RNA–Protein interactions for RNA: YJL038C

LOH1, Transcript of Protein involved in outer spore wall assembly, yeast

Gene LOH1, Length 660 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LOH1	YJL038C	YHL049C	P38722	271 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	TDA3	P38758	523 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	YEL075C	P39972	122 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	YER189W	P40104	122 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	YTA12	P40341	825 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	RAD26	P40352	1085 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	YNL320W	P42840	284 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	YFL064C	P43540	174 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	SAD1	P43589	448 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	TIM54	P47045	478 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	RPC17	P47076	161 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	CPR7	P47103	393 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	SGM1	P47166	707 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	PPM1	Q04081	328 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	YDR222W	Q04925	415 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	ENB1	Q08299	606 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	AIM41	Q12032	185 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	UPC2	Q12151	913 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	TRM11	Q12463	433 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	KIN82	P25341	720 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	SWI3	P32591	825 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	GYP6	P32806	458 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	NFU1	P32860	256 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	TIM23	P32897	222 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	VID24	P38263	362 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	HIS2	P38635	335 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	ASG1	P40467	964 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	YJR079W	P47126	109 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	CUL3	P53202	744 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	TRS130	Q03660	1102 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	TDA9	Q04545	1251 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	STE23	Q06010	1027 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	MAS2	P11914	482 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	RRT12	P25381	491 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	AFR1	P33304	620 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	STE13	P33894	931 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	CHS7	P38843	316 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	SIT1	P39980	628 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	FTR1	P40088	404 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.56	□□□□□ -1.68	not detected
LOH1	YJL038C	PHO86	P46956	311 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	NMD5	P46970	1048 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	DAS1	P47005	663 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	YGR111W	P53265	400 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	MRS2	Q01926	470 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	OMS1	Q06668	471 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	SHS1	Q07657	551 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	GUP2	Q08929	609 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	YLR125W	Q12138	136 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	LAS17	Q12446	633 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	ZPS1	Q12512	249 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	ECM3	Q99252	613 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	GPI10	P30777	616 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	DEP1	P31385	405 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	THI4	P32318	326 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	DBF4	P32325	704 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	DPH2	P32461	534 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	RPD3	P32561	433 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	TMT1	P32643	299 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	YBR284W	P38150	797 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	FUI1	P38196	639 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	SAK1	P38990	1142 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	SPC72	P39723	622 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	ALR2	P43553	858 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	ZAP1	P47043	880 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	SHE10	P53075	577 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	MDR1	P53258	950 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	ATG16	Q03818	150 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.2 ms