RNA–Protein interactions for RNA: tK(UUU)P

tK(UUU)P, Transcript of Lysine tRNA (tRNA-Lys), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tK(UUU)P, Length 73 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tK(UUU)PtK(UUU)P RRT5P43607 289 aa3.33□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P RPC17P47076 161 aa3.33□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P NNF1P47149 201 aa3.33□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P COQ5P49017 307 aa3.33□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P APT1P49435 187 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P AMA1P50082 593 aa3.33□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P RTA1P53047 317 aa3.33□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P YGL140CP53120 1219 aa3.33□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P TEP1P53916 434 aa3.33□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P AQR1P53943 586 aa3.33□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P YDR131CQ03899 556 aa3.33□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P YMR114CQ04471 368 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P UFO1Q04511 668 aa3.33□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P YFT2Q06676 274 aa3.33□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P VAC14Q06708 880 aa3.33□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P HBT1Q07653 1046 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P ADY3Q07732 790 aa3.33□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P CMS1Q07897 291 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P CBC2Q08920 208 aaKnown RBP RIP-Chip data3.33□□□□□ -1.88not detected
tK(UUU)PtK(UUU)P RTK1Q12100 620 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P AI5_ALPHAQ9ZZX1 630 aa3.33□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P SEN1Q00416 2231 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P INH1P01097 85 aa3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P INO1P11986 533 aa3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P UBA1P22515 1024 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P AAT2P23542 418 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P YSP3P25036 478 aa3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P YCR015CP25616 317 aa3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P BRF1P29056 596 aa3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P PLC1P32383 869 aa3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P SPS19P32573 292 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P BYE1P36106 594 aa3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P PCH2P38126 564 aa3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P OLA1P38219 394 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P RCK2P38623 610 aa3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P YAT2P40017 923 aa3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P YMR134WP40207 237 aa3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P TIF34P40217 347 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P NDC80P40460 691 aa3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P RPL34BP40525 121 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P PXA1P41909 870 aa3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P JSN1P47135 1091 aaKnown RBP RIP-Chip data3.32□□□□□ -1.88not detected
tK(UUU)PtK(UUU)P BRO1P48582 844 aa3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P MNT2P53059 558 aa3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P NRD1P53617 575 aaKnown RBP RIP-Chip data3.32□□□□□ -1.88not detected
tK(UUU)PtK(UUU)P SIW14P53965 281 aa3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P RPL22BP56628 122 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P RPL34AP87262 121 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P YPL113CQ02961 396 aa3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P PIR1Q03178 341 aa3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P YDR109CQ04585 715 aa3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P ARG7Q04728 441 aa3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P CIA1Q05583 330 aa3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P YLR456WQ06199 204 aa3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P ESC2Q06340 456 aa3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P YLL032CQ07834 825 aaKnown RBP RIP-Chip data3.32□□□□□ -1.88not detected
tK(UUU)PtK(UUU)P YLR001CQ07895 862 aa3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P TFB4Q12004 338 aa3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P APL4Q12028 832 aa3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P AVL9Q12500 764 aa3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P FRT1Q99332 602 aa3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P Q0182Q9ZZW1 134 aa3.32□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P MDM35O60200 86 aa3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P COX5AP00424 153 aa3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P CPA1P07258 411 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P LEU1P07264 779 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P SBP1P10080 294 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P VAN1P23642 535 aa3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P RAD57P25301 460 aa3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P DCC1P25559 380 aa3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P AEP1P32493 518 aa3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P SPT16P32558 1035 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P RML2P32611 393 aa3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P YEL043WP32618 956 aa3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P SLX5P32828 619 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P UBP14P38237 781 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P POP4P38336 279 aa3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P YBR259WP38338 688 aa3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P SMF2P38778 549 aa3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P PPE1P38796 400 aa3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P YPT35P38815 214 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P END3P39013 349 aa3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P ELO1P39540 310 aa3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P ATM1P40416 690 aa3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P SER33P40510 469 aa3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P REF2P42073 533 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P OSW7P43611 510 aa3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P NUP85P46673 744 aa3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P ARH1P48360 493 aa3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P TRF5P48561 642 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P STR3P53101 465 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P YGL108CP53139 140 aa3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P SWC4P53201 476 aa3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P RTS3P53289 263 aa3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P CWC22P53333 577 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P YPR003CP53394 754 aa3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P YMR187CQ03236 431 aa3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P TRM82Q03774 444 aa3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P SML1Q04964 104 aa3.31□□□□□ -1.88
tK(UUU)PtK(UUU)P ARP9Q05123 467 aa3.31□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 128.4 ms