RNA–Protein interactions for RNA: YKR081C

RPF2, Transcript of Essential protein involved in rRNA maturation and ribosomal assembly, yeast

Gene RPF2, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPF2	YKR081C	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPF2	YKR081C	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPF2	YKR081C	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPF2	YKR081C	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPF2	YKR081C	ERV46	P39727	415 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPF2	YKR081C	NPA3	P47122	385 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPF2	YKR081C	ARA2	Q04212	335 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPF2	YKR081C	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RPF2	YKR081C	PTC6	P25646	442 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPF2	YKR081C	GSH1	P32477	678 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPF2	YKR081C	APM3	P38153	483 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPF2	YKR081C	QRI7	P43122	407 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPF2	YKR081C	IRC8	P47046	822 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPF2	YKR081C	ORC5	P50874	479 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPF2	YKR081C	VTC3	Q02725	835 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPF2	YKR081C	ATG21	Q02887	496 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPF2	YKR081C	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RPF2	YKR081C	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RPF2	YKR081C	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RPF2	YKR081C	HER1	Q12276	1246 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPF2	YKR081C	POL3	P15436	1097 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPF2	YKR081C	LAC1	P28496	418 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPF2	YKR081C	MGM1	P32266	881 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPF2	YKR081C	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RPF2	YKR081C	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RPF2	YKR081C	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RPF2	YKR081C	GAL1	P04385	528 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RPF2	YKR081C	PIF1	P07271	859 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RPF2	YKR081C	RIT1	P23796	513 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RPF2	YKR081C	PTP2	P29461	750 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RPF2	YKR081C	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RPF2	YKR081C	HES1	P35843	434 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RPF2	YKR081C	FLO5	P38894	1075 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RPF2	YKR081C	UBP7	P40453	1071 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RPF2	YKR081C	YGR079W	P53249	370 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RPF2	YKR081C	TDA9	Q04545	1251 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RPF2	YKR081C	GTB1	Q04924	702 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RPF2	YKR081C	THI3	Q07471	609 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RPF2	YKR081C	PFA4	Q12006	378 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RPF2	YKR081C	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RPF2	YKR081C	COX1	P00401	534 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RPF2	YKR081C	GAL4	P04386	881 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RPF2	YKR081C	ATP4	P05626	244 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RPF2	YKR081C	BIK1	P11709	440 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RPF2	YKR081C	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
RPF2	YKR081C	MSS51	P32335	436 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RPF2	YKR081C	HIS6	P40545	261 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RPF2	YKR081C	YJL107C	P42947	387 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RPF2	YKR081C	UBX6	P47049	396 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RPF2	YKR081C	IMA1	P53051	589 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RPF2	YKR081C	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
RPF2	YKR081C	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
RPF2	YKR081C	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
RPF2	YKR081C	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
RPF2	YKR081C	MSS18	P08593	268 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RPF2	YKR081C	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
RPF2	YKR081C	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
RPF2	YKR081C	URK1	P27515	501 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RPF2	YKR081C	ARN1	P38731	627 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RPF2	YKR081C	MEP2	P41948	499 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RPF2	YKR081C	PET122	P10355	254 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPF2	YKR081C	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
RPF2	YKR081C	CNA1	P23287	553 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPF2	YKR081C	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
RPF2	YKR081C	MSH1	P25846	959 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPF2	YKR081C	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
RPF2	YKR081C	SKP2	P42843	763 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPF2	YKR081C	HIM1	Q06674	414 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPF2	YKR081C	ATX2	Q12067	313 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPF2	YKR081C	SUL2	Q12325	893 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPF2	YKR081C	RRI1	Q12468	440 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPF2	YKR081C	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RPF2	YKR081C	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RPF2	YKR081C	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RPF2	YKR081C	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RPF2	YKR081C	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RPF2	YKR081C	SPC72	P39723	622 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RPF2	YKR081C	MDV1	P47025	714 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RPF2	YKR081C	TAM41	P53230	385 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RPF2	YKR081C	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RPF2	YKR081C	YDR109C	Q04585	715 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RPF2	YKR081C	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RPF2	YKR081C	PXL1	P36166	706 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPF2	YKR081C	SCO2	P38072	301 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPF2	YKR081C	BUD16	P39988	312 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPF2	YKR081C	PHM8	P40025	321 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPF2	YKR081C	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RPF2	YKR081C	YIR016W	P40572	265 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPF2	YKR081C	CDC1	P40986	491 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPF2	YKR081C	YPR003C	P53394	754 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPF2	YKR081C	ATG23	Q06671	453 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPF2	YKR081C	BAG7	Q12128	409 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPF2	YKR081C	DJP1	P40564	432 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPF2	YKR081C	MSY1	P48527	492 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPF2	YKR081C	YNL144C	P53907	740 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPF2	YKR081C	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RPF2	YKR081C	PDR8	Q06149	701 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPF2	YKR081C	NYV1	Q12255	253 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPF2	YKR081C	ATO2	P32907	282 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPF2	YKR081C	OCT1	P35999	772 aa		4.67	□□□□□ -1.66

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 41.1 ms