RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 VPS37BQ9H9H4 285 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 DONSONQ9NYP3 566 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 TRIM75PA6NK02 468 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 CTNNA2P26232 953 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 RXRBP28702 533 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 STAT6P42226 847 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 CSRNP1Q96S65 589 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 FOXP3Q9BZS1 431 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 SPTLC2O15270 562 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 AKR1B10O60218 316 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 HIP1RO75146 1068 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM132AQ24JP5 1023 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 FAM196AQ6ZSG2 479 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 AK8Q96MA6 479 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 EFHD1Q9BUP0 239 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 PZPP20742 1482 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 MBD5Q9P267 1494 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 KRT5P13647 590 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 CUL4BQ13620 913 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 LIN9Q5TKA1 542 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 PDXDC1Q6P996 788 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 MFSD6Q6ZSS7 791 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 FOXD4L1Q9NU39 408 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 KRT2P35908 639 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 CCDC96Q2M329 555 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 EMBQ6PCB8 327 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 MCM10Q7L590 875 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 GBP5Q96PP8 586 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 SPEF2Q9C093 1822 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 GOLGA8BA8MQT2 603 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 E7ENQ6 273 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 KRT16P08779 473 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 BCRP11274 1271 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 HOXC9P31274 260 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 NLRP12P59046 1061 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 RASSF7Q02833 373 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 DIP2AQ14689 1571 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 HS2ST1Q7LGA3 356 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 USHBP1Q8N6Y0 703 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 MCM9Q9NXL9 1143 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 NDUFA13Q9P0J0 144 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 PPLO60437 1756 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 LRRD1A4D1F6 860 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 FLIIQ13045 1269 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 LRCH2Q5VUJ6 765 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 MTRQ99707 1265 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 TRIM15Q9C019 465 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 CETN3O15182 167 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 ATP8B2P98198 1209 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 TMED1Q13445 227 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 TMX3Q96JJ7 454 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 NUF2Q9BZD4 464 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 TNKSO95271 1327 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 EFCAB6Q5THR3 1501 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 MADDQ8WXG6 1647 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 DENND2CQ68D51 928 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 TMC4Q7Z404 712 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 CABS1Q96KC9 395 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 TXNDC16Q9P2K2 825 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 WWC3Q9ULE0 1092 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 CHD4Q14839 1912 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 MROH1Q8NDA8 1641 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 ERVV-2B6SEH9 535 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 SMAPO00193 183 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 NNTQ13423 1086 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 SNCBQ16143 134 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 ANO6Q4KMQ2 910 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 ZBTB43O43298 467 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 DEXIO95424 95 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 TRIM27P14373 513 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 PBKQ96KB5 322 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRD-201ENST00000355233 C6orf50Q9HD87 102 aa5.44□□□□□ -1.54
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