELLSQ9NRZ9 838 aa22.66■■□□□ 1.22
HDAC10-218ENST00000496909 LOC285556D6RIA3 1793 aa22.66■■□□□ 1.22
HDAC10-218ENST00000496909 A0A0D9SFI3 127 aa22.65■■□□□ 1.22
HDAC10-218ENST00000496909 PEX10O60683 326 aa22.65■■□□□ 1.22
HDAC10-218ENST00000496909 USP14P54578 494 aa22.65■■□□□ 1.22
HDAC10-218ENST00000496909 FAM110CQ1W6H9 321 aa22.65■■□□□ 1.22
HDAC10-218ENST00000496909 VPS53Q5VIR6 699 aa22.65■■□□□ 1.22
HDAC10-218ENST00000496909 FEZ1Q99689 392 aa22.65■■□□□ 1.22
HDAC10-218ENST00000496909 SRRDQ9UH36 339 aa22.65■■□□□ 1.22
HDAC10-218ENST00000496909 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
HDAC10-218ENST00000496909 VCAM1P19320 739 aa22.64■■□□□ 1.21
HDAC10-218ENST00000496909 RASA1P20936 1047 aa22.64■■□□□ 1.21
HDAC10-218ENST00000496909 TDO2P48775 406 aa22.64■■□□□ 1.21
HDAC10-218ENST00000496909 HERVK_113P62684 666 aa22.64■■□□□ 1.21
HDAC10-218ENST00000496909 ARMC5Q96C12 935 aa22.64■■□□□ 1.21
HDAC10-218ENST00000496909 TXNRD2Q9NNW7 524 aa22.64■■□□□ 1.21
HDAC10-218ENST00000496909 RBPJLQ9UBG7 517 aa22.64■■□□□ 1.21
HDAC10-218ENST00000496909 MORF4L1Q9UBU8 362 aa22.64■■□□□ 1.21
HDAC10-218ENST00000496909 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
HDAC10-218ENST00000496909 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa22.63■■□□□ 1.21
HDAC10-218ENST00000496909 SDSP20132 328 aa22.63■■□□□ 1.21
HDAC10-218ENST00000496909 PRMT2P55345 433 aa22.63■■□□□ 1.21
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HDAC10-218ENST00000496909 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa22.63■■□□□ 1.21
HDAC10-218ENST00000496909 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa22.63■■□□□ 1.21
HDAC10-218ENST00000496909 STK11IPQ8N1F8 1099 aa22.63■■□□□ 1.21
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HDAC10-218ENST00000496909 USP17L15C9J2P7 530 aa22.62■■□□□ 1.21
HDAC10-218ENST00000496909 USP17L13C9JLJ4 530 aa22.62■■□□□ 1.21
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HDAC10-218ENST00000496909 USP17L18D6R9N7 530 aa22.62■■□□□ 1.21
HDAC10-218ENST00000496909 USP17L22D6RA61 530 aa22.62■■□□□ 1.21
HDAC10-218ENST00000496909 USP17L17D6RBQ6 530 aa22.62■■□□□ 1.21
HDAC10-218ENST00000496909 USP17L19D6RCP7 530 aa22.62■■□□□ 1.21
HDAC10-218ENST00000496909 USP17L20D6RJB6 530 aa22.62■■□□□ 1.21
HDAC10-218ENST00000496909 FCGRTP55899 365 aa22.62■■□□□ 1.21
HDAC10-218ENST00000496909 USP17L24Q0WX57 530 aa22.62■■□□□ 1.21
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HDAC10-218ENST00000496909 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa22.61■■□□□ 1.21
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HDAC10-218ENST00000496909 ALX1Q15699 326 aa22.61■■□□□ 1.21
HDAC10-218ENST00000496909 Q3C1V9 767 aa22.61■■□□□ 1.21
HDAC10-218ENST00000496909 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
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HDAC10-218ENST00000496909 KANSL2Q9H9L4 492 aa22.61■■□□□ 1.21
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HDAC10-218ENST00000496909 TACC3Q9Y6A5 838 aa22.61■■□□□ 1.21
HDAC10-218ENST00000496909 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa22.6■■□□□ 1.21
HDAC10-218ENST00000496909 PRDM1O75626 825 aa22.6■■□□□ 1.21
HDAC10-218ENST00000496909 EEF2P13639 858 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
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HDAC10-218ENST00000496909 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
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HDAC10-218ENST00000496909 ZNF333Q96JL9 665 aa22.59■■□□□ 1.21
HDAC10-218ENST00000496909 CNMDO75829 334 aa22.58■■□□□ 1.21
HDAC10-218ENST00000496909 FGAP02671 866 aa22.58■■□□□ 1.21
HDAC10-218ENST00000496909 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
HDAC10-218ENST00000496909 LBX2Q6XYB7 198 aa22.58■■□□□ 1.21
HDAC10-218ENST00000496909 SH3TC2Q8TF17 1288 aa22.58■■□□□ 1.21
HDAC10-218ENST00000496909 VCPKMTQ9H867 229 aa22.58■■□□□ 1.21
HDAC10-218ENST00000496909 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa22.58■■□□□ 1.21
HDAC10-218ENST00000496909 INCENPQ9NQS7 918 aa22.58■■□□□ 1.21
HDAC10-218ENST00000496909 ANAPC4Q9UJX5 808 aa22.58■■□□□ 1.21
HDAC10-218ENST00000496909 GJD2Q9UKL4 321 aa22.58■■□□□ 1.21
HDAC10-218ENST00000496909 MYPNQ86TC9 1320 aa22.57■■□□□ 1.2
HDAC10-218ENST00000496909 FLT3LGP49771 235 aa22.57■■□□□ 1.2
HDAC10-218ENST00000496909 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa22.57■■□□□ 1.2
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