RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 CMA1P23946 247 aa23.47■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 STRN3Q13033 797 aa23.47■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 NBPF14Q5TI25 921 aa23.47■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 ATP11AP98196 1134 aa23.47■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 KAT6BQ8WYB5 2073 aa23.47■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 RGS12O14924 1447 aa23.47■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 CIB2O75838 187 aa23.47■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 SAR1BQ9Y6B6 198 aa23.47■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 A0A0D9SFI3 127 aa23.46■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 UBAP1LF5GYI3 381 aa23.46■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 SLC8A3P57103 927 aa23.46■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 TFAP4Q01664 338 aa23.46■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 PTH1RQ03431 593 aa23.46■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 TCIRG1Q13488 830 aa23.46■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP23.46■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 EXOC3O60645 756 aa23.46■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 PPARAQ07869 468 aa23.46■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 DNAJC10Q8IXB1 793 aa23.46■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 ASIC3Q9UHC3 531 aa23.46■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 NR1I2O75469 434 aa23.46■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 OAS2P29728 719 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 PEX26Q7Z412 305 aa23.46■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 HARSP12081 509 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 TRPC3Q13507 836 aa23.46■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 LONRF3Q496Y0 759 aa23.46■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 KLHL7Q8IXQ5 586 aa23.46■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
CCSAP-201ENST00000284617 GAS8O95995 478 aa23.45■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 TPCN1Q9ULQ1 816 aa23.45■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 FAM135BQ49AJ0 1406 aa23.45■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 SNX16P57768 344 aa23.45■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM31Q9BZY9 425 aa23.45■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 BCL2L12Q9HB09 334 aa23.45■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 PALD1Q9ULE6 856 aa23.45■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 E7EVH7 732 aa23.45■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM58Q8NG06 486 aa23.45■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 STAMQ92783 540 aa23.45■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 CABS1Q96KC9 395 aa23.45■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 BLZF1Q9H2G9 400 aa23.45■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1B0GUA9 196 aa23.44■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa23.44■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 KIFC2Q96AC6 838 aa23.44■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 MYCT1Q8N699 235 aa23.44■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 RRAGAQ7L523 313 aa23.44■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 HAUS7Q99871 368 aa23.44■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 ADKP55263 362 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 MAIP1Q8WWC4 291 aa23.44■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 CFAP57Q96MR6 1250 aa23.44■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 PLCB1Q9NQ66 1216 aa23.44■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 ATP7AQ04656 1500 aa23.43■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 ERVV-2B6SEH9 535 aa23.43■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 DTNBO60941 627 aa23.43■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 NELFCDQ8IXH7 590 aa23.43■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 VTI1AQ96AJ9 217 aa23.43■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa23.43■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 ETF1P62495 437 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 ORAI2Q96SN7 254 aa23.43■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 ZMYM6O95789 1325 aa23.42■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 TYW1BQ6NUM6 668 aa23.42■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 STAP2Q9UGK3 403 aa23.42■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 FAM184BQ9ULE4 1060 aa23.42■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 GCNT3O95395 438 aa23.42■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 DNM2P50570 870 aa23.42■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 ABCC2Q92887 1545 aa23.42■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 NEDD9Q14511 834 aa23.42■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 SMC1BQ8NDV3 1235 aa23.42■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 TTC16Q8NEE8 873 aa23.42■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 PSMB7Q99436 277 aa23.42■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 RAB17Q9H0T7 212 aa23.42■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 KCNJ18B7U540 433 aa23.42■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 KCNJ12Q14500 433 aa23.42■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 C2CD5Q86YS7 1000 aa23.42■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa23.42■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 PPFIA4O75335 1185 aa23.41■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 PARP2Q9UGN5 583 aa23.41■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 KCNG1Q9UIX4 513 aa23.41■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 FANCBQ8NB91 859 aa23.41■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa23.41■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 TBC1D7Q9P0N9 293 aa23.41■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 ERBB4Q15303 1308 aa23.41■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 NOL3O60936 208 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa23.41■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC105Q8IYK2 499 aa23.41■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa23.4■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 SMCO2A6NFE2 343 aa23.4■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 IFNL3Q8IZI9 196 aa23.4■■□□□ 1.34
CCSAP-201ENST00000284617 IL17REQ8NFR9 667 aa23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms