RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225308.12

SLC25A39-201, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC25A39, Length 1,607 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-201ENST00000225308 AKNAD1Q5T1N1 836 aa25.81■■□□□ 1.72
SLC25A39-201ENST00000225308 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
SLC25A39-201ENST00000225308 FAM43AQ8N2R8 423 aa25.81■■□□□ 1.72
SLC25A39-201ENST00000225308 ACER1Q8TDN7 264 aa25.81■■□□□ 1.72
SLC25A39-201ENST00000225308 STAG1Q8WVM7 1258 aa25.81■■□□□ 1.72
SLC25A39-201ENST00000225308 ANO2Q9NQ90 1003 aa25.81■■□□□ 1.72
SLC25A39-201ENST00000225308 RNF186Q9NXI6 227 aa25.81■■□□□ 1.72
SLC25A39-201ENST00000225308 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
SLC25A39-201ENST00000225308 BTBD19C9JJ37 291 aa25.8■■□□□ 1.72
SLC25A39-201ENST00000225308 USP17L10C9JJH3 530 aa25.8■■□□□ 1.72
SLC25A39-201ENST00000225308 DGKZQ13574 1117 aa25.8■■□□□ 1.72
SLC25A39-201ENST00000225308 SH3D19Q5HYK7 790 aa25.8■■□□□ 1.72
SLC25A39-201ENST00000225308 SIAH1Q8IUQ4 282 aa25.8■■□□□ 1.72
SLC25A39-201ENST00000225308 BEGAINQ9BUH8 593 aa25.8■■□□□ 1.72
SLC25A39-201ENST00000225308 TRPA1O75762 1119 aa25.79■■□□□ 1.72
SLC25A39-201ENST00000225308 ICA1Q05084 483 aa25.79■■□□□ 1.72
SLC25A39-201ENST00000225308 FAM47AQ5JRC9 791 aa25.79■■□□□ 1.72
SLC25A39-201ENST00000225308 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
SLC25A39-201ENST00000225308 NEDD4P46934 1319 aa25.78■■□□□ 1.72
SLC25A39-201ENST00000225308 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa25.78■■□□□ 1.72
SLC25A39-201ENST00000225308 A0A1W2PRG0 241 aa25.78■■□□□ 1.72
SLC25A39-201ENST00000225308 CYP21A2P08686 494 aa25.78■■□□□ 1.72
SLC25A39-201ENST00000225308 PCP11498 1178 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
SLC25A39-201ENST00000225308 MFSD6Q6ZSS7 791 aa25.78■■□□□ 1.72
SLC25A39-201ENST00000225308 KANSL2Q9H9L4 492 aa25.78■■□□□ 1.72
SLC25A39-201ENST00000225308 SAGE1Q9NXZ1 904 aa25.78■■□□□ 1.72
SLC25A39-201ENST00000225308 CA12O43570 354 aa25.77■■□□□ 1.72
SLC25A39-201ENST00000225308 TFAP4Q01664 338 aa25.77■■□□□ 1.72
SLC25A39-201ENST00000225308 GPAT2Q6NUI2 795 aa25.77■■□□□ 1.72
SLC25A39-201ENST00000225308 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
SLC25A39-201ENST00000225308 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
SLC25A39-201ENST00000225308 NEDD1Q8NHV4 660 aa25.77■■□□□ 1.72
SLC25A39-201ENST00000225308 NKX2-3Q8TAU0 364 aa25.77■■□□□ 1.72
SLC25A39-201ENST00000225308 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa25.77■■□□□ 1.72
SLC25A39-201ENST00000225308 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
SLC25A39-201ENST00000225308 C19orf81C9J6K1 198 aa25.77■■□□□ 1.72
SLC25A39-201ENST00000225308 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
SLC25A39-201ENST00000225308 ALDH1A1P00352 501 aa25.77■■□□□ 1.72
SLC25A39-201ENST00000225308 TSPY3P0CV98 308 aa25.77■■□□□ 1.72
SLC25A39-201ENST00000225308 TSPY8P0CW00 308 aa25.77■■□□□ 1.72
SLC25A39-201ENST00000225308 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa25.77■■□□□ 1.72
SLC25A39-201ENST00000225308 GADL1Q6ZQY3 521 aa25.77■■□□□ 1.72
SLC25A39-201ENST00000225308 ANKRD23Q86SG2 305 aa25.77■■□□□ 1.72
SLC25A39-201ENST00000225308 FEZ1Q99689 392 aa25.77■■□□□ 1.72
SLC25A39-201ENST00000225308 TOMM22Q9NS69 142 aa25.77■■□□□ 1.72
SLC25A39-201ENST00000225308 FOXN1O15353 648 aa25.76■■□□□ 1.71
SLC25A39-201ENST00000225308 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
SLC25A39-201ENST00000225308 CEP95Q96GE4 821 aa25.76■■□□□ 1.71
SLC25A39-201ENST00000225308 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
SLC25A39-201ENST00000225308 EMILIN3Q9NT22 766 aa25.76■■□□□ 1.71
SLC25A39-201ENST00000225308 TAF6LQ9Y6J9 622 aa25.76■■□□□ 1.71
SLC25A39-201ENST00000225308 TSPY2A6NKD2 308 aa25.75■■□□□ 1.71
SLC25A39-201ENST00000225308 EEF2P13639 858 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
SLC25A39-201ENST00000225308 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
SLC25A39-201ENST00000225308 TREML2Q5T2D2 321 aa25.75■■□□□ 1.71
SLC25A39-201ENST00000225308 TSKSQ9UJT2 592 aa25.75■■□□□ 1.71
SLC25A39-201ENST00000225308 CFHR5Q9BXR6 569 aa25.74■■□□□ 1.71
SLC25A39-201ENST00000225308 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa25.74■■□□□ 1.71
SLC25A39-201ENST00000225308 MTMR4Q9NYA4 1195 aa25.74■■□□□ 1.71
SLC25A39-201ENST00000225308 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa25.74■■□□□ 1.71
SLC25A39-201ENST00000225308 PDHXO00330 501 aa25.74■■□□□ 1.71
SLC25A39-201ENST00000225308 C12orf42Q96LP6 360 aa25.74■■□□□ 1.71
SLC25A39-201ENST00000225308 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa25.74■■□□□ 1.71
SLC25A39-201ENST00000225308 IL17RBQ9NRM6 502 aa25.74■■□□□ 1.71
SLC25A39-201ENST00000225308 TMX2Q9Y320 296 aa25.74■■□□□ 1.71
SLC25A39-201ENST00000225308 NMT2O60551 498 aa25.73■■□□□ 1.71
SLC25A39-201ENST00000225308 USP14P54578 494 aa25.73■■□□□ 1.71
SLC25A39-201ENST00000225308 CRHR2Q13324 411 aa25.73■■□□□ 1.71
SLC25A39-201ENST00000225308 NECTIN1Q15223 517 aa25.73■■□□□ 1.71
SLC25A39-201ENST00000225308 USP17L2Q6R6M4 530 aa25.73■■□□□ 1.71
SLC25A39-201ENST00000225308 TMOD4Q9NZQ9 345 aa25.73■■□□□ 1.71
SLC25A39-201ENST00000225308 NYAP2Q9P242 653 aa25.73■■□□□ 1.71
SLC25A39-201ENST00000225308 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa25.72■■□□□ 1.71
SLC25A39-201ENST00000225308 TBC1D8O95759 1140 aa25.72■■□□□ 1.71
SLC25A39-201ENST00000225308 ATP2B2Q01814 1243 aa25.72■■□□□ 1.71
SLC25A39-201ENST00000225308 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
SLC25A39-201ENST00000225308 B4E1Z4 1266 aa25.71■■□□□ 1.71
SLC25A39-201ENST00000225308 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa25.71■■□□□ 1.71
SLC25A39-201ENST00000225308 ESR2Q92731 530 aa25.71■■□□□ 1.71
SLC25A39-201ENST00000225308 SH2D4AQ9H788 454 aa25.71■■□□□ 1.71
SLC25A39-201ENST00000225308 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa25.71■■□□□ 1.71
SLC25A39-201ENST00000225308 STOX1Q6ZVD7 989 aa25.7■■□□□ 1.71
SLC25A39-201ENST00000225308 CNNM2Q9H8M5 875 aa25.7■■□□□ 1.71
SLC25A39-201ENST00000225308 SLC27A2O14975 620 aa25.7■■□□□ 1.7
SLC25A39-201ENST00000225308 KDM4AO75164 1064 aa25.7■■□□□ 1.7
SLC25A39-201ENST00000225308 TTLL1O95922 423 aa25.7■■□□□ 1.7
SLC25A39-201ENST00000225308 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
SLC25A39-201ENST00000225308 VCAM1P19320 739 aa25.7■■□□□ 1.7
SLC25A39-201ENST00000225308 VCPKMTQ9H867 229 aa25.7■■□□□ 1.7
SLC25A39-201ENST00000225308 PARP14Q460N5 1801 aa25.69■■□□□ 1.7
SLC25A39-201ENST00000225308 E7EWF7 191 aa25.69■■□□□ 1.7
SLC25A39-201ENST00000225308 REC8O95072 547 aa25.69■■□□□ 1.7
SLC25A39-201ENST00000225308 NT5C2P49902 561 aa25.69■■□□□ 1.7
SLC25A39-201ENST00000225308 CREB3L3Q68CJ9 461 aa25.69■■□□□ 1.7
SLC25A39-201ENST00000225308 MKL1Q969V6 931 aa25.69■■□□□ 1.7
SLC25A39-201ENST00000225308 KRT23Q9C075 422 aa25.69■■□□□ 1.7
SLC25A39-201ENST00000225308 CLIP2Q9UDT6 1046 aa25.69■■□□□ 1.7
SLC25A39-201ENST00000225308 RLFQ13129 1914 aa25.68■■□□□ 1.7
SLC25A39-201ENST00000225308 CYP2C8P10632 490 aa25.68■■□□□ 1.7
SLC25A39-201ENST00000225308 NOVP48745 357 aa25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 122.3 ms